| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1572594 | 57 (0.960) | 3 (0.050) | 3/240 | NT | 5.7% | coding (716/1353 nt) | pcaB | 3‑carboxy‑cis,cis‑muconate cycloisomerase |
| ? | NC_002947 | = 1572655 | 45 (0.810) | coding (777/1353 nt) | pcaB | 3‑carboxy‑cis,cis‑muconate cycloisomerase | |||||
TGCAGTTCGGCGGTGCCTCGGGCAGCCTGGCGGCGCTGGGCAGCAAGGCGATGCCGGTGGCCGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGCAAGGGTGGTTCTTCG‑ACCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCC > NC_002947/1572447‑1572742 | tGCAGTTCGGCGGTGACTCGGGCAGCCTGGCGGCGCTGGGCAGCAAGGCGATGCCGGTGGCCGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTa > 6:234556/1‑149 (MQ=255) gTTCGGCGGTGCCTCGGGCAGCCTGGCGGCGCTGGGCAGCAAGGCGATGCCGGTGGCCGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTgg > 5:173397/1‑149 (MQ=255) cggcggTGCCTCGGGCAGCCTGGCGGCGCTGGGCAGCAAGGCGATGCCGGTGGCCGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGc < 6:173397/148‑1 (MQ=255) cggTGCCTCGGGCAGCCTGGCGGCGCTGGGCAGCAAGGCGATGCCGGTGGCCGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTgg < 3:103080/149‑1 (MQ=255) cggTGCCGCGGGCAGCCTGGCGGCGCTGGGCAGCAAGGCGATGCCGGTGGCCGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTgg < 8:123451/149‑1 (MQ=255) gTGCCTCGGGCAGCCTGGCGGCGCTGGGCAGCAAGGCGATGCCGGTGGCCGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGtt > 2:90979/1‑149 (MQ=255) ggCCTCGGGCATGCTTGGGGCGCTGGGGATCAATGGGTTGGCGGGTGCCGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTg < 3:255755/148‑1 (MQ=255) cTCGGGCAGCCTGGCGGCGCTGGGCAGCAAGGCGATGCCGGTGGCCGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCg < 8:74433/149‑1 (MQ=255) gCAGCCTGGCGGCGCTGGGCAGCAAGGCGATGCCGGTGGCCGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGc < 8:102569/149‑1 (MQ=255) ccTGGCGGCGCTGGGCAGCAAGGCGATGCCGGTGGCCGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTgg < 4:252178/149‑1 (MQ=255) ggcgCTGGGCAGCAAGGCGATGCCGGTGGCCGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGt > 4:193287/1‑149 (MQ=255) cgcTGGGCAGCAAGGCGATGCCGGTGGCCGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGc > 7:334925/1‑143 (MQ=255) cgcTGGGCAGCAAGGCGATGCCGGTGGCCGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGc < 8:334925/143‑1 (MQ=255) cgcTGGGCAGCAAGGCGATGCCGGTGGCCGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTc < 5:26046/149‑1 (MQ=255) ggCAGCAAGGCGATGCCGGTGGCCGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCGTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGcc < 8:257704/148‑1 (MQ=255) gcagcaAGGCGATGCCGGTGGCCGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGt < 2:341732/149‑1 (MQ=255) cagcaAGGCGATGCCGGTGGCCGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGt > 3:367025/1‑148 (MQ=255) aaGGCGATGCCGGTGGCCGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGc < 5:272266/132‑1 (MQ=255) aaGGCGATGCCGGTGGCCGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGc > 6:272266/1‑132 (MQ=255) aaGGCGATGCCGGTGGCCGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGata > 4:170762/1‑148 (MQ=255) ggCGATGCCGGTGGCCGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGATCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGT < 2:352955‑M1/102‑1 (MQ=255) ggCGATGCCGGTGGCCGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGT > 1:352955‑M1/1‑102 (MQ=255) tGCCGGTGGCCGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTg < 6:182707/149‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGc < 8:10830/149‑1 (MQ=255) ccGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCaa < 6:384018/149‑1 (MQ=255) ccGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCa > 8:209175/1‑148 (MQ=255) cGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCAAGCTGAtatcac < 6:158948/149‑6 (MQ=255) gcTGGCCGAACAGCTGAAGCTGACCCTGGCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTttgcatcagcaagctgatatcacggccgaacttgcccaggctgccggcaaccaggcccaataccgagg < 7:67347‑M1/149‑69 (MQ=255) gCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGCCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCggg < 1:269648/149‑1 (MQ=255) ccGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCgggg < 3:170762/149‑1 (MQ=255) ccGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATCGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCgggg < 2:130201/149‑1 (MQ=255) cGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCgggg > 2:203886/1‑148 (MQ=255) cAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGgt < 3:193287/149‑1 (MQ=255) gCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGgtgt < 4:367025/149‑1 (MQ=255) aaGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGttt > 5:270615/1‑147 (MQ=255) aaGCTGACACTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGAACGACTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCAGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACAGAGGCGGGGCAGGTGttt > 5:101051/1‑147 (MQ=255) cTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTGGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGAt < 6:100924/119‑1 (MQ=255) cccTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAATCCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCt < 5:234556/149‑1 (MQ=255) ccTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGa < 2:372727/141‑1 (MQ=255) ccTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGa > 1:372727/1‑141 (MQ=255) ccTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTg > 5:115790/1‑149 (MQ=255) gAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATCCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGACTTCTGCGCCggg > 6:97480/1‑149 (MQ=255) cccTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCTGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAg < 1:225932/92‑1 (MQ=255) cccTGGCACACACAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGACTGGGCAAGTTAGGCCGTGATATCAg > 2:225932/1‑92 (MQ=255) cTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCggg > 2:363378/1‑114 (MQ=255) cTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCggg < 1:363378/114‑1 (MQ=255) gCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGCAAGGGTGGtt < 7:209175/149‑1 (MQ=255) gCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGCAAGGGTGGtt > 3:258647/1‑149 (MQ=255) acacCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTAGCTGATGCAAACCGCGGCGGTGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGCAAGGGTGGttct > 3:211227/1‑149 (MQ=255) cacCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGCAAGGGTGGttctt < 6:270615/149‑1 (MQ=255) acCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGCAAGGGTGGttct > 8:290526/1‑147 (MQ=255) acCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGCAAGGGTGGttct < 7:290526/147‑1 (MQ=255) ccAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTttgcatcagcaagctgatatcacggccgaacttgcccaggctgccggcaaccaggcccaataccgaggc > 5:281550‑M1/1‑33 (MQ=255) ccAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTttgcatcagcaagctgatatcacggccgaacttgcccaggctgccggcaaccaggcccaataccgaggc < 6:281550‑M1/102‑70 (MQ=255) ccAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGa > 4:271045/1‑117 (MQ=255) ccAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGa < 3:271045/117‑1 (MQ=255) gACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGCAAGGGTGGTTCTTCG‑ACCATGc > 4:367222/1‑148 (MQ=255) ggtggATGTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTGGCCGGCAGCCTGGTCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGCAAGGGTGGTTCTTCG‑ACCATGCCACACAAgc < 4:211227/149‑1 (MQ=255) gtggAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTg > 5:88619/1‑42 (MQ=255) gtggAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTg < 6:88619/42‑1 (MQ=255) gtggAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGCAAGGGTGGTTCTTCG‑ACCATGCCACACAAgcg < 4:258647/149‑1 (MQ=255) tttGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGCAAGGGTGGTTCTTCG‑ACCATGCCACACAAGCGCAAccc > 3:133109/1‑149 (MQ=255) gCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAaccgaggcaaactccaccaggcggtcgcgctgg > 5:281550‑M2/1‑69 (MQ=255) gCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAaccgaggcaaactccaccaggcggtcgcgctgg < 6:281550‑M2/102‑34 (MQ=255) ccTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAaccgaggcaaactccaccaggcggtcgcgctgggtgtgccagggctgctcggccagggtcagcttcagctgttcggccagc < 7:67347‑M2/149‑82 (MQ=255) cTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGCAAGGGTGGTTCTTCGCACCATGCCACACAAGCGCAACCCggtg < 1:203886/149‑1 (MQ=255) cTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAACTTCGGCCGTGATATCACCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGACGTGTGTGAGCCTTCTGCGCCGGGCAAGGGTGGATCTTCG‑ACCATGCCACACACGCGCACCCCggagg > 4:63717/1‑149 (MQ=255) tCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGCAAGGGTGGTTCTTCG‑ACCATGCCACACAAGCGCAACCCggtggg > 5:10575/1‑149 (MQ=255) tATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGCAAGGGTGGTTCTTCG‑ACCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTgcc < 1:90979/149‑1 (MQ=255) | TGCAGTTCGGCGGTGCCTCGGGCAGCCTGGCGGCGCTGGGCAGCAAGGCGATGCCGGTGGCCGAAGCGCTGGCCGAACAGCTCAAGCTGACCCTGCCCGAGCAGCCCTGGCACACCCAGCGCGACCGCCTGGTGGAGTTTGCCTCGGTATTGGGCCTGGTTGCCGGCAGCCTGGGCAAGTTCGGCCGTGATATCAGCTTGCTGATGCAAACCGAGGCGGGGGAGGTGTTTGAGCCTTCTGCGCCGGGCAAGGGTGGTTCTTCG‑ACCATGCCACACAAGCGCAACCCGGTGGGTGCC > NC_002947/1572447‑1572742 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |