New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 831591 | 72 (1.220) | 4 (0.070) | 4/250 | NT | 5.3% | coding (865/1515 nt) | PP_0715 | outer membrane efflux protein |
? | NC_002947 | = 831649 | 74 (1.280) | coding (923/1515 nt) | PP_0715 | outer membrane efflux protein |
CCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGACCTGGCGGCTGGCCCAAGCCTGATCTGGAACCCGTTCGACTATGGCCGGCG > NC_002947/831507‑831790 | ccGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTggcc < 4:68753/147‑1 (MQ=255) gCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTggccgagg < 3:26024/149‑1 (MQ=255) cTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTggccgaggccga > 4:54575/1‑149 (MQ=255) gAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGAt < 8:20455/147‑1 (MQ=255) ggCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCttt < 5:199777/149‑1 (MQ=255) gCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTa > 5:139733/1‑149 (MQ=255) aTGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGTGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAg > 4:175684/1‑149 (MQ=255) aaCTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGc < 2:88336/149‑1 (MQ=255) aCTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCt < 6:123494/149‑1 (MQ=255) cccTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTg < 6:245698/147‑1 (MQ=255) cccTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTg < 6:139733/147‑1 (MQ=255) cccTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTg < 3:54575/147‑1 (MQ=255) cTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCg > 6:363738/1‑149 (MQ=255) ccAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAg > 4:121609/1‑148 (MQ=255) cAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTa > 5:5238/1‑149 (MQ=255) ccGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCg < 8:750/149‑1 (MQ=255) gCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTg < 8:171260/149‑1 (MQ=255) aGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGa < 3:121609/149‑1 (MQ=255) aGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGa > 2:13343/1‑149 (MQ=255) ttGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGATATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAg < 8:4460/122‑1 (MQ=255) ttGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAg > 7:4460/1‑122 (MQ=255) aGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTggccg < 1:360890/93‑1 (MQ=255) aGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTggccg > 2:360890/1‑93 (MQ=255) ggATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTAt < 1:283832/149‑1 (MQ=255) gATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATc < 2:275724/149‑1 (MQ=255) gTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGc > 4:322716/1‑149 (MQ=255) aCCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCa < 7:34362/122‑1 (MQ=255) aCCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCa > 8:34362/1‑122 (MQ=255) aCCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGcc > 3:275985/1‑148 (MQ=255) aCCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGCACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGcc > 1:214904/1‑148 (MQ=255) ccTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGAAGTGGCGGCGCAGTCGGCGGTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTGTATCCAGAGCTGAGCTTGGTCGGGAGTGTCGGGTGGAGCTTCGTATccgggat > 4:272347/1‑143 (MQ=255) cTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAat > 5:150086/1‑149 (MQ=255) gCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATc > 5:12464/1‑97 (MQ=255) gCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATc < 6:12464/97‑1 (MQ=255) ccAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAatca < 6:150086/148‑1 (MQ=255) ccAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAatc < 1:13343/147‑1 (MQ=255) gCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTg > 5:346454/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAatcatc < 6:24756/146‑1 (MQ=255) ccTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAatcatc > 5:24756/1‑146 (MQ=255) ccTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGc < 4:275985/149‑1 (MQ=255) tgctgcAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTg > 2:219667/1‑121 (MQ=255) tgctgcAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTg < 1:219667/121‑1 (MQ=255) tgctgcAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGccc > 7:349890/1‑149 (MQ=255) tgcAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTggcgctgcagcaggctggcaggtacatcctgcaacactgcccggttgggcaagggcagttggccatgcccggcctccagctg < 7:24830‑M2/149‑83 (MQ=255) gcAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGaca > 5:84087/1‑149 (MQ=255) gcAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGaca > 7:350248/1‑149 (MQ=255) aGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTggcgctgcagcaggctggcaggtacatcctgcaacactgcccggttgggcaagggcagttggccatgcccggcctccagctgcgg < 3:278896‑M2/149‑86 (MQ=255) cgccgcCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCtt > 5:91443/1‑149 (MQ=255) ccgccCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCg < 6:5238/149‑1 (MQ=255) cccGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGAcc > 4:328818/1‑149 (MQ=255) aCATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGACCTggcg > 3:34686/1‑149 (MQ=255) cATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTggcgctgcagcaggctggcaggtacatcctgcaacactgcccggttgggcaagggcagttggccatgcccggcctccagctgcggcagcggcccgggc > 4:278896‑M2/1‑51 (MQ=255) cATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGACCTggcgg < 3:322716/149‑1 (MQ=255) tCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGACCTGGCGGCt > 8:65035/1‑149 (MQ=255) cgcgCCGCCGAGCTGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGACCTGGCGGCTg < 5:307159/148‑1 (MQ=255) cgccgcCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTggcgctgcagcaggctggcaggtacatcctgcaacactgcccggttgggcaagggcagttggccatgcccggcctccagctgcggcagcggcccgggcgggcgg > 8:24830‑M2/1‑45 (MQ=255) cgccgAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGcc > 3:290609/1‑120 (MQ=255) cgccgAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGcc < 4:290609/120‑1 (MQ=255) ccgAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGACCTGGCGGCTGGCCCAAGc < 2:214904/149‑1 (MQ=255) aGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGACCTGGCGGCTGGCCCAAGCCTg < 4:87594/149‑1 (MQ=255) aGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGACCTGGCGGCTGGCCCAAGCCTg < 6:91443/149‑1 (MQ=255) aGCAGGCAGGGGCGGCGCAGGCGGCGCGGGGCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCCCAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTCTCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGACCTGGCGGCTGGCCCAAGCCTg < 4:13/149‑1 (MQ=255) caggcagTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGACCTGGCGGCTGGCCCAAGCCTGAt < 5:363738/149‑1 (MQ=255) caggcagTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGACCTGGCGGCTGGCCCAAGCCTGAt < 8:49669/149‑1 (MQ=255) ggcagTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGACCTGGCGGCTGGCCCAAGCCTGATCt < 8:349890/149‑1 (MQ=255) cagTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGACCTGGCGGCTGGCCCAAGCCTGATCTgg < 6:307942/149‑1 (MQ=255) tGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGACCTGGCGGCTGGCCCAAGCCTGATCTGGAAc < 6:84087/149‑1 (MQ=255) ggcggcGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGACCTCGCGGCTGGCACAAGCCTGATCTGGaaac > 6:385785/1‑147 (MQ=255) gcggcgCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGACCTGGCGGCTGGCCCAAGCCTGATCTGGAAccc > 5:262224/1‑149 (MQ=255) cgcAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGAGCTGGCGGCTGGCCCAAGCCTGATCTGGAACCCGTTc < 5:385785/149‑1 (MQ=255) cgcAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGACCTGGCGGCTGGCCCAAGCCTGATCTGGAACCCGTTc < 8:350248/149‑1 (MQ=255) gcAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGaca > 6:76443/1‑104 (MQ=255) gcAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGaca < 5:76443/104‑1 (MQ=255) cAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGACCTGGCGGCTGGCCCAAGCCTGATCTGGAACCCGTTCGa < 3:328818/149‑1 (MQ=255) tCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGACCTGGCGGCTGGCCCAAGCCTGATCTTGAACCCTTTGGACTa > 6:264552/1‑149 (MQ=255) ggCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGACCTGGCGGCTGGCCCAAGCCTGATCTGGAACCCGTTCGACTATg < 3:175684/149‑1 (MQ=255) gcgcTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGACCTGGCGGCTGGCCCAAGCCTGATCTGGAACCCGTTCGACTATgg > 5:235906/1‑149 (MQ=255) gcTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGACCTGGCGGCTGGCCCAAGCCTGATCTGGAACCCGTTCGACTATGGcc > 2:179341/1‑149 (MQ=255) gcTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGACCTGGCGGCTGGCCCAAGCCTGATCTGGAACCCGTTCGACTATGGcc > 1:43266/1‑149 (MQ=255) ggggcGGGGTGGCCGCGGCCGATCTTTAACCACACCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCCCGACCTTCCTACCGGCCAATCAGCTGCCCCACACCTTCGACCTGGCGGCGGGCCCAAGCCTGATCTGCAACCCGTTCGACTATGGCCgg < 6:262224/145‑1 (MQ=255) ggTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGACCTGGCGGCTGGCCCAAGCCTGATCTGGAACCCGTTCGACTATGGCCGgc > 1:164004/1‑149 (MQ=255) gTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGACCTGGCGGCTGGCCCAAGCCTGATCTGGAACCCGTTCGACTATGGCCGgcg < 2:164004/149‑1 (MQ=255) | CCGCAGCTGGAGGCCGGGCATGGCCAACTGCCCTTGCCCAACCGGGCAGTGTTGCAGGATGTACCTGCCAGCCTGCTGCAGCGCCGCCCGGACATCCGCGCCGCCGAGCAGGCAGTGGCGGCGCAGTCGGCGCTGGTCGGGGTGGCCGAGGCCGATCTTTATCCACAGCTGAGCTTGCTCGGCAGTATCGGCTGGACCTTCCTATCGGCCAATCATCTGCCCGACACCTTCGACCTGGCGGCTGGCCCAAGCCTGATCTGGAACCCGTTCGACTATGGCCGGCG > NC_002947/831507‑831790 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |