| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5443506 = | 78 (1.320) | 4 (0.070) | 4/236 | NT | 5.3% | coding (1274/1989 nt) | PP_4781 | sensor histidine kinase |
| ? | NC_002947 | 5443547 = | 72 (1.320) | coding (1233/1989 nt) | PP_4781 | sensor histidine kinase | |||||
AATGGCATCGACCATATCCATCATGCCTTGGGCAGACCCCACAGCCGTG‑TGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCA > NC_002947/5443358‑5443653 | aaTGGCATCGACCATATCCATCATGCCTTGGGCAGACCCCACAGCCGTG‑TGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGc > 5:319096/1‑149 (MQ=255) catcaccatgtatgccagccagctgggttcggccttgtaagtggccttgctgtcgctggcactggccgaccgcatcaacagcctgcgcgagcagcaggcacagaccttgcgcgacactgggcgtacgctggagcaactgaacctgcaac < 5:386364‑M1/1‑1 (MQ=255) catcaccatgtatgccagccagctgggttcggccttggaagtggccttgctgtcgctggcactggccgaccgcatcaacagcctgcgcgagcagcaggcacagaccttgcgcgacactgggcgtacgctggagcaactgaacctgcaac < 1:66363‑M1/1‑1 (MQ=255) atcaccatgtatgccagccagctgggttcggccttggaagtggccttgctgtcgctggcactggccgaccgcatcaacagcctgcgcgagcagcaggcacagaccttgcgcgacactgggcgtacgctggagcaactgaacctgcaaCt > 2:163129‑M1/148‑149 (MQ=255) atcaccatgtatgccagccagctgggttcggccttggaagtggccttgctgtcgctggcactggccgaccgcatcaacagcctgcgcgagcagcaggcacagaccttgcgcgacactgggcgtacgctggagcaactgaacctgcaaCt < 1:163129‑M1/2‑1 (MQ=255) atcaccatgtatgccagccagctgggttcggccttggaagtggccttgctgtcgctggcactggccgaccgcatcaacagcctgcgcgagcagcaggcacagaccttgcgcgacactgggcgtacgctggagcaactgaacctgcaaCt < 1:229077‑M1/2‑1 (MQ=255) tcaccatgtatgccagccagctgggttcggccttggaagtggccttgctgtcgctggcactggccgaccgcatcaacagcctgcgcgagcagcaggcacagaccttgcgcgacactgggcgtacgctggagcaactgaacctgcaaCTg < 6:176641‑M1/3‑1 (MQ=255) aTCGACCATATCCATCATGCCTTGGGCAGACCCCACAGCCGTG‑TGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TCCGCCGCTAGGGAGGAACGCTggacg > 3:279765/1‑146 (MQ=255) aTCGACCATATCCATCATGCCTTGGGCAGACCCCACAGCCGTG‑TGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGc > 3:77449/1‑147 (MQ=255) accatgtatgccagccagctgggttcggccttggaagtggccttgctgtcgctggcactggccgaccgcatcaacagcctgcgcgagcagcaggcacagaccttgcgcgacactgggcgtacgctggagcaactgaacctgcaaCTGGc < 3:300312‑M1/5‑1 (MQ=255) acaatatCCATCATGCCTTGGGCAGACCCCACAGCCGTGTTCCTCTTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGa < 1:126675/146‑1 (MQ=255) ccATATCCATCATGCCTTGGGCAGACCCCACAGCCGTG‑TGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAAc < 5:141398/149‑1 (MQ=255) tatgccagccagctgggttcggccttggaagtggccttgctgtcgctggcactggccgaccgcatcaacagcctgcgcgagcagcaggcacagaccttgcgcgacactgggcgtacgctggagcaactgaacctgcaaCTGGCCAGGa > 4:185320‑M1/139‑148 (MQ=255) tatCCATCATGCCTTGGGCAGACCCCACAGCCGTG‑TGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGTG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCg < 1:252468/149‑1 (MQ=255) tatCCATCATGCCTTGGGCAGACCCCACAGCCGTG‑TGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCg < 6:55227/149‑1 (MQ=255) tatCCATCATGCCTTGGGCAGACCCCACAGCCGTG‑TGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCg > 4:261576/1‑149 (MQ=255) atCCATCATGCCTTGGGCAGACCCCACAGCCGTG‑TGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGt > 7:341046/1‑149 (MQ=255) tCCATCATGCCTTGGGCAGACCCCACAGCCGTG‑TGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTc < 3:261576/149‑1 (MQ=255) tCCATCATGCCTTGGGCAGACCCCACAGCCGTG‑TGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTc < 1:223714/149‑1 (MQ=255) cTTGGGCAGACCCCACAGCCGTG‑TGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGa > 6:17900/1‑149 (MQ=255) cTTGGGCAGACCCCACAGCCGTG‑TGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGCGTGCATCAGCTCGACCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGATCATGAGTCACGCTGGCAAGGAACTAGTCCTTCAGGCGa > 4:64466/1‑149 (MQ=255) gggCAGACCCCACAGCCGTG‑TGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGAt < 8:315625/147‑1 (MQ=255) ggCAGACCCCACAGCCGTG‑TGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGc > 2:243333/1‑149 (MQ=255) agaagccACAGCCGTG‑TGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCTTCGGCAGGGCGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTcc < 3:64466/144‑1 (MQ=255) cacaGCCGTG‑TGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCTTGGCCa > 1:375556/1‑149 (MQ=255) cacaGCCGTG‑TGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCa < 5:265042/149‑1 (MQ=255) gaagtggccttgctgtcgctggcactggccgaccgcatcaacagcctgcgcgagcagcaggcacagaccttgcgcgacactgggcgtacgctggagcaactgaacctgcaaCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGc > 4:52443‑M1/112‑149 (MQ=255) acaGCCGTG‑TGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGa < 5:14435/118‑1 (MQ=255) acaGCCGTG‑TGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGa > 6:14435/1‑118 (MQ=255) agtggccttgctgtcgctggcactggccgaccgcatcaacagcctgcgcgagcagcaggcacagaccttgcgcgacactgggcgtacgctggagcaactgaacctgcaaCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCa > 5:176641‑M1/110‑149 (MQ=255) aGCCGTG‑TGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGtt > 2:66363/1‑149 (MQ=255) cGTG‑TGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTg > 8:2226/1‑147 (MQ=255) cGTG‑TGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTg > 8:7815/1‑147 (MQ=255) gtg‑tGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAg < 6:319096/149‑1 (MQ=255) gATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCt > 5:176245/1‑117 (MQ=255) gATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCt < 6:176245/117‑1 (MQ=255) tGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAg < 1:243333/149‑1 (MQ=255) gtcgctggcactgggcgacggcatcatcagcctgcgcgagcagcaggcacagaccttgcgcgacactgggcgtacgctggagcaactgaacctgcaaCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAg > 4:195070‑M1/98‑138 (MQ=255) gtcgctggcactggccgaccgcatcaacagcctgcgcgagcagcaggcacagaccttgcgcgacactgggcgtacgctggagcaactgaacctgcaaCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAg < 3:195070‑M1/41‑1 (MQ=255) ggTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGACAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGt > 6:42012/1‑149 (MQ=255) tACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTg > 7:140698/1‑149 (MQ=255) gAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTc > 4:295995/1‑148 (MQ=255) aGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTc < 5:372577/147‑1 (MQ=255) aGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTc < 5:17900/147‑1 (MQ=255) aTTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCg > 8:358915/1‑148 (MQ=255) 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gggg‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGc < 2:177949/149‑1 (MQ=255) ggg‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGAt > 1:68963/1‑139 (MQ=255) ggg‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGAt < 2:68963/139‑1 (MQ=255) ggg‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGc > 2:180727/1‑148 (MQ=255) gCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGc < 2:147048/135‑1 (MQ=255) gCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGc > 1:147048/1‑135 (MQ=255) gCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGcc > 8:263965/1‑149 (MQ=255) gCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGc < 6:43857/149‑1 (MQ=255) gCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGc > 6:300708/1‑149 (MQ=255) gCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGc > 5:134092/1‑149 (MQ=255) aTGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCTGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCa < 5:148687/143‑1 (MQ=255) aTGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCa > 6:148687/1‑143 (MQ=255) aTGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGa > 6:59638/1‑147 (MQ=255) aTGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGa > 6:386364/1‑147 (MQ=255) aTGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGGCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACa < 8:140698/149‑1 (MQ=255) gTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCaa < 6:63494/149‑1 (MQ=255) gTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCaa < 1:180727/149‑1 (MQ=255) aCGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAgg < 7:7815/148‑1 (MQ=255) aCGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAgg < 7:2226/148‑1 (MQ=255) gCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCa < 5:59638/149‑1 (MQ=255) | AATGGCATCGACCATATCCATCATGCCTTGGGCAGACCCCACAGCCGTG‑TGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCA > NC_002947/5443358‑5443653 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |