New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2447276 | 38 (0.640) | 3 (0.050) | 3/244 | NT | 6.8% | coding (665/1011 nt) | nagZ | beta‑N‑acetylglucosaminidase |
? | NC_002947 | = 2447298 | 46 (0.820) | coding (687/1011 nt) | nagZ | beta‑N‑acetylglucosaminidase |
CGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGCCGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGGCGGCGCTGAGCGCC > NC_002947/2447130‑2447424 | cGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGCCGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGc > 2:178806/1‑149 (MQ=255) aaGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGCCGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGccc > 2:239710/1‑149 (MQ=255) aaGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGCCGTTTACACGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGccc > 5:314190/1‑149 (MQ=255) gCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGCCGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGc > 3:366719/1‑149 (MQ=255) ccGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGCCGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCt > 7:67798/1‑149 (MQ=255) ccGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGCCGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCt < 4:68581/149‑1 (MQ=255) cGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGCCGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTg > 2:319463/1‑149 (MQ=255) aTTCGCACGAAGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGCCGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGc < 1:319463/149‑1 (MQ=255) aCGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGCCGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTcg < 3:242748/149‑1 (MQ=255) gTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGCCGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTcgcg > 2:29905/1‑149 (MQ=255) aTCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGCCGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTtg < 4:318962‑M2/149‑3 (MQ=255) cACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGCCGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTtggttg < 2:261406‑M2/148‑7 (MQ=255) cTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGCCGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAg < 1:178806/149‑1 (MQ=255) atgaACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGCCGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAacgccgcgagaagccagcgggctggttgtcaacc < 3:376573‑M1/149‑35 (MQ=255) aaCGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGCCGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATc < 3:318962/149‑1 (MQ=255) aCGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGCCGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATcc < 1:261406/149‑1 (MQ=255) ccTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGCCGTTTACCCGCCTGAGAGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTg < 1:363295/149‑1 (MQ=255) tGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGCCGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGAGGCAGTGATGCCGGCGCTTGTCATCTACCCGCATGTTGACAAACAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGc > 1:343674/1‑149 (MQ=255) ccAGTCCGACCTGGTGCCGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAacgccgcgagaagccagcgggctggttgt > 6:196504‑M1/1‑90 (MQ=255) ccAGTCCGACCTGGTGCCGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAacgccgcgagaagccagcgggctggttgt < 5:196504‑M1/119‑30 (MQ=255) cAGTCCGACCTGGTGCCGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAAGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGa > 2:362367/1‑149 (MQ=255) tCCGACCTGGTGCCGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATgg < 7:190502/149‑1 (MQ=255) cGACCTGGTGCCGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATgggg < 6:314190/149‑1 (MQ=255) cGACCTGGTGCCGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATgggg < 8:67798/149‑1 (MQ=255) aCCTGGTGCCGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGt > 5:367104/1‑148 (MQ=255) gTGCCGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGAtttt > 1:192587/1‑149 (MQ=255) ccGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAg < 2:242259/149‑1 (MQ=255) tACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGtgat < 1:239710/148‑1 (MQ=255) ccTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGGGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGt < 6:389987/149‑1 (MQ=255) tGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATgg > 5:235438/1‑149 (MQ=255) tGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGAAGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATg < 1:29905/148‑1 (MQ=255) gcggcAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGGGATTGTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCa > 8:291922/1‑149 (MQ=255) cggcAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCAt < 1:148177/149‑1 (MQ=255) cggcAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCAt < 6:367104/149‑1 (MQ=255) cGGCGCATGTCTTCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGAc > 8:82524/1‑149 (MQ=255) cGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGAc < 4:366719/149‑1 (MQ=255) cGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGAc > 3:31093/1‑149 (MQ=255) cATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGAtt < 7:148526/94‑1 (MQ=255) cATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGAtt > 8:148526/1‑94 (MQ=255) tCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCg > 5:209679/1‑148 (MQ=255) ccGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATc > 3:139678/1‑147 (MQ=255) cGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAg > 5:80476/1‑149 (MQ=255) cGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAg < 6:209679/149‑1 (MQ=255) cAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAggc < 2:192587/149‑1 (MQ=255) ggTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTtggttgtcaacctgcgggtagatgacatgcgccggcatcactgccgccagttgcccactcaggcgggtaaacggcaccaggtcggactggcgcagttgttccaggctgcgttcat < 3:376573‑M2/149‑116 (MQ=255) gACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGGCGGCGCt > 7:228469/1‑149 (MQ=255) aCAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTtggttgtcaacctgcgggtagatgacatgcgccggcatcactgccgccagttgcccactcaggcgggtaaacggcaccaggtcggactgg > 6:196504‑M2/1‑29 (MQ=255) aCAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTtggttgtcaacctgcgggtagatgacatgcgccggcatcactgccgccagttgcccactcaggcgggtaaacggcaccaggtcggactgg < 5:196504‑M2/119‑91 (MQ=255) caaccaacgccgcgagaagccagcgggctggttgtcaacctgcgggtagatgacatgcgccggcatcactgccgccagttgcccactcaggcgggtaaacggcaccaggtcggactggcgcagttgttccaggctgcgttcatcagtg < 2:261406‑M1/148‑143 (MQ=255) cAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGGCGGCGCTGa < 1:365956/149‑1 (MQ=255) aCCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGGCGGCGCTGAgc > 2:258183/1‑149 (MQ=255) ccAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGGCGGCGCTGAgcg > 8:85779/1‑149 (MQ=255) ccAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGGCGGCGCTGAgcg > 4:171463/1‑149 (MQ=255) ccAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTAGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAg > 7:186921/1‑126 (MQ=255) ccAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTAGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAg < 8:186921/126‑1 (MQ=255) caacgccgcgagaagccagcgggctggttgtcaacctgcgggtagatgacatgcgccggcatcactgccgccagttgcccactcaggcgggtaaacggcaccaggtcggactggcgcagttgttccaggctgcgttcatcagtggggat < 4:318962‑M1/149‑148 (MQ=255) cAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGGCGGCGCTGAgcgc < 6:235438/149‑1 (MQ=255) cAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGGCGGCGCTGAgcgc > 4:81720/1‑149 (MQ=255) aGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGGCGGCGCTGAGCGcc < 1:258183/149‑1 (MQ=255) | CGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGCCGTTTACCCGCCTGAGTGGGCAACTGGCGGCAGTGATGCCGGCGCATGTCATCTACCCGCAGGTTGACAACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGGCGGCGCTGAGCGCC > NC_002947/2447130‑2447424 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |