New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3186577 | 45 (0.760) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 8.0% | coding (193/1659 nt) | actP‑II | acetate permease |
? | NC_002947 | = 3186643 | 49 (0.870) | coding (259/1659 nt) | actP‑II | acetate permease |
CATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCCGGTGTTGCTGCTGTTGATGACCGAGCGGCTGCGCAACCTGGGCCGCTTCACCTTTGCCGATA > NC_002947/3186498‑3186787 | cATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGAcgc < 4:34565‑M2/149‑4 (MQ=255) aTGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGAcgct > 6:185341‑M2/1‑145 (MQ=255) tGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGAcgctg < 5:291558‑M2/149‑6 (MQ=255) gtgtTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGtt > 8:309579/1‑149 (MQ=255) gtTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTgg < 6:291558/149‑1 (MQ=255) ttCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTggg < 6:356637/149‑1 (MQ=255) gTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGAt > 5:232995/1‑149 (MQ=255) tCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTAGATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCa < 1:214336/144‑1 (MQ=255) tCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCa > 2:214336/1‑144 (MQ=255) gtgCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATc < 7:98852/148‑1 (MQ=255) cATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTaca > 2:36201/1‑149 (MQ=255) cATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTac < 3:34565/148‑1 (MQ=255) cTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCg > 5:178124/1‑149 (MQ=255) tggGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCat < 7:309579/149‑1 (MQ=255) ggcgCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTTGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCatggatg < 8:271925/149‑1 (MQ=255) gcgcGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCatggatgg > 4:374600/1‑149 (MQ=255) gcgTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCt < 5:180632/149‑1 (MQ=255) gCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCt > 2:334149/1‑148 (MQ=255) gCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCt > 2:190358/1‑148 (MQ=255) cgacgaCAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTa > 3:132084/1‑115 (MQ=255) cgacgaCAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTa < 8:168473/115‑1 (MQ=255) cgacgaCAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTa < 4:132084/115‑1 (MQ=255) cgacgaCAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTa > 7:168473/1‑115 (MQ=255) acAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCttt < 1:334149/149‑1 (MQ=255) ttCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATAGCTTTCTTcgc > 4:330979/1‑149 (MQ=255) cTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGAcgctgtagaagtctgtcgtcgagcgtgtgcgacgcgccgcccaccaggtgatgcacaaggtgaacagcacgaaca < 1:124501‑M2/149‑76 (MQ=255) aCAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGAcgctgtagaagtctgtcgtcgagcgtgtgcgacgcgccgcccaccaggtgatgcacaaggtgaagagcacgaacac < 6:310351‑M2/148‑77 (MQ=255) cAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGAcgctgtagaagtctgtcgtcgagcgtgtgcgacgcgccgcccaccaggtgatgcacaaggtgaacagcacgaacacca < 4:294816‑M2/149‑79 (MQ=255) gcCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGcc < 1:190358/149‑1 (MQ=255) ccGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCCg < 1:36201/149‑1 (MQ=255) gTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCCGgtg > 8:125522/1‑149 (MQ=255) ggcATCCAGGGCTGGCAGAACGGCACTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCCGGTGTtgg > 7:237524/1‑148 (MQ=255) ggcATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCCGGTGTtgct < 6:178124/149‑1 (MQ=255) gcATCCAGGGCTGGGTGATCGGC‑GTGGCGCTGGGCGGGGACTACATGTCCGCGTCGAGGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCGGGCATGGTTGGCTTCATCTACCTGATCGCTTTCTTGGCGGGCTGGCCGgtg < 7:103593/143‑1 (MQ=255) gcATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCAGTTGGGCATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCCCTTTCTTCGCGTGCTGGCCGgtg > 8:103593/1‑143 (MQ=255) tCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCCGGTGTTGctgctg > 6:77289/1‑149 (MQ=255) cAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCGCCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCCGGTGTTGCTGCTGtt > 7:170729/1‑149 (MQ=255) gggCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCCGGTGTTGCTGCTGTtga < 7:125522/149‑1 (MQ=255) gCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCCGgt < 2:354883/133‑1 (MQ=255) gCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCCGgt > 1:354883/1‑133 (MQ=255) cTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGTCGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCCGGTGTTGCTGCTGTtgatga < 5:122271/149‑1 (MQ=255) ggCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTTCATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCCGGTGTTGCTGCTGTTGATGAcc > 4:67645/1‑149 (MQ=255) gCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTttcttc > 3:73857/1‑115 (MQ=255) gCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTttcttc < 4:73857/115‑1 (MQ=255) gCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCCGgt > 7:334070/1‑129 (MQ=255) gCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCCGgt < 8:334070/129‑1 (MQ=255) aGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCCGGTGTTGCTGCTGTTGATGACCGAg > 6:37013/1‑149 (MQ=255) aaCGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCCGGTGTTGCTGCTGTTGATGACCGAGCg < 5:77289/149‑1 (MQ=255) c‑cTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCCGGTGTTGCTGCTGTTGATGACCGAGCGGCTgc < 6:232995/149‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCt > 6:229976/1‑99 (MQ=255) cTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCt < 5:229976/99‑1 (MQ=255) cgcTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTTTTTGTGATCACAGCACTCATCTACACCTCAGGCATGGATGGGTACTTCTAACTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCCGGTGTTGCTGCTGTtgat < 2:323869/130‑1 (MQ=255) gCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGAcgctgtagaagtctgtcgtcgagcgtgtgcgacgcgccgcccaccaggtgatgcacaaggtgaacagcacgaacaccatgaacatgccgatggcatgcaggttgagcggctgacgctgaccagc > 2:124501‑M2/1‑25 (MQ=255) gCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCCGGTGTTGCTGCTGTTGATGACCGAGCGGCTGCGCAACCTgg < 3:374600/148‑1 (MQ=255) ccGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCCGGTGTTGCTGCTGTTGATGACCGAGCGGCTGCGCAACCTGGGc < 1:170088/149‑1 (MQ=255) ccGGGGACTACATGTCCGCCTAGACTCTGTTGGGGATCACCGCAGTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCCGGTGTTGCTGCTGTTGATGACCGAGCGGCTGCGCAACCTGGGc < 8:237524/149‑1 (MQ=255) cGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTcgc > 4:252061/1‑96 (MQ=255) aCATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCCGGTGTTGCTGCTGTTGATGACCGAGCGGCTGCGCAACCTGGGCCGCTTCAcc > 2:304178/1‑149 (MQ=255) cGCCTCGACTCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCCGGTGTTGCTGCTGTTGATGACCGAGCGGCTGCGCAACCTGGGCCGCTTCACCTTTGCCg < 2:340978/149‑1 (MQ=255) cTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCCGGTGTTGCTGCTGTTGATGACCGAGCGGCTGCGCAACCTGGGCCGCTTCACCTTTGCCGata < 5:37013/149‑1 (MQ=255) | CATGGTGTTCGTGCTGTTCACCTTGTGCATCACCTGGTGGGCGGCGCGTCGCACACGCTCGACGACAGACTTCTACAGCGCCGGTGGCGGCATCCAGGGCTGGCAGAACGGC‑CTGGCGCTGGCCGGGGACTACATGTCCGCCTCGACGCTGTTGGGGATCACCGCACTCATCTACACCTCCGGCATGGATGGCTACATCTACCTCATCGCTTTCTTCGCGGGCTGGCCGGTGTTGCTGCTGTTGATGACCGAGCGGCTGCGCAACCTGGGCCGCTTCACCTTTGCCGATA > NC_002947/3186498‑3186787 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |