| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 3984950 | 59 (1.000) | 3 (0.050) | 3/240 | NT | 5.1% | coding (234/855 nt) | PP_3513 | LysR family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | = 3984991 | 56 (1.010) | coding (275/855 nt) | PP_3513 | LysR family transcriptional regulator | |||||
CAGTCCACTGTCAGCATCGCCATCGCCAATTTCGAGGCCGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATACCGAGCTACGCTGCGG > NC_002947/3984807‑3985096 | cAGTCCACTGTCAGCATCGCCATCGCCAATTTCGAGGCCGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCt > 2:251973/1‑149 (MQ=255) aGTCCACTGTCAGCATCGCCATCGCCAATTTCGAGGCCGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTc > 1:235139/1‑149 (MQ=255) tCCACTGTCAGCATCGCCATCGCCAATTTCGAGGCCGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGa > 1:332329/1‑149 (MQ=255) cTGTCAGCATCGCCATCGCCAATTTCGAGGCCGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATgcg < 1:251973/149‑1 (MQ=255) tCAGCATCGCCATCGCCAATTTCGAGGCCGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTg < 8:20518/149‑1 (MQ=255) gCATCGCCATCGCCAATTTCGAGGCCGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCa < 4:152418/149‑1 (MQ=255) atcgccctcgccAATTTCGAGGCCGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGt < 8:123170/149‑1 (MQ=255) atcgccatcgccAATTTCGAGGCCGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGAt > 6:278027/1‑138 (MQ=255) atcgccatcgccAATTTCGAGGCCGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGAt < 5:278027/138‑1 (MQ=255) catcgccaATTTCGAGGCCGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGAc < 6:60145/149‑1 (MQ=255) gccaATTTCGAGGCCGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑gc > 6:187989/1‑149 (MQ=255) gccaATTTCGAGGCCGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑gc < 3:168666/149‑1 (MQ=255) gccaATTTCGAGGCCGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑gc < 5:303502/149‑1 (MQ=255) ccaATTTCGAGGCCGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑gcg > 5:429/1‑149 (MQ=255) aaTTTCGAGGCCGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAAAGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑gcgc > 1:369101/1‑148 (MQ=255) gAGGCCGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGt > 8:41666/1‑149 (MQ=255) aGGCCGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTg > 8:248558/1‑131 (MQ=255) aGGCCGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTg < 7:248558/131‑1 (MQ=255) aGGCCGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTc < 7:41666/149‑1 (MQ=255) ggCCGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCg < 8:32878/149‑1 (MQ=255) ggCCGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCg < 2:332329/149‑1 (MQ=255) ccGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAg > 6:429‑M2/1‑148 (MQ=255) cGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAgg > 2:235139‑M2/1‑147 (MQ=255) cGATATCGGCTGCACGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACACCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCTAATTGTCGAgg < 8:170056‑M2/149‑3 (MQ=255) cGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTATCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGCCTG‑‑GCGCAAAATGTCGAggcgctgg < 6:71670‑M2/149‑9 (MQ=255) ggCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCtcgacattttgcgccagtcgcactgccagcgcatcgagctgggcgctgg < 1:277210‑M1/148‑50 (MQ=255) ggCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAggcgctgg < 8:114031‑M2/148‑9 (MQ=255) ccGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCtgt > 3:335819/1‑149 (MQ=255) ccGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCtgt > 3:34830/1‑149 (MQ=255) cGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAAAGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCtgtg < 2:369101/149‑1 (MQ=255) tttGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGAt < 7:114031/149‑1 (MQ=255) tttGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGAt > 1:131528/1‑149 (MQ=255) aCCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGTCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCg < 5:187989/149‑1 (MQ=255) aCCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCg < 3:361203/149‑1 (MQ=255) ccGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCg > 2:74973/1‑148 (MQ=255) cGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCtcgacattttgcgccagtcgcactgccagcgcatcgagctgggcgctggc < 7:155375‑M1/131‑51 (MQ=255) cGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCtcgacattttgcgccagtcgcactgccagcgcatcgagctgggcgctggc > 8:155375‑M1/1‑81 (MQ=255) cGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGa > 6:29854/1‑149 (MQ=255) cAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGa > 4:290131/1‑147 (MQ=255) cAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGa < 3:290131/147‑1 (MQ=255) cgccACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAg > 1:233847/1‑149 (MQ=255) cccACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAAc < 2:355188/149‑1 (MQ=255) aaTGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAggg < 2:131528/149‑1 (MQ=255) aaTGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAgg < 5:71670/148‑1 (MQ=255) aaTGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAg < 1:74973/147‑1 (MQ=255) gAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGc > 8:186491/1‑149 (MQ=255) gggCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGtga < 4:34830/149‑1 (MQ=255) caggcatgTGCTGTGCCATGTCGAAGCAATTCTCGTGGCCACCGCCCATCTCGTTGCGGTGGCATTGGGACTGGCGCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGtgat < 1:117375/149‑1 (MQ=255) gcaggTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTCACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTc > 6:284266/1‑149 (MQ=255) gcaggTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTc > 5:323665/1‑149 (MQ=255) aggTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGc < 2:239610/119‑1 (MQ=255) aggTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGc > 1:239610/1‑119 (MQ=255) tGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGcc < 3:14347/149‑1 (MQ=255) aGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGcc < 2:233847/147‑1 (MQ=255) aGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCa < 4:335819/149‑1 (MQ=255) ccATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACTGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGc > 4:263086/1‑149 (MQ=255) cATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGtgatga > 2:248403/1‑133 (MQ=255) cATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGtgatga < 1:248403/133‑1 (MQ=255) tGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCAc > 6:369881/1‑148 (MQ=255) aGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTCGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTAcccc > 7:247787/1‑148 (MQ=255) gCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGAGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGAACTAccccc > 8:176536/1‑148 (MQ=255) aaTTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATa > 8:8787/1‑149 (MQ=255) aTTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCa < 5:211270/137‑1 (MQ=255) aTTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATAc < 7:186491/149‑1 (MQ=255) aTTCTCGAGGCCAGCGCCCAGATCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCa > 6:211270/1‑137 (MQ=255) tcGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATACCGAg > 5:212777/1‑149 (MQ=255) gAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATACCGAGCt < 5:29854/149‑1 (MQ=255) gCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAggcgctggcctcgagaattgcttcgacatggctcagcacctgcctgcccgcctcattgagcgtggggtggcggccattgcg < 7:155375‑M2/131‑82 (MQ=255) gCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAggcgctggcctcgagaattgcttcgacatggctcagcacctgcctgcccgcctcattgagcgtggggtggcggccattgcg > 8:155375‑M2/1‑50 (MQ=255) ccAGCGCCtcgacattttgcgccagtcgcactgccagcgcatcgagctgggcgctggcctcgagaattgcttcgacatggctcagcacctgcctgcccgcctcattgagcgtggggtggcggccattgcggtcaaacagcgggcagcc < 8:114031‑M1/148‑141 (MQ=255) ccAGCGCCtcgacattttgcgccaggcgcactgccagcgcatcgagctgggcgctggcctcgataattgcttcgacatggctcagcacctgcctgcccgcctcattgagcgtggggtggcggccattgcggtcaaacagcgggcagccg < 6:71670‑M1/149‑142 (MQ=255) ccAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAggcgctggcctcgagaattgcttcgacatggctcagcacctgcctgcccgcctcattgagcgtggggtggcggccattgcggtcaaacagcgggcagcc < 1:277210‑M2/148‑100 (MQ=255) cAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAAGGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATACCGAGCTACGCt > 6:390832/1‑149 (MQ=255) cgcCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATACCGAGCTACGCTGCg < 6:323665/149‑1 (MQ=255) cctcgacattttgcgccagtcgcactgccagcgcatcgagctgggcgctggcctcgagaattgcttcgacatggctcagcacctgcctgcccgcctcattgagcgtggggtggcggccattgcggtcaaacagcgggcagccgatatcg > 2:235139‑M1/1‑2 (MQ=255) cctcgacaattagcgccagtcgcactgccagcgcatcgagctgggcgctggcctcgagaattgcttcgacatggctcagcacctgcctgcccgcctcattgagcgtggtgtggcggccattgcggtcaaacagcgtgcagccgatatcg < 8:170056‑M1/149‑148 (MQ=255) ctcgacattttgcgccagtcgcactgccagcgcatcgagctgggcgctggcctcgagaattgcttcgacatggctcagcacctgcctgcccgcctcattgagcgtggggtggcggccattgcggtcaaacagcgggcagccgatatcgg > 6:429‑M1/1‑1 (MQ=255) | CAGTCCACTGTCAGCATCGCCATCGCCAATTTCGAGGCCGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATACCGAGCTACGCTGCGG > NC_002947/3984807‑3985096 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |