New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5134678 | 49 (0.830) | 3 (0.050) | 3/246 | NT | 6.2% | coding (262/600 nt) | PP_4520 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 5134729 | 44 (0.770) | coding (211/600 nt) | PP_4520 | hypothetical protein |
CCCCAGCGTCACCCGTGGCAGCCCCCCCAGCAACGGGTTCAGGTACAGCAGCTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGAACACCTCTCCAATCCGCAGCTCGGCATTGTTCAGGCCAAGGGCAGCCAGGCGCGCCGTGTTCAGGGCATGGGCAGT > NC_002947/5134544‑5134825 | ccccAGCGTCACCCGTGGCAGCCCCCCCAGCAACGGGTTCAGGTACAGCAGCTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCg > 5:38565/1‑149 (MQ=255) cccAGCGTCACCCGTGGCAGCCCCCCCAGCAACGGGTTCAGGTACAGCAGCTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCgg < 4:327476/149‑1 (MQ=255) cccGTGGCAGCCCCCCCAGCAACGGGTTCAGGTACAGCAGCTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCgg > 7:140166/1‑139 (MQ=255) cccGTGGCAGCCCCCCCAGCAACGGGTTCAGGTACAGCAGCTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCgg < 8:140166/139‑1 (MQ=255) ccGTGGCAGCCCCCCCAGCAACGGGTTCAGGTACAGCAGCTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAAcagca < 1:315710/146‑1 (MQ=255) ccGTGGCAGCCCCCCCAGCAACGGGTTCAGGTACAGCAGCTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAAcagca > 2:315710/1‑146 (MQ=255) ccGTGGCAGCCCCCCCAGCAACGGGTTCAGGTACAGCAGCTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAgcagca > 2:244011/1‑149 (MQ=255) gCAGCCCCCCCAGCAACGGGTTCAGGTACAGCAGCTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATGAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCgg < 1:120252/148‑1 (MQ=255) cccccAGCAACGGGTTCAGGTACAGCAGCTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCg < 5:290017/126‑1 (MQ=255) cccccAGCAACGGGTTCAGGTACAGCAGCTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCg > 6:290017/1‑126 (MQ=255) cccccAGCAACGGGTTCAGGTACAGCAGCTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTAt > 8:184359/1‑149 (MQ=255) cccAGCAACGGGTTCAGGTACAGCAGCTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATcc > 5:176262/1‑149 (MQ=255) cAGCAACGGGTTCAGGTACAGCAGCTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCgg > 4:50168/1‑149 (MQ=255) aGCAACGGGTTCAGGTACAGCAGCTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCggg < 6:176262/149‑1 (MQ=255) aCGGGTTCAGGTACAGCAGCTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTg > 1:65681/1‑149 (MQ=255) gggTTCAGGTACAGCAGCTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGc > 6:77835/1‑149 (MQ=255) gTTCAGGTACAGCAGCTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGctcgccacccccggataccacccggtgctgctgttcccgggtgatgacgc > 2:192725‑M1/1‑99 (MQ=255) cAGGTACAGCAGCTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGctcgccacccccggataccacccggtgctgctgttcccgggtgatgacgccc < 1:192725‑M1/148‑53 (MQ=255) aGGTACAGCAGCTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGctcgccacccccggataccacccggtgctgctgttcccgggtgatgacgccca < 1:144104‑M1/148‑54 (MQ=255) aGGTACAGCAGCTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGcag < 7:160526‑M2/149‑4 (MQ=255) aGGTACAGCAGCTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGca > 6:38565‑M2/1‑146 (MQ=255) cagcagCTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGggtg < 1:4572/123‑1 (MQ=255) cagcagCTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGggtg > 2:4572/1‑123 (MQ=255) cagcagCTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAgcaggtcat < 5:77835/149‑1 (MQ=255) agcagcTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAgcaggtcatg < 3:50168/149‑1 (MQ=255) gcagcTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAgcaggtcatg > 4:324658/1‑148 (MQ=255) gcagcTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAgcaggtcatg > 4:330110/1‑148 (MQ=255) gcagcTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAgcaggtcatg > 6:227415/1‑148 (MQ=255) gcgcCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGaa < 7:162514/97‑1 (MQ=255) gcgcCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGaa > 8:162514/1‑97 (MQ=255) gcCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGaa < 1:244011/149‑1 (MQ=255) gcCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGAACACctct > 7:289089/1‑149 (MQ=255) gcCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGAACACctct > 5:93393/1‑149 (MQ=255) gcCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGAACACctct < 2:234625/149‑1 (MQ=255) ccAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGAACACCtctc < 2:65681/149‑1 (MQ=255) ccAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGAACACCtctc < 7:184359/149‑1 (MQ=255) ggTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGAACACCTCTCCaa < 6:93393/149‑1 (MQ=255) ccGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGAACACCTCTCCAATCCg > 8:218202/1‑149 (MQ=255) aCGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGAACACctct > 8:136748/1‑132 (MQ=255) aCGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGAACACctct < 7:136748/132‑1 (MQ=255) gATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGAACACCTCTCCAATCCGCAGCTCGGCAt > 6:290307/1‑149 (MQ=255) agcaAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGca > 5:295401‑M2/1‑95 (MQ=255) agcaAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGca < 6:295401‑M2/97‑3 (MQ=255) agcaAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGAACACCTCTCCAATCCGCAGCTCGGCATTGTTCAg < 7:218202/149‑1 (MQ=255) agcaAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGAACACCTCTCCAATCCGCAGCTCGGCATTGTTCAg < 8:160526/149‑1 (MQ=255) gcaAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGAACACCTCTCCAATCCGCAGCTCGGCATTGTTCAgg > 2:221519/1‑149 (MQ=255) gTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGAACACCTCTCCAATCCGCAGCTCGGCATTGTTCAGGCCAAgg < 3:330110/149‑1 (MQ=255) gTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGAACACCTCTCCAATCCGCAGCTCGGCATTGTTCAGGCCAAgg < 3:324658/149‑1 (MQ=255) tttGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGAACACCTCTCCAATCCGCAGCTCGGCATTGTTCAGGCCAAggg > 7:71785/1‑149 (MQ=255) gTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGAACACCTCTCCAATCCGCAGCTCGGCATTGTTCAGGCCAAGGGCAg > 6:312189/1‑149 (MQ=255) tCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGAACACCTCTCCAATCCGCAGCTCGGCATTGTTCAGGCCAAGGGCAGc > 8:306353/1‑149 (MQ=255) cTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGTGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGAACACCTCTCCAATCCGCAGCTCgg < 5:147941/119‑1 (MQ=255) cTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGAACACCTCTCCAATCCGCAGCTCgg > 6:147941/1‑119 (MQ=255) cGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGAACACCTCTCCAATCCGCAGCTCGGCATTGTTCAGGCCAAGGGCAGCCAGGCGCGcc > 4:28748/1‑149 (MQ=255) aGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGAACACCTCTCCAATCCGCAGCTCGGCATTGTTCAGGCCAAGGGCAGCCAGGCGCGCCGTGTTCAGGGCAt < 5:290307/148‑1 (MQ=255) cACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGAACACCTCTCCAATCCGCAGCTCGGCATTGTTCAGGCCAAGGGCAGCCAGGCGCGCCGTGTTCAGGGCATggg < 5:312189/149‑1 (MQ=255) cTGctcgccacccccggataccacccggtgctgctgttcccgggtgatgacgcccaggtgctgacagcttatggcgaggcgggcgacaaacctttgctgctgatcgtgcccgacggcacctggcgcaaggcgcgcaagctgctgtacct < 7:160526‑M1/149‑147 (MQ=255) cTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGAACACCTCTCCAATCCGCAGCTCGGCATTGTTCAGGCCAAGGGCAGCCAGGCGCGCCGTGTTCAGGGCATGGGCAg > 2:1972/1‑149 (MQ=255) tGctcgccacccccggataccacccggtgctgctgttcccgggtgatgacgcccaggtgctgacagcttatggcgaggcgggcgacaaacctttgctgctgatcgtgcccgacggcacctggcgcaaggcgcgcaagctgctgtacct > 6:38565‑M1/1‑2 (MQ=255) tGctcgccacccccggataccacccggtgctgctgttcccgggtgatgacgcccaggtgctgacagcttatggcgaggcgggcgacaaacctttgct < 6:295401‑M1/97‑96 (MQ=255) tGctcgccacccccggataccacccggtgctgctgttcccgggtgatgacgcccaggtgctgacagcttatggcgaggcgggcgacaaacctttgct > 5:295401‑M1/1‑2 (MQ=255) tGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGcaggtgctgacagcttatggcgaggcgggcgacaaacctttgctgctgatcgtgcccgacggcacctggcgcaaggcgcgcaagctgctgtacct < 1:144104‑M2/148‑96 (MQ=255) gggCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGcaggtgctgacagcttatggcgaggcgggcgacaaacctttgctgctgatcgtgcccgacggcacctggcgcaaggcgcgcaagctgctgtacctg < 1:192725‑M2/148‑97 (MQ=255) | CCCCAGCGTCACCCGTGGCAGCCCCCCCAGCAACGGGTTCAGGTACAGCAGCTTGCGCGCCTTGCGCCAGGTGCCGTCGGGCACGATCAGCAGCAAAGGTTTGTCGCCCGCCTCGCCATAAGCTGTCAGCACCTGGGCGTCATCACCCGGGAACAGCAGCACCGGGTGGTATCCGGGGGTGGCGAGCAGGTCATGCAGGTCATCGAACACCTCTCCAATCCGCAGCTCGGCATTGTTCAGGCCAAGGGCAGCCAGGCGCGCCGTGTTCAGGGCATGGGCAGT > NC_002947/5134544‑5134825 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |