New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3984950 | 59 (1.000) | 3 (0.050) | 3/240 | NT | 5.1% | coding (234/855 nt) | PP_3513 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 3984991 | 56 (1.010) | coding (275/855 nt) | PP_3513 | LysR family transcriptional regulator |
CCGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATACCGAGCTACGCTGCGGCCCGGCGGAGGACGCTGATGTAATCGAGATGATCCAGCAGGG > NC_002947/3984844‑3985138 | ccGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAg > 6:429‑M2/1‑148 (MQ=255) cGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAgg > 2:235139‑M2/1‑147 (MQ=255) cGATATCGGCTGCACGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACACCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCTAATTGTCGAgg < 8:170056‑M2/149‑3 (MQ=255) cGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTATCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGCCTG‑‑GCGCAAAATGTCGAggcgctgg < 6:71670‑M2/149‑9 (MQ=255) ggCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAggcgctgg < 8:114031‑M2/148‑9 (MQ=255) ccGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCtgt > 3:34830/1‑149 (MQ=255) ccGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCtgt > 3:335819/1‑149 (MQ=255) cGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAAAGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCtgtg < 2:369101/149‑1 (MQ=255) tttGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGAt > 1:131528/1‑149 (MQ=255) tttGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGAt < 7:114031/149‑1 (MQ=255) aCCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGTCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCg < 5:187989/149‑1 (MQ=255) aCCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCg < 3:361203/149‑1 (MQ=255) ccGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCg > 2:74973/1‑148 (MQ=255) cGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGa > 6:29854/1‑149 (MQ=255) cAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGa > 4:290131/1‑147 (MQ=255) cAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGa < 3:290131/147‑1 (MQ=255) cgccACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAg > 1:233847/1‑149 (MQ=255) cccACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAAc < 2:355188/149‑1 (MQ=255) aaTGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAggg < 2:131528/149‑1 (MQ=255) aaTGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAgg < 5:71670/148‑1 (MQ=255) aaTGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAg < 1:74973/147‑1 (MQ=255) gAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGc > 8:186491/1‑149 (MQ=255) gggCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGtga < 4:34830/149‑1 (MQ=255) caggcatgTGCTGTGCCATGTCGAAGCAATTCTCGTGGCCACCGCCCATCTCGTTGCGGTGGCATTGGGACTGGCGCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGtgat < 1:117375/149‑1 (MQ=255) gcaggTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTCACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTc > 6:284266/1‑149 (MQ=255) gcaggTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTc > 5:323665/1‑149 (MQ=255) aggTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGc > 1:239610/1‑119 (MQ=255) aggTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGc < 2:239610/119‑1 (MQ=255) tGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGcc < 3:14347/149‑1 (MQ=255) aGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGcc < 2:233847/147‑1 (MQ=255) aGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCa < 4:335819/149‑1 (MQ=255) ccATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACTGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGc > 4:263086/1‑149 (MQ=255) cATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGtgatga < 1:248403/133‑1 (MQ=255) cATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGtgatga > 2:248403/1‑133 (MQ=255) tGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCAc > 6:369881/1‑148 (MQ=255) aGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTCGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTAcccc > 7:247787/1‑148 (MQ=255) gCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGAGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGAACTAccccc > 8:176536/1‑148 (MQ=255) aaTTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATa > 8:8787/1‑149 (MQ=255) aTTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCa < 5:211270/137‑1 (MQ=255) aTTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATAc < 7:186491/149‑1 (MQ=255) aTTCTCGAGGCCAGCGCCCAGATCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCa > 6:211270/1‑137 (MQ=255) tcGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATACCGAg > 5:212777/1‑149 (MQ=255) gAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATACCGAGCt < 5:29854/149‑1 (MQ=255) gCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAggcgctggcctcgagaattgcttcgacatggctcagcacctgcctgcccgcctcattgagcgtggggtggcggccattgcg > 8:155375‑M2/1‑50 (MQ=255) gCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAggcgctggcctcgagaattgcttcgacatggctcagcacctgcctgcccgcctcattgagcgtggggtggcggccattgcg < 7:155375‑M2/131‑82 (MQ=255) ccAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAggcgctggcctcgagaattgcttcgacatggctcagcacctgcctgcccgcctcattgagcgtggggtggcggccattgcggtcaaacagcgggcagcc < 1:277210‑M2/148‑100 (MQ=255) cAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAAGGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATACCGAGCTACGCt > 6:390832/1‑149 (MQ=255) cgcCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATACCGAGCTACGCTGCg < 6:323665/149‑1 (MQ=255) cAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATACCGAGCTACGCTGCGGccc > 3:156340/1‑149 (MQ=255) gtCGATGAGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGGTGGTATGTGTGGTGATGTCTGACAGCTACAGCGTAACGTTCATGTGGGCGGTGTTTACTCTTTTCGCCAAGAAGTAGCCCCATACCGAGCTTCGCTGCGGCAcggc > 3:230421/2‑149 (MQ=255) gATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATACCGAGCTACGCTGCGGCCcggcg > 4:630/1‑147 (MQ=255) aTGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATACCGAGCTACGCTGCGGCCCGGCggag > 7:2542/1‑149 (MQ=255) gcTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCATTTCGCCCAGCACTACCCCCATACCGAGCTACGCTGCGGCCCGGCGGAGGACg > 5:132028/1‑149 (MQ=255) cAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATACCGAGCTACGCTGCGGCCCGGCGGAGGACGCTGAt < 7:170056/149‑1 (MQ=255) gACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACTGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATACCGAGCTACGCTGCGGCCCGGCGGAGGACGCTGATGTAATc < 3:263086/149‑1 (MQ=255) gcgcAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGTGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATAcc < 6:29049/105‑1 (MQ=255) gcgcAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATAcc > 5:29049/1‑105 (MQ=255) gcgcAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATACCGAGCTACGCTGCGGCCCGGCGGAGGACGCTGATGTAATCGAgat < 7:8787/149‑1 (MQ=255) gcgcAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATACCGAGCTACGCTGCGGCCCGGCGGAGGACGCTGATGTAATCGAgat > 5:148501/1‑149 (MQ=255) gcAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGtgat > 2:150947/1‑72 (MQ=255) gcAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGtgat < 1:150947/72‑1 (MQ=255) cAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATACCGAGCTACGCTGCGGCCCGGCGGAGGACGCTGATGTAATCGAgatgat > 5:60035/1‑149 (MQ=255) aaaaTGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATACCGAGCTACGCTGCGGCCCGGCGGAGGACGCTGATGTAATCGAGATGATc < 2:281207/149‑1 (MQ=255) aaaTGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATACCGAGCTACGCTGCGGCCCGGCGGAGGACGCTGATGTAATCGAGATGATc > 8:292431/1‑148 (MQ=255) gAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATACCGAGCTACGCTGCGGCCCGGCGGAGGACGCTGATGTAATCGAGATGATCCAGCAggg > 4:171023/1‑149 (MQ=255) | CCGATATCGGCTGCCCGCTGTTTGACCGCAATGGCCGCCACCCCACGCTCAATGAGGCGGGCAGGCAGGTGCTGAGCCATGTCGAAGCAATTCTCGAGGCCAGCGCCCAGCTCGATGCGCTGGCAGTGCGACTG‑‑GCGCAAAATGTCGAGGCGCTGGTATCTGTGGTGATGTCGGACAGCTACAGCGTAACGTTCCAGGGGGCGGTGATGACTCGTTTCGCCCAGCACTACCCCCATACCGAGCTACGCTGCGGCCCGGCGGAGGACGCTGATGTAATCGAGATGATCCAGCAGGG > NC_002947/3984844‑3985138 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |