| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2497418 = | 62 (1.050) | 6 (0.110) | 6/240 | NT | 10.0% | coding (644/1125 nt) | PP_2192 | ECF family RNA polymerase sigma‑70 factor/transmembrane sensor protein |
| ? | NC_002947 | 2497457 = | 50 (0.900) | coding (683/1125 nt) | PP_2192 | ECF family RNA polymerase sigma‑70 factor/transmembrane sensor protein | |||||
CTGAAGCAGGCGGGTGTGGCGGCTTCGGTGGTGTTGCTGGTCGCCGCTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTGCGCGGGTGCAGGGCAATGCT > NC_002947/2497273‑2497566 | acgacgtggccatcgcgctgcacgctgaaggtggcagcattgccctgcacccgcgcaccggccgtttcgaccacaaacggacgtgaatcatcggcggtctcgaacaacgcctcacccgcatcgagtaccacacgccgttcatgctCGCt > 4:333486‑M1/146‑149 (MQ=255) tGAAGCAGGCGGGTGTGGCGGCTTCGGTGGTGTTGCTGGTCGCCGCTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCt > 8:358479/1‑148 (MQ=255) aaGCAGGCGGGTGTGGCGGCTTCGGTGGTGTTGCTGGTCGCCGCTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGaa < 1:350000/149‑1 (MQ=255) gCGGGTGTGGCGGCTTCGGTGGTGTTGCTGGTCGCCGCTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAgcgc > 2:251143/1‑149 (MQ=255) cGGGTGTGGCGGCTTCGGTGGTGTTGCTGGTCGCCGCTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGcc < 3:325801/149‑1 (MQ=255) tgGCGGCTTCGGTGGTGTTGCTGGTCGCCGCTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGcc < 7:226716/149‑1 (MQ=255) gcggcTTCGGTGGTGTTGCTGGTCGCCGCTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCt < 4:182732/148‑1 (MQ=255) ttCGGTGGTGTTGCTGGTCGCCGCTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCg > 8:187438/1‑149 (MQ=255) cGGTGGTGTTGCTGGTCGCCGCTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGt < 3:191891/148‑1 (MQ=255) gtTGCTGGTCGCCGCTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGtt > 4:248058/1‑147 (MQ=255) gCTGGTCGCCGCTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGc < 1:349278/148‑1 (MQ=255) gcattgccctgcacccgcgcaccggccgtttcgaccacaaacggacgtgaatcatcggcggtctcgaacaacgcctcacccgcatcgagtaccacacgccgttcatgctCGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGa > 4:305712‑M1/110‑149 (MQ=255) cTGGTCGCCGCTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGc > 2:362671/1‑147 (MQ=255) cTGGTCGCCGCTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGa < 6:261774/149‑1 (MQ=255) cattgccctgcacccgcgcaccggccgtttcgaccacaaacggacgtgaatcatcggcggtctcgaacaacgcctcacccgcatcgagtaccacacgccgttcatgctCGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAg > 2:129911‑M1/109‑149 (MQ=255) gccgcTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATg > 5:66808/1‑148 (MQ=255) cgcTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAAc > 1:247338/1‑149 (MQ=255) tgcacccgcgcaccggccgtttcgaccacaaacggacgtgaatcatcggcggtctcgaacaacgcctcacccgcatcgagtaccacacgccgttcatgctCGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCa > 4:25127‑M1/101‑136 (MQ=255) tgcacccgcgcaccggccgtttcgaccacaaacggacgtgaatcatcggcggtctcgaacaacgcctcacccgcatcgagtaccacacgccgttcatgctCGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCa < 3:25127‑M1/36‑1 (MQ=255) cGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGtgtg < 1:251143/149‑1 (MQ=255) gTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGcc > 4:166397/1‑110 (MQ=255) gTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGcc < 3:166397/110‑1 (MQ=255) ggCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTc > 6:366688/1‑149 (MQ=255) ggCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGCGTGGTACt < 3:248058/148‑1 (MQ=255) cagcaAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGa > 2:83158/1‑149 (MQ=255) caAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGCCGTGTGGTACTCGATGc < 6:66808/149‑1 (MQ=255) aGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACCCCGCCGTGGGCGAGCGGCCGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCgg < 3:289986/149‑1 (MQ=255) gCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCggg > 1:205525/1‑149 (MQ=255) cGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGa < 4:72403/99‑1 (MQ=255) cGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGa > 3:72403/1‑99 (MQ=255) cGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAg > 2:25098/1‑149 (MQ=255) gATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAgg > 4:116491/1‑149 (MQ=255) tgctgGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCgttg > 1:28030/1‑149 (MQ=255) ctgGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCgttgtt < 4:88086/149‑1 (MQ=255) ctgGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCgttgt < 2:28030/148‑1 (MQ=255) ggCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCgg > 3:367954/1‑134 (MQ=255) ggCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCgg < 4:367954/134‑1 (MQ=255) cGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCgaga > 3:331673/1‑149 (MQ=255) aTTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGAcc < 5:366688/149‑1 (MQ=255) ttACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGAccg > 7:321737/1‑149 (MQ=255) cacaCCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTg > 6:97930/1‑84 (MQ=255) cacaCCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTg < 5:97930/84‑1 (MQ=255) cacaCCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGc > 1:22538/1‑97 (MQ=255) cacaCCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGc < 2:22538/97‑1 (MQ=255) cacaCCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCg < 4:271479/139‑1 (MQ=255) cacaCCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCg > 3:271479/1‑139 (MQ=255) cacaCCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCga < 1:25098/149‑1 (MQ=255) cacCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTAAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCgat > 6:77098/1‑148 (MQ=255) acCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCgatga < 8:130532/149‑1 (MQ=255) gccgTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTc < 7:358479/149‑1 (MQ=255) gccgTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTc < 1:83158/149‑1 (MQ=255) tGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGt < 3:116491/149‑1 (MQ=255) ggCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTcc < 1:362671/149‑1 (MQ=255) aacgcttcacccgcatcgagtaccacacgccgttcatgctCGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGtt < 4:301129‑M1/34‑1 (MQ=255) aacgcttcacccgcatcgagtaccacacgccgttcatgctCGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGtt > 3:301129‑M1/41‑74 (MQ=255) aGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTc < 2:247338/149‑1 (MQ=255) gTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCg > 2:44220/1‑148 (MQ=255) aTTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAAc > 7:91233/1‑149 (MQ=255) ttACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACg > 1:115024/1‑149 (MQ=255) tGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTc < 5:95822/83‑1 (MQ=255) tGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTc > 6:95822/1‑83 (MQ=255) aCAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGt < 7:187438/147‑1 (MQ=255) aCAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGt < 8:256463/147‑1 (MQ=255) ggCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTGCGCGGGt > 4:324124/1‑149 (MQ=255) gCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTGCGCGGGt < 3:324124/148‑1 (MQ=255) acacGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTGCGCGGGTg > 6:42933/1‑147 (MQ=255) acacGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTGCGCGGGTg > 6:287371/1‑147 (MQ=255) cacGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTGCGCGGGTGCAg > 2:58781/1‑149 (MQ=255) acGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTGCGCGGGTGCAgg < 8:321737/149‑1 (MQ=255) cGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTGCGCGGGTGCAggg < 5:42933/149‑1 (MQ=255) gTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCgat > 7:290924/1‑99 (MQ=255) gTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCgat < 8:290924/99‑1 (MQ=255) aCGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTGCGCGGGTGCAGGGCAAtg < 1:44220/148‑1 (MQ=255) CGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGCTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTGCGCGGGTGCAGGGCAAtgct < 1:229224‑M1/149‑1 (MQ=255) | CTGAAGCAGGCGGGTGTGGCGGCTTCGGTGGTGTTGCTGGTCGCCGCTGTGGCGGGTTGGCAGCAAGCCCCGATACTGCTGGCCGATTACCACACCGCCGTGGGCGAGCGGCAGGTCATTACCCTGACAGATGGCACACGGGTGACGCTGAACAGCGCCAGTGCCTTGAGCGTGGCGTTCAGCGAGCATGAACGGCGTGTGGTACTCGATGCGGGTGAGGCGTTGTTCGAGACCGCCGATGATTCACGTCCGTTTGTGGTCGAAACGGCCGGTGCGCGGGTGCAGGGCAATGCT > NC_002947/2497273‑2497566 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |