New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 4930594 = | 67 (1.130) | 6 (0.110) | 5/238 | NT | 8.7% | coding (379/789 nt) | cheZ | protein phosphatase CheZ |
? | NC_002947 | 4930639 = | 63 (1.150) | coding (334/789 nt) | cheZ | protein phosphatase CheZ |
TCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGCGACACCTCT > NC_002947/4930452‑4930742 | gtcagtttccagatcgaccccaccatgccgcaggcagaagaggtgtcgcagattaccgacgccaccgagcgcctgtcgtatgtggtcaagctcaccgagggcgcggccaaccgcaccatggacctggtcgaggaaagcacacCGGTGc > 6:222949‑M1/143‑148 (MQ=255) ggCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAg < 8:244497/147‑1 (MQ=255) cAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGCCTCGCGTGACCAGATCACGAAATTCAGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGCAGCGCTGCCAGTCGGTGAGCAGGGCCt > 5:155349/1‑149 (MQ=255) 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gTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTgg > 4:106503/1‑149 (MQ=255) gTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTg < 8:297753/148‑1 (MQ=255) caccatgccgcaggcagaagaggtgtcgcagattaccgacgccaccgagcgcctgtcgtatgtggtcaagctcaccgagggcgcggccaaccgcaccatggacctggtcgaggaaagcacacCGGt < 2:204415‑M1/4‑1 (MQ=255) caccatgccgcaggcagaagaggtgtcgcagattaccgacgccaccgagcgcctgtcgtatgtggtcaagctcaccgagggcgcggccaaccgcaccatggacctggtcgaggaaagcacacCGGt > 1:204415‑M1/123‑126 (MQ=255) ttGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGc < 5:343484/149‑1 (MQ=255) aGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAg > 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> 6:100528‑M1/1‑102 (MQ=255) ccTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAatgagctggccaacgaggccaaggccctgag < 5:100528‑M1/133‑32 (MQ=255) ccTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTcc > 7:206798/1‑149 (MQ=255) ccTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCACTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTcc < 8:318139/149‑1 (MQ=255) cTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCt > 6:385683/1‑149 (MQ=255) cTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCt > 3:288359/1‑149 (MQ=255) 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cgcTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTg > 1:363562/1‑149 (MQ=255) gcTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGc < 2:142544/149‑1 (MQ=255) gcTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGc < 2:363562/149‑1 (MQ=255) cTGGCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCCGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGTTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGCg < 4:335990/149‑1 (MQ=255) cTGACAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTACTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTa > 5:265224/1‑142 (MQ=255) aGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGCGACAcc > 4:21962/1‑149 (MQ=255) cGGTGCTCAatgagctggccaacgaggccaaggccctgagcaccgactggcagcgcttcatgcgccgcgaagtggctgcgccggaatttcgtgatctggtcaagcgagtcgacagtttcctgacgcacagcgccgagggtaaccgcaag > 8:125795‑M1/1‑9 (MQ=255) cGGTGCTCAatgagctggccaacgaggccaaggccctgagcaccgactggcagcgcttcatgcgccgcgaagtggctgcgccggaatttcgtgatctggtcaagcgagtcgacagtttcctgacgcacagcgccgagggtaaccgcaag > 8:352258‑M1/1‑9 (MQ=255) cGGTGCTCAatgagctggccaacgaggccaaggccctgagcaccgactggcagcgcttcatgcgccgcgaagtggctgcgccggaatttcgtgatctggtcaagcgagtcgacagtttcctgacgcacagcgccgagggtaaccgcaag < 5:151176‑M1/149‑141 (MQ=255) | TCCTGGGCCAGCAAAATGTCGTTGAGGTGCCCGGAAACCTTGCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGCGACACCTCT > NC_002947/4930452‑4930742 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |