New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3186577 | 45 (0.760) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 8.0% | coding (193/1659 nt) | actP‑II | acetate permease |
? | NC_002947 | = 3186643 | 49 (0.870) | coding (259/1659 nt) | actP‑II | acetate permease |
GGCTTCGCCTTCGCTCGACGCTGGTCAGCGTCAGCCGCTCAACCTGCATGCCATCGGCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCC > NC_002947/3186435‑3186725 | ggCTTCGCCTTCGCTCGACGCTGGTCAGCGTCAGCCGCTCAACCTGCATGCCATCGGCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTg < 2:133727/149‑1 (MQ=255) gCTTCGCCTTCGCTCGACGCTGGTCAGCGTCAGCCGCTCAACCTGCATGCCATCGGCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTgg > 8:139764/1‑149 (MQ=255) gccttcgcTCGACGCTGGTCAGCGTCAGCCGCTCAACCTGCATGCCATCGGCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCa > 5:178352/1‑149 (MQ=255) cTCGACGCTGGTCAGCGTCAGCCGCTCAACCTGCATGCCATCGGCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAggg > 5:313234/1‑149 (MQ=255) cGACGCTGGTCAGCGTCAGCCGCTCAACCTGCATGCCATCGGCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCt > 6:180632/1‑149 (MQ=255) aCGCTGGTCAGCGTCAGCCGCTCAACCTGCATGCCATCGGCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTgg < 6:178352/149‑1 (MQ=255) cGCTGGTCAGCGTCAGCCGCTCAACCTGCATGCCATCGGCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGc < 6:313234/149‑1 (MQ=255) gCTGGTCAGCGTCAGCCGCTCAACCTGCATGCCATCGGCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGtcgaggcggacatgtagtccccggc > 2:124501‑M1/1‑124 (MQ=255) tGGTCAGCGTCAGCCGCTCAACCTGCATGCCATCGGCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAg > 5:356637/1‑148 (MQ=255) ggTCAGCGTCAGCCGCTCAACCTGCATGCCATCGGCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGaa > 1:340978/1‑149 (MQ=255) gtcagcgtcagcCGCTCATCCAGCATGCCATAGCCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTAGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCAGGCAGAAc > 2:170088/1‑149 (MQ=255) gtcagcgtcagcCGCTCAACCTGCATGCCATCGGCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTggcggc > 6:119051/1‑131 (MQ=255) gtcagcgtcagcCGCTCAACCTGCATGCCATCGGCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTggcggc < 5:119051/131‑1 (MQ=255) tcagcgtcagcCGCTCAACCTGCATGCCATCGGCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTggcg > 3:215360/1‑128 (MQ=255) tcagcgtcagcCGCTCAACCTGCATGCCATCGGCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTggcg < 4:215360/128‑1 (MQ=255) tcagcCGCTCAACCTGCATGCCATCGGCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCg < 2:244385/116‑1 (MQ=255) agcCGCTCAACCTGCATGCCATCGGCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGgcg > 7:271925/1‑149 (MQ=255) gcCGCTCAACCTGCATGCCATCGGCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAggg > 4:25033/1‑129 (MQ=255) gcCGCTCAACCTGCATGCCATCGGCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAggg < 3:25033/129‑1 (MQ=255) tGCATGCCATCGGCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGAc > 8:98852/1‑149 (MQ=255) gCCATCGGCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTggcg > 1:323439/1‑103 (MQ=255) gCCATCGGCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTggcg < 2:323439/103‑1 (MQ=255) ccATCGGCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATg < 7:139764/149‑1 (MQ=255) aTCGGCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTc > 5:185341/1‑149 (MQ=255) ggCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGc < 8:77419/149‑1 (MQ=255) cATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGAcgc < 4:34565‑M2/149‑4 (MQ=255) aTGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGAcgct > 6:185341‑M2/1‑145 (MQ=255) tGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGtcgaggcggacatgtagtccccggccagcgccaggccgttctgccagccctggatgccgccaccggcgctg < 4:294816‑M1/149‑72 (MQ=255) tGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGAcgctg < 5:291558‑M2/149‑6 (MQ=255) gtgtTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGtt > 8:309579/1‑149 (MQ=255) gtgtTCGTGCTCTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGtcgaggcggacatgtagtccccggccagcgccaggccgttctgccagccctggatgccgccaccggcgctgt < 6:310351‑M1/148‑73 (MQ=255) tgtTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGtcgaggcggacatgtagtccccggccagcgccaggccgttctgccagccctggatgccgccaccggcgctgtag < 1:124501‑M1/149‑75 (MQ=255) gtTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTgg < 6:291558/149‑1 (MQ=255) ttCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAgcgc < 4:146777/74‑1 (MQ=255) ttCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTggg < 6:356637/149‑1 (MQ=255) gTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGAt > 5:232995/1‑149 (MQ=255) tCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTAGATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCa < 1:214336/144‑1 (MQ=255) tCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCa > 2:214336/1‑144 (MQ=255) gtgCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATc < 7:98852/148‑1 (MQ=255) cATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTaca > 2:36201/1‑149 (MQ=255) cATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTac < 3:34565/148‑1 (MQ=255) cTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCg > 5:178124/1‑149 (MQ=255) tggGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCat < 7:309579/149‑1 (MQ=255) ggcgCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTTGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCatggatg < 8:271925/149‑1 (MQ=255) gcgcGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCatggatgg > 4:374600/1‑149 (MQ=255) gcgTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCt < 5:180632/149‑1 (MQ=255) gCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCt > 2:190358/1‑148 (MQ=255) gCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCt > 2:334149/1‑148 (MQ=255) cgacgaCAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTa < 4:132084/115‑1 (MQ=255) cgacgaCAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTa > 3:132084/1‑115 (MQ=255) cgacgaCAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTa < 8:168473/115‑1 (MQ=255) cgacgaCAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTa > 7:168473/1‑115 (MQ=255) acAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCttt < 1:334149/149‑1 (MQ=255) ttCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATAGCTTTCTTcgc > 4:330979/1‑149 (MQ=255) cTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGAcgctgtagaagtctgtcgtcgagcgtgtgcgacgcgccgcccaccaggtgatgcacaaggtgaacagcacgaaca < 1:124501‑M2/149‑76 (MQ=255) aCAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGAcgctgtagaagtctgtcgtcgagcgtgtgcgacgcgccgcccaccaggtgatgcacaaggtgaagagcacgaacac < 6:310351‑M2/148‑77 (MQ=255) cAGCGtcgaggcggacatgtagtccccggccagcgccaggccgttctgccagccctggatgccgccaccggcgctgtagaagtctgtcgtcgagcgtgtgcgacgcgccgcccaccaggtgatgcacaaggtgaacagcacgaacacca < 5:291558‑M1/149‑145 (MQ=255) cAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGAcgctgtagaagtctgtcgtcgagcgtgtgcgacgcgccgcccaccaggtgatgcacaaggtgaacagcacgaacacca < 4:294816‑M2/149‑79 (MQ=255) aGCGtcgaggcggacatgtagtccccggccagcgccaggccgttctgccagccctggatgccgccaccggcgctgtagaagtctgtcgtcgagcgtgtgcgacgcgccgcccaccaggtgatgcacaaggtgaacagcacgaacaccat > 6:185341‑M1/1‑4 (MQ=255) gCGtcgaggcggacatgtagtccccggccagcgccaggccgttctgccagccctggatgccgccaccggcgctgtagaagtctgtcgtcgagcgtgtgcgacgcgccgcccaccaggtgatgcacaaggtgaacagcacgaacaccatg < 4:34565‑M1/149‑147 (MQ=255) gcCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGcc < 1:190358/149‑1 (MQ=255) | GGCTTCGCCTTCGCTCGACGCTGGTCAGCGTCAGCCGCTCAACCTGCATGCCATCGGCATGTTCATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGCCTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCC > NC_002947/3186435‑3186725 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |