| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 4930594 = | 67 (1.130) | 6 (0.110) | 5/238 | NT | 8.7% | coding (379/789 nt) | cheZ | protein phosphatase CheZ |
| ? | NC_002947 | 4930639 = | 63 (1.150) | coding (334/789 nt) | cheZ | protein phosphatase CheZ | |||||
GCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGTTGGCCGCGCCCTCGGTGAGCTTGACCACATACGACAGGCGCTCGGTGGCGTCGGTAATCTGCGACACCTCTTCTGCCTGCGGCATGGTGGGGTCGATCTGGAAACTGACGATGGCA > NC_002947/4930493‑4930787 | ggtgtcgcagattaccgacgccaccgagcgcctgtcgtatgtggtcaagctcaccgagggcgcggccaaccgcaccatggacctggtcgaggaaagcacacCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGgtg > 3:186150‑M1/102‑149 (MQ=255)gCGGTTACCCTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGgt < 3:368354/148‑1 (MQ=255) cccTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTc < 3:20365/149‑1 (MQ=255) ccTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTcc > 7:206798/1‑149 (MQ=255) ccTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCACTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTcc < 8:318139/149‑1 (MQ=255) cTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCt > 6:385683/1‑149 (MQ=255) cTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCt > 2:145204/1‑149 (MQ=255) cTCGGCGCTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCt > 3:288359/1‑149 (MQ=255) cgcTGTGCGTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGAcc < 5:235465/149‑1 (MQ=255) gTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATTACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCAt > 1:39902/1‑149 (MQ=255) gTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCAt > 2:240184/1‑149 (MQ=255) gTCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCAt > 5:263045/1‑149 (MQ=255) tCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATg > 4:121802/1‑149 (MQ=255) tCAGGAAACTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTAGACCAGGTCCATg > 1:131079/1‑149 (MQ=255) aaCTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGGGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCgg > 3:157886/1‑149 (MQ=255) cTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGtt < 4:288359/149‑1 (MQ=255) cTGTCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATGGTGCGGtt < 5:229707/149‑1 (MQ=255) tCGACTCGCTTGACCAGATCACGAAATTCCGGCGCAGCCACTTCGCGGCGCATGAAGCGCTGCCAGTCGGTGCTCAGGGCCTTGGCCTCGTTGGCCAGCTCATTGAGCACCGGTGTGCTTTCCTCGACCAGGTCCATg > 5:357757/1‑138 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |