| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 3611287 | 61 (1.030) | 3 (0.050) | 3/244 | NT | 5.1% | coding (2397/3396 nt) | mcoA | Mn(II) copper oxidase A |
| ? | NC_002947 | = 3611333 | 54 (0.960) | coding (2351/3396 nt) | mcoA | Mn(II) copper oxidase A | |||||
CGGTACACATCCTTGCGCGCCCATTTTTCCCATTCTGGCGGGGCCTTGCCGTCGCGGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTGTAGCCAAAGCCGCCGTCGGTCTTGATGGTCCACGGGGTGGTGTCCGTGCCGTCAGAGCGGCCAAAGATGAAC > NC_002947/3611141‑3611434 | cGGTACACATCCTTGCGCGCCCATTTTTCCCATTCTGGCGGGGCCTTGCCGTCGCGGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTc < 1:204159/149‑1 (MQ=255) gTACACATCCTTGCGCGCCCATTTTTCCCATTCTGGCGGGGCCTTGCCGTCGCGGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTcgc > 1:338188/1‑149 (MQ=255) acacATCCTTGCGCGCCCATTTTTCCCATTCTGGCGGGGCCTTGCCGTCGCGGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTcgccg > 2:215909/1‑149 (MQ=255) acaTCCTTGCGCGCCCATTTTTCCCATTCTGGCGGGGCCTTGCCGTCGCGGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCt > 5:261129/1‑149 (MQ=255) aTCCTTGCGCGCCCATTTTTCCCATTCTGGCGGGGCCTTGCCGTCGCGGCTAAGAATCGACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCt > 1:108699/1‑148 (MQ=255) aTCCTTGCGCGCCCATTTTTCCCATTCTGGCGGGGCCTTGCCGTCGCGGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTg > 2:43888/1‑148 (MQ=255) ccATTTTTCCCATTCTGGCGGGGCCTTGCCGTCGCGGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAacca < 6:248819/142‑1 (MQ=255) ccATTTTTCCCATTCTGGCGGGGCCTTGCCGTCGCGGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAacca > 5:248819/1‑142 (MQ=255) ccATTTTTCCCATTCTGGCGGGGCCTTGCCGTCGCGGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCgg > 6:112905/1‑149 (MQ=255) aTTTTTCCCATTCTGGCGGGGCCTTGCCGTCGCGGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTcgccgc < 3:130896/132‑1 (MQ=255) aTTTTTCCCATTCTGGCGGGGCCTTGCCGTCGCGGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTcgccgc > 4:130896/1‑132 (MQ=255) aTTTTTCCCATTCTGGCGGGGCCTTGCCGTCGCGGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTg < 3:187323/149‑1 (MQ=255) tttCCCATTCTGGCGGGGCCTTGCCGTCGCGGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAaccac > 4:148925/1‑138 (MQ=255) tttCCCATTCTGGCGGGGCCTTGCCGTCGCGGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAaccac < 3:148925/138‑1 (MQ=255) tttCCCATTCTGGCGGGGCCTTGCCGTCGCGGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGa < 1:215909/148‑1 (MQ=255) tCCCATTCTGGCGGGGCCTTGCCGTCGCGGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACt < 6:261129/148‑1 (MQ=255) cATTCTGGCGGGGCCTTGCCGTCGCGGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGtt > 8:172701/1‑149 (MQ=255) cATTCTGGCGGGGCCTTGCCGTCGCGGCTAAGAATC‑AAGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTAGACGATTTTCCCCACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGtt > 1:143679/1‑149 (MQ=255) aTTCTGGCGGGGCCTTGCCGTCGCGGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTg < 3:40940/149‑1 (MQ=255) ggCGGGGCCTTGCCGTCGCGGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCAAGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGATGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAg > 5:228526/1‑149 (MQ=255) gCGGGGCCTTGCCGTCGCGGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAg < 5:112905/148‑1 (MQ=255) ggCCTTGCCGTCGCGGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTtgcg < 2:338188/149‑1 (MQ=255) gCCTTGCCGTCGCGGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGcaccgcaactggccaaccagtccaccgacggtggtttcagcggc > 5:270057‑M1/1‑105 (MQ=255) cTTGCCGTCGCGGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTtgcggtg < 7:172701/149‑1 (MQ=255) cTTGCCGTCGCGGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTtgcggtg > 1:89940/1‑149 (MQ=255) cGTCGCGGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGcaccgcaactggccaaccagtccaccgacggtggtttcagcggcgacggca < 1:176528‑M1/149‑52 (MQ=255) gcgGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGcaccgcaactggccaaccagtccaccgacggtggtttcagcggcgacggcaccct < 6:270057‑M1/149‑56 (MQ=255) tAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGa < 7:133725/115‑1 (MQ=255) tAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGa > 8:133725/1‑115 (MQ=255) aaGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGt < 7:181562/107‑1 (MQ=255) aaGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGt > 8:181562/1‑107 (MQ=255) gAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGt > 8:315663/1‑149 (MQ=255) gAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGt > 8:56475/1‑149 (MQ=255) gAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGt < 2:108699/149‑1 (MQ=255) aTC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTgg < 5:83042/149‑1 (MQ=255) aCGCCTTCCTCGAAGTGCACTTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCCGTGGACTGGTTGGCCAGTTTCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGt < 6:325392/148‑1 (MQ=255) aCGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGt < 1:43888/148‑1 (MQ=255) gCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCa > 3:125520/1‑149 (MQ=255) gCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCa > 7:352236/1‑149 (MQ=255) ccTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCAt < 3:188400/149‑1 (MQ=255) ccTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTg > 5:47675/1‑149 (MQ=255) tCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTg > 5:328711/1‑147 (MQ=255) gcaGTGCACGCGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCCCACTTCCCGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTGTa < 4:362447/145‑1 (MQ=255) gAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTGTa < 5:166800/147‑1 (MQ=255) aGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGGCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTGTAGcc < 6:228526/148‑1 (MQ=255) cACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTGTAGCCAAAgc > 7:948/1‑149 (MQ=255) gtACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCTGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTGTAGCCAAAGccgccg > 3:123366/1‑149 (MQ=255) cTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTGTAGCCAAAGCCGCCGTCGGTCTTGAt < 5:59550/149‑1 (MQ=255) tCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTGTAGCCAAAGCCGCCGTCGGTCTTGATg > 2:106866/1‑149 (MQ=255) tCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTGTAGCCAAAGCCGCCGTCGGTCTTGATg > 3:119384/1‑149 (MQ=255) cAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTGTAGCCAAAGCCGCCGTCGGTCTTGATg < 5:155044/147‑1 (MQ=255) cAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTGTAGCCAAAGCCGCCGTCGGTCTTGATGGt < 7:315663/149‑1 (MQ=255) gCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTGTAGCCAAAGCCGCCGTCGGTCTTGAt < 8:111779/144‑1 (MQ=255) gCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTGTAGCCAAAGCCGCCGTCGGTCTTGAt > 7:111779/1‑144 (MQ=255) cATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGCTGGACTGGTTGGCAAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTGTAGCCAAAGCCGCCGTCGGTCTTGATGGTCCAc > 2:159921/1‑149 (MQ=255) ttGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTGTAGCCAAAGCCGCCGTCGGTCTTGATGGTCCACgg < 2:89940/149‑1 (MQ=255) gccgccGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTGTAGCCAAAGCCGCCGTCGGTCTTGATGGTCCACggg < 3:71296/148‑1 (MQ=255) cgccgTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTGTAGCCAAAGCCGCCGTCGGTCTTGATGGTCCACGGggtg < 8:948/149‑1 (MQ=255) cgccgTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCAACGTCGGTGGACTGGTTGGACAGTTGCGGTTCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGATGTAGCCAAAGCCGCCGTCGGTCTTGATGGTCAACGGggtg > 7:155787/1‑149 (MQ=255) aTTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTGTAGCCAAAGCCGCCGTCGGTCTTGATGGTCCACGGGGTGGTGTCCGTGcc < 1:106866/149‑1 (MQ=255) tttCCACTGTTCCAGGGTGCGGTCGCGGGTGAATCGACCGTCGGTTGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCTTGGGTCCATGCTGTAGCCTAAGCCGCCGTCGGTCTTGATGGTACACGGGTTGGTGTCCGTGCCg < 1:159921/148‑1 (MQ=255) acacTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTGTAGCCAAAGCCGCCGTCGGTCTTGATGGTCCACGGGGTGGTGTCCGTGCCGTCagag > 4:340263/1‑149 (MQ=255) cacTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTGTAGCCAAAGCCGCCGTCGGTCTTGATGGTCCACGGGGTGGTGTCCGTGCCGTCAGAGc < 4:119384/149‑1 (MQ=255) cacTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTGTAGCCAAAGCCGCCGTCGGTCTTGATGGTCCACGGGGTGGTGTCCGTGCCGTCAGAGc > 2:362748/1‑149 (MQ=255) acTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCTGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTGTAGCCAAAGCCGCCGTCGGTCTTGATGGTCCACGGGGTGGTGTCCGTGCCGTCAGAGCg < 4:123366/149‑1 (MQ=255) cAGGGTGCGGTCGCCGCTGAAACCACCTGAGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGTTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTGTAGCCAAAGCCGCCGTCGGTCTTGTTTGTCCACGGGGTGGGGTCCGTGCCGTCATAGCGGCCa < 2:143679/148‑1 (MQ=255) aGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGcggcaccctggaagtgtggaaaatcgtcaacggcggcaatggctggagccacccggtacacgtgcacttcgaggaaggcgtgattcttagccgc < 6:270057‑M2/149‑95 (MQ=255) tGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGcggcaccctggaagtgtggaaaatcgtcaacggcggcaatggctggagccacccggtacacgtgcacttcgaggaaggcgtgattcttagccgcgacg < 1:176528‑M2/149‑99 (MQ=255) cGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTGTAGCCAAAGCCGCCGTCGGTCTTGATGGTCCACGGGGTGGTGTCCGTGCCGTCAGAGCGGCCAAAGATGAAc > 1:45605/1‑149 (MQ=255) | CGGTACACATCCTTGCGCGCCCATTTTTCCCATTCTGGCGGGGCCTTGCCGTCGCGGCTAAGAATC‑ACGCCTTCCTCGAAGTGCACGTGTACCGGGTGGCTCCAGCCATTGCCGCCGTTGACGATTTTCCACACTTCCAGGGTGCCGTCGCCGCTGAAACCACCGTCGGTGGACTGGTTGGCCAGTTGCGGTGCGGCACTGATACGGCGTGGGTCCATGCTGTAGCCAAAGCCGCCGTCGGTCTTGATGGTCCACGGGGTGGTGTCCGTGCCGTCAGAGCGGCCAAAGATGAAC > NC_002947/3611141‑3611434 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |