New junction evidence | |||||||||||
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TTGGGTGCAAACAGGGCGGTGAAGTCGGCCATGCACGCCTGCAACCCGCCGATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGG‑CCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCG‑CCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAAC > NC_002947/4990326‑4990619 | ttGGGTGCAAACAGGGCGGTGAAGTCGGCCATGCACGCCTGCAACCCGCCGATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGG‑CCGCTGCCGGCCTCGCCCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGG > 7:351946‑M1/1‑148 (MQ=255) ttccgcAGGGCGGTGAAGTCGGCCATGCACGCCTGCAACCCGCCGATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGG‑CCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGcc < 4:305198/144‑1 (MQ=255) aaaCAGGGCGGTGAAGTCGGCCATGCACGCCTGCAACCCGCCGATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGG‑CCGCTGCCGGTCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCgg > 2:293967/1‑149 (MQ=255) 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6:108664‑M2/1‑39 (MQ=255) tgtgCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCG‑CCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGAtc > 1:238899/1‑149 (MQ=255) gtgCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGccatgcacattcaccagagcctggtcgaggccggcagcggccgtaacgtattcagtgacgagcaaggcctgccgacagcacccttacacgagttcatcggcgggttgcagg < 4:191797‑M2/149‑112 (MQ=255) gCATGGccaagccgctggcgcgtacgcccggcagttccatgcacattcaccagagcctggtcgaggccggcagcggccgtaacgtattcagtgacgagcaaggcctgccgacagaaaccttccaccatttcatcggcgggttgcaggcg > 7:253221‑M1/1‑6 (MQ=255) gCATGGAACTGCCGGGTGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAgcg‑c < 2:368519/70‑1 (MQ=255) gCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGccatgcacattcaccagagcctggtcgaggccggcagcggccgtaacgtattcagtgacgagcaaggcctgccgacagaaaccttccaccatttcatcggcgggttgcaggcg < 5:367802‑M2/149‑114 (MQ=255) gCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCG‑CCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGAtctc > 1:26836/1‑148 (MQ=255) gCATGGAACTGCCGGGAGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAgcg‑c > 1:368519/1‑70 (MQ=255) cATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCG‑CCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAg < 1:46013/100‑1 (MQ=255) cATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCG‑CCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAg > 2:46013/1‑100 (MQ=255) aTGGccaagccgctggcgcgtacgcccggcagttccatgcacattcaccagagcctggtcgaggccggcagcggccgtaacgtattcagtgacgagcaaggcctgccgacagaaaccttccaccatttcatcggcgggttgcaggcgtg < 1:162956‑M1/149‑146 (MQ=255) aTGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCG‑CCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGaa > 7:260164/1‑149 (MQ=255) aTGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCG‑CCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGaa > 4:201219/1‑149 (MQ=255) aTGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCG‑CCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGaa > 8:60537/1‑149 (MQ=255) tGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCG‑CCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAAc < 1:85633/149‑1 (MQ=255) ggccaagccgctggcgcgtacgcccggcagttccatgcacattcaccagagcctggtcgaggccggcagcggccgtaacgtattcagtgacgagcaag > 2:3735‑M1/1‑2 (MQ=255) ggccaagccgctggcgcgtacgcccggcagttccatgcacattcaccagagcctggtcgaggccggcagcggcccgtaacgtattcagtgacgagcaag < 1:3735‑M1/99‑98 (MQ=255) | TTGGGTGCAAACAGGGCGGTGAAGTCGGCCATGCACGCCTGCAACCCGCCGATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGG‑CCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCG‑CCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAAC > NC_002947/4990326‑4990619 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |