New junction evidence | |||||||||||
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CACGCCTGCAACCCGCCGATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGG‑CCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCG‑CCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAAC‑AGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCGTGCATGAAGGTGT > NC_002947/4990359‑4990650 | cACGCCTGCAACCCGCCGATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGG‑CCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGccat < 1:162956‑M2/149‑5 (MQ=255) cGCCTGCAACCCGCCGATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGG‑CCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGccatgc > 7:253221‑M2/1‑143 (MQ=255) tGCAACCCGCCGATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGG‑CCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGAc > 7:115814/1‑149 (MQ=255) gCAACCCGCCGATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCGCGGCACTGAATACTTTCCGC‑CCGATGCCGGCCTCGCCCAGGCGCTGGTGAAGGTGCATGGACATCCCGGGCGTACCCCCCACCGGCTTGGCCATGCAGccc > 2:275237/1‑149 (MQ=255) aCCCGCCGATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGG‑CCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACg < 1:223083/149‑1 (MQ=255) cccGCCGATGAAATGGTGGAAGGTTTATGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGG‑CCGCTGACGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACTCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACgg > 4:95589/1‑149 (MQ=255) ccgccgATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGG‑CCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACgg > 5:261775/1‑148 (MQ=255) ccgccgATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGG‑CCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGt > 5:61925/1‑149 (MQ=255) gccgATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGG‑CCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGt > 6:22202/1‑147 (MQ=255) cgATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGG‑CCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGc > 5:48914/1‑149 (MQ=255) gtggAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGG‑CCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCtt > 3:244903/1‑147 (MQ=255) tggAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGG‑CCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGAAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAg > 7:300126/1‑149 (MQ=255) gAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGG‑CCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAgc < 5:22202/148‑1 (MQ=255) 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tACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCG‑CCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAAC‑AGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCAtt < 4:63048/149‑1 (MQ=255) cgcCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCG‑CCACTTCCTTGAGGAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAAC‑AGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCGt < 4:94554/149‑1 (MQ=255) gcCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCG‑CCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAAC‑AGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCGTg > 6:280508/1‑149 (MQ=255) gcCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGGGCTTGAGCG‑CCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAACAAGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCGt < 1:293967/149‑1 (MQ=255) cAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCG‑CCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAAC‑AGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCGTGCa > 8:188380/1‑149 (MQ=255) aGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCG‑CCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAAC‑AGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCGTGCAt < 2:238899/149‑1 (MQ=255) ggCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCG‑CCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAAC‑AGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCGTGCATg > 5:270628/1‑147 (MQ=255) gCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCG‑CCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAAC‑AGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCGTGCAt < 4:276157/145‑1 (MQ=255) gCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCG‑CCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAAC‑AGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCGTGCAt > 3:276157/1‑145 (MQ=255) ggCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCG‑CCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAAC‑AGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCGTGCATGAAGgtg > 7:242217/1‑148 (MQ=255) ggCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCG‑CCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAAC‑AGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCGTGCATGAAGgtg < 5:280508/148‑1 (MQ=255) gCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGGGCTTGAGCG‑CCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAAC‑AGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCGTGCATGAAGgtgt < 6:352487/148‑1 (MQ=255) | CACGCCTGCAACCCGCCGATGAAATGGTGGAAGGTTTCTGTCGGCAGGCCTTGCTCGTCACTGAATACGTTACGG‑CCGCTGCCGGCCTCGACCAGGCTCTGGTGAATGTGCATGGAACTGCCGGGCGTACGCGCCAGCGGCTTGGCCATGCAGACCACGGTCAGCCCGTGCTTGAGCG‑CCACTTCCTTGAGCAGGTGCTTGAACAGGAAGGTCTGGTCGGCCAAC‑AGCAGCGGGTCGCCGTGCAGCAGGTTGATCTCGAACTGGCTGACACCCATTTCGTGCATGAAGGTGT > NC_002947/4990359‑4990650 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |