New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 973460 = | 41 (0.690) | 4 (0.070) | 4/236 | NT | 9.8% | coding (1752/1863 nt) | secD | protein translocase subunit SecD |
? | NC_002947 | 973515 = | 36 (0.660) | coding (1807/1863 nt) | secD | protein translocase subunit SecD |
AAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGTTGGTCGGCGGCATCCTGTTTGCCATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGTCAACCTGACCTGTGGCGGGCGTGACATCAAGAAGCTGTGGGTTTGAGGGAGCTGCGATGAAAACCATCAATTTCATGGGTGTG > NC_002947/973312‑973608 | gctgaacagcgccaacacggtgaggagcacggtgacggcgaacgcgacattgcgcacacccatgaaattgatggttttcatcgcagctccctcaaacccacagcttcttgatgtcacgcccgccacaggtcaggttgacaaatgcacgg > 4:281847‑M1/149‑149 (MQ=255) gaacagcgccaacacggtgaggagcacggtgacggcgaacgcgacattgcgcacacccatgaaattgatgcttttcatcccagatccctcaaacccacagcttcttgatgtcacgcccgccacaggtcaggttgaccaatgcacgGGt < 5:319047‑M1/3‑1 (MQ=255) cgccaacacggtgaggagcacggtgacggcgaacgcgacattgcgcacacccatgaaattgatggttttcatcgcagctccctcaaacccacagcttcttgatgtcacgcccgccacaggtcaggttgaccaatgcacgGGTCACCATg > 2:47138‑M1/140‑149 (MQ=255) tGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGTTGGTCGGCGGCATCCTGTTTGCCATGGGTACCGGCCCGGTTAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCggg < 1:96194/149‑1 (MQ=255) tCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGTTGGTCGGCGGCATCCTGTTTGCCATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGa < 2:90118/148‑1 (MQ=255) ggagcacggtgacggcgaacgcgacattgcgcacacccatgaaattgatggttttcatcgcagctacctcaaacccacagcttcttcatgtcacgcccgccacaggtcaggttgaccaatgcacgGGACACAATGTCACTCGGGAttt < 8:224064‑M1/23‑1 (MQ=255) gTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGTTGGTCGGCGGCATCCTGTTTGCCATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGAtttt < 8:339816/149‑1 (MQ=255) tGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGTTGGTCGGCGGCATCCTGTTTGCCATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTc < 3:154789/149‑1 (MQ=255) gAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGTTGGTCGGCGGCATCCTGTTTGCCATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCAccgc > 1:18179/1‑149 (MQ=255) ttCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGTTGGTCGGCGGCATCCTGTTTGCCATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCAt > 3:301074/1‑149 (MQ=255) ttCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGTTGGTCGGCGGCATCCTGTTTGCCATGGGTACCGGACCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCACGGGATATTCACATCGATGTTCACCGCCGTCAt > 8:357694/1‑149 (MQ=255) tCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGTTGGTCGGCGGCATCCTGTTTGCCATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGa > 5:298506/1‑149 (MQ=255) cacacgcatgaaattgatggttttcatcgcagctccctcaaacccacagcttcttgatgtcactcccgccacaggtcaggttgaccaatgcacgGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGAcc > 7:224064‑M1/95‑149 (MQ=255) cTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGTTGGTCGGCGGCATCCTGTTTGCCATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTg > 5:77332/1‑149 (MQ=255) ggCAATCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGTTGGTCGGCGGCATCCTGTTTGCCATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTg < 3:143209/148‑1 (MQ=255) gCAATCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGTTGGTCGGCGGCATCCTGTTTGCCATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGt < 2:18179/149‑1 (MQ=255) attgatggttttcatcgcagctccctcaaacccacagcttcttgatgtcacgcccgccacaggtcaggttgaccaatgcacgGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCAt < 3:6650‑M1/48‑1 (MQ=255) attgatggttttcatcgcagctccctcaaacccacagcttcttgatgtcacgcccgccacaggtcaggttgaccaatgcacgGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCAt > 4:6650‑M1/83‑130 (MQ=255) aTCGTCGACGCCAACCTGACCTCCCTGTTGGTCGGCGGCATCCTGTTTGCCATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCACTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGTCaa < 7:357694/149‑1 (MQ=255) aTCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGTTGGTCGGCGGCATCCTGTTTGCCATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGTCaa < 4:301074/149‑1 (MQ=255) cTGACCACCCTGTTGGTCGGCGGCATCCTGTTTGCCATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGTCAACCTGACCTGTggcgg > 4:369376/1‑149 (MQ=255) gACCACCCTGTTGGTCGGCGGCATCCTGTTTGCCATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTc < 7:116686/79‑1 (MQ=255) gACCACCCTGTTGGTCGGCGGCATCCTGTTTGCCATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCAAGTCCCTc > 8:116686/1‑79 (MQ=255) cccTGTTGGTCGGCGGCATCCTGTTTGCCATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGTCAACCTGACCTGTGGCGGGCGTGAc < 2:38967/149‑1 (MQ=255) ccTGTTGGTCGGCGGCATCCTGTTTGCCATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGTCAACCTGACCTGTGGCGGGCGTGACa > 5:127808/1‑149 (MQ=255) tGTTGGTCGGCGGCATCCTGTTTGCCATGGGTACAGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGTCAACCTGACGTGTGGCGGGCGTGACAt > 6:319047/1‑148 (MQ=255) ttGGTCGGCGGCATCCTGTTTGCCATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGTCAACCTGACCTGTGGCGGGCGTGACATCa < 6:127808/148‑1 (MQ=255) tCCTGTTTGCCATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGTCAACCTGACCTGTGGCGGGCGTGACATCAAGAAGCTGTGGGtt > 5:201766/1‑149 (MQ=255) tGTTTGCCATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGTCAACCTGACCTGTggc < 2:235473/119‑1 (MQ=255) tGTTTGCCATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGTCAACCTGACCTGTggc > 1:235473/1‑119 (MQ=255) gTTTGCCATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCATCATGGTGACCCGTGCATTGGTCAACCTGACCTGTGGCGGGCGTGACATCaa < 6:87815/132‑1 (MQ=255) gTTTGCCATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCATCATGGTGACCCGTGCATTGGTCAACCTGACCTGTGGCGGGCGTGACATCaa > 5:87815/1‑132 (MQ=255) tGCCATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGTCAac > 4:374174/1‑103 (MQ=255) tGCCATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGTCAac < 3:374174/103‑1 (MQ=255) ccATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGTCAACCTGACCTGTGGCGGGCGTGACATCAAGAAGCTGTGGGTTTGAGGGAGc > 7:333609/1‑149 (MQ=255) aTGGGTACCGGCCCGTTCTAAGGCTTTGGGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCTCCGCCGTCATGGTGTCCCGTTCATTGGTCAACCTGACCTGTGGCTGGCGTGACATCAAGAAGCTGTGTGTTTGAGGGAGCTg < 5:197723/149‑1 (MQ=255) ggTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGTCAACCTGACCTGTGGCGGGCGt > 8:245826/1‑114 (MQ=255) ggTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGTCAACCTGACCTGTGGCGGGCGt < 7:245826/114‑1 (MQ=255) cGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGTCAACCTGACCTGTGGCGGGCGTGACATCAAGAAGCTGTGGGTTTGAGGGAGCTGCGATGaa > 3:252486/1‑148 (MQ=255) gCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGTGAacctgac > 6:130121/1‑94 (MQ=255) gCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGTCAacctgac < 5:130121/94‑1 (MQ=255) gCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGTCAACCTGACCTGTGGCGGGCGTGACATCAAGAAGCTGTGGGTTTGAGGGAGCTGCGATGAAAAc > 6:363230/1‑149 (MQ=255) cGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGTCAACCTGACCTGTGGCGGGCGTGACATCAAGAAGCTGTGGGTTTGAGGGAGCTGGGATGAAAACCAt > 8:60216/1‑149 (MQ=255) ggTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGTCAACCTGACCTGTGGCGGGCGTGACATCAAGAAGCTGTGGGTTTGAGGGAGCTGCGATGAAAACCATc < 3:369376/149‑1 (MQ=255) aGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCAt > 7:171352/1‑57 (MQ=255) aGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCAt < 8:171352/57‑1 (MQ=255) ggCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGTCAACCTGACCTGTGGCGGGCGTGACATCAAGAAGCTGTGGGTTTGAGGGAGCTGCGATGAAAACCATCAATTTCa < 6:201766/149‑1 (MQ=255) cTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGTCAACCTGACCTGTGGCGGGCGTGACATCAAGAAGCTGTGGGTTTGAGGGAGCTGCGATGAAAACCATCAATTTCATg < 6:77332/149‑1 (MQ=255) tttGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGt > 4:243204/1‑63 (MQ=255) tttGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGt < 3:243204/63‑1 (MQ=255) GGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGTCAACCTGACCTGTGGCGGGCGTGACATCAAGAAGCTGTGGGTTTGAGGGAGCTGCGATGGAAACCATCAATTTCATGGGtgtg < 1:214096‑M1/149‑1 (MQ=255) | AAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGTTGGTCGGCGGCATCCTGTTTGCCATGGGTACCGGCCCGGTCAAAGGCTTTGCGGTCACCATGTCCCTCGGGATTTTCACCTCGATGTTCACCGCCGTCATGGTGACCCGTGCATTGGTCAACCTGACCTGTGGCGGGCGTGACATCAAGAAGCTGTGGGTTTGAGGGAGCTGCGATGAAAACCATCAATTTCATGGGTGTG > NC_002947/973312‑973608 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |