New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5443506 = | 78 (1.320) | 4 (0.070) | 4/236 | NT | 5.3% | coding (1274/1989 nt) | PP_4781 | sensor histidine kinase |
? | NC_002947 | 5443547 = | 72 (1.320) | coding (1233/1989 nt) | PP_4781 | sensor histidine kinase |
AGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACATGGTGATG > NC_002947/5443400‑5443694 | aGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGtt > 2:66363/1‑149 (MQ=255) cGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTg > 8:7815/1‑147 (MQ=255) cGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTg > 8:2226/1‑147 (MQ=255) gtgtGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAg < 6:319096/149‑1 (MQ=255) tGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAg < 1:243333/149‑1 (MQ=255) ggTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGACAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGt > 6:42012/1‑149 (MQ=255) tACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTg > 7:140698/1‑149 (MQ=255) gAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTc > 4:295995/1‑148 (MQ=255) aGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTc < 5:17900/147‑1 (MQ=255) aGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTc < 5:372577/147‑1 (MQ=255) aTTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCg > 8:358915/1‑148 (MQ=255) tCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGGATTCCGCGGGTATTGAGTCCCGCTGGCAAGGAAATGGTCGTACAGGCGATTGCACCTGGCCATTTGCAGGTTCTTTTGGACCAGCTTa > 1:108711/1‑149 (MQ=255) cAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGc > 3:286308/1‑149 (MQ=255) ccccATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAg > 2:43840/1‑149 (MQ=255) cATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAgtgt > 1:158632/1‑149 (MQ=255) gCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGcc > 8:221226/1‑138 (MQ=255) gCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGcc < 7:221226/138‑1 (MQ=255) gCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTcgcg > 5:63494/1‑148 (MQ=255) tgCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCt < 2:158632/148‑1 (MQ=255) cATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCtgtg < 3:295995/149‑1 (MQ=255) cATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCtgt < 7:358915/148‑1 (MQ=255) tCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAg < 8:362885/129‑1 (MQ=255) tCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGcc < 2:108711/149‑1 (MQ=255) cTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCctgct > 5:96864/1‑149 (MQ=255) cTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCctgct > 5:43857/1‑149 (MQ=255) agcCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAgtg < 6:315571/119‑1 (MQ=255) agcCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAgtg > 5:315571/1‑119 (MQ=255) agcCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCAcgcg > 3:77971/1‑148 (MQ=255) agcCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGGCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCgcgc < 4:77449/149‑1 (MQ=255) gcCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTcgcg > 2:371371/1‑147 (MQ=255) ccAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAg > 1:187684/1‑149 (MQ=255) cAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGATCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAgg > 5:203055/1‑149 (MQ=255) cTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTg < 2:342013/149‑1 (MQ=255) tCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGa > 8:74426/1‑149 (MQ=255) tCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGa > 7:355147/1‑149 (MQ=255) cGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGa < 4:286308/147‑1 (MQ=255) cGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGAt < 4:158925/148‑1 (MQ=255) gTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGc > 1:177949/1‑149 (MQ=255) ttCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCg < 6:96864/149‑1 (MQ=255) aTCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTc > 4:62234/1‑149 (MQ=255) gggg‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGc < 2:177949/149‑1 (MQ=255) ggg‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGAt > 1:68963/1‑139 (MQ=255) ggg‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGAt < 2:68963/139‑1 (MQ=255) ggg‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGc > 2:180727/1‑148 (MQ=255) gCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGc < 2:147048/135‑1 (MQ=255) gCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGc > 1:147048/1‑135 (MQ=255) gCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGcc > 8:263965/1‑149 (MQ=255) gCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGc > 5:134092/1‑149 (MQ=255) gCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGc > 6:300708/1‑149 (MQ=255) gCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGc < 6:43857/149‑1 (MQ=255) aTGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCTGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCa < 5:148687/143‑1 (MQ=255) aTGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCa > 6:148687/1‑143 (MQ=255) aTGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGa > 6:59638/1‑147 (MQ=255) aTGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGa > 6:386364/1‑147 (MQ=255) aTGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGGCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACa < 8:140698/149‑1 (MQ=255) gTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCaa < 6:63494/149‑1 (MQ=255) gTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCaa < 1:180727/149‑1 (MQ=255) aCGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAgg < 7:7815/148‑1 (MQ=255) aCGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAgg < 7:2226/148‑1 (MQ=255) gCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCa < 5:59638/149‑1 (MQ=255) ctggccaggagcaatcgcctgaaggacgagttcctggccagTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGAc < 3:195070‑M2/97‑1 (MQ=255) ctggccaggagcaatcgcctgaaggacgagttcctggccagTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGATGATGCCGTCGCCCAGTGCCAGCGAc > 4:195070‑M2/42‑138 (MQ=255) tggccaggagcaatcgcctgaaggacgagttcctggccagTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACt > 5:176641‑M2/41‑149 (MQ=255) gccaggagcaatcgcctgaaggacgagttcctggccagTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTc > 4:52443‑M2/39‑149 (MQ=255) 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AACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGc > 7:74426‑M1/1‑149 (MQ=255) gTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAAc > 4:99517/1‑149 (MQ=255) gTCCTTCAGGCGATCGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGc > 6:155542/1‑127 (MQ=255) gTCCTTCAGGCGATCGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGc < 5:155542/127‑1 (MQ=255) tCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAAcc > 2:74260/1‑149 (MQ=255) tCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAAcc > 4:135138/1‑149 (MQ=255) ttCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAg > 1:132404/1‑149 (MQ=255) ttCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTACCAAGGCCGAACCCAg > 5:271016/1‑149 (MQ=255) tCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCGGTGTCGCGCAATGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGaa < 5:271301/143‑1 (MQ=255) tCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCGGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCTACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGaa > 6:271301/1‑143 (MQ=255) ggCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGTTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAgctgg < 1:14474/149‑1 (MQ=255) ggCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAgctgg > 5:151186/1‑149 (MQ=255) gCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTATGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAg < 7:125653/144‑1 (MQ=255) gCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTATGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAg > 8:125653/1‑144 (MQ=255) gATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAgctggctg < 6:151186/149‑1 (MQ=255) gATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAgctggctg > 4:167093/1‑149 (MQ=255) aTTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGctggctgg < 7:263965/149‑1 (MQ=255) gCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCa < 6:134092/148‑1 (MQ=255) tcctggccagTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATa > 4:185320‑M2/11‑148 (MQ=255) gccagTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACATGGt < 3:300312‑M2/144‑1 (MQ=255) cagTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACATGGtga < 6:176641‑M2/146‑1 (MQ=255) agTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACATGGtgat < 1:229077‑M2/147‑1 (MQ=255) agTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACATGGtgat > 2:163129‑M2/3‑149 (MQ=255) agTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACATGGtgat < 1:163129‑M2/147‑1 (MQ=255) gTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACATGGtgatg < 1:66363‑M2/148‑1 (MQ=255) gTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTACAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACATGGtgatg < 5:386364‑M2/148‑1 (MQ=255) | AGCCGTGTGATGGTACTGAGCCATTTCAGCCCCCATCGGCAGGGTGTGCATCAGCTCGAGCGAGCCAATCACTCCGTTCATCGGGG‑‑TACGCAGCTCATGAGTCACGCTGGCCAGGAACTCGTCCTTCAGGCGATTGCTCCTGGCCAGTTGCAGGTTCAGTTGCTCCAGCGTACGCCCAGTGTCGCGCAAGGTCTGTGCCTGCTGCTCGCGCAGGCTGTTGATGCGGTCGGCCAGTGCCAGCGACAGCAAGGCCACTTCCAAGGCCGAACCCAGCTGGCTGGCATACATGGTGATG > NC_002947/5443400‑5443694 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |