New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5902127 = | 55 (0.930) | 3 (0.050) | 3/240 | NT | 5.8% | coding (910/1089 nt) | PP_5175 | HlyD family secretion protein |
? | NC_002947 | 5902217 = | 46 (0.830) | coding (820/1089 nt) | PP_5175 | HlyD family secretion protein |
ACCTTCAGTACCTGCATGCCGGGGTGCAGCAACTGGCCGCCGTTGACCACTACGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTTGGTGGTGGCAGTAACCGGTGCCCCCAACTGCATCCCGGGCGGCACGTCCTTGAGCCCTACCTTGAC > NC_002947/5901979‑5902274 | gtgagcctgctggacgatcccaaggtccaggcccatggcttcgtacgtgaaatcacccccacggtgtcggcgcaaagcggcaccgtacaggtcaaggtagggctcaaggacgtgccgcccgggatgcagttgggggcaccggttactgc > 1:177669‑M1/149‑149 (MQ=255) cTTCAGTACCTGCATGCCGGGGTGCAGCAACTGGCCGCCGTTGACCACTACGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCcca < 6:241132/149‑1 (MQ=255) ttCAGTACCTGCATGCCGGGGTGCAGCAACTGGCCGCCGTTGACCACTACGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGtcgccctcgccccc > 6:286819/1‑147 (MQ=255) cctgctggacgatcccaaggtccaggcccatggcttcgtacgtgaaatcacccccacggtgtcggcgcaaagcggcaccgtacaggtcaaggtagggctcaaggacgtgccgcccgggatgcagttgggggcaccggttactgccacca < 4:308913‑M1/6‑1 (MQ=255) gTACCTGCATGCCGGGGTGCAGCAACTGGCCGCCGTTGACCACTACGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCaccacc < 1:318947/149‑1 (MQ=255) gTACCTGCATGCCGGGGTGCAGCAACTGGCCGCCGTTGACCACTACGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCaccacc < 6:157780/149‑1 (MQ=255) gTACCTGCATGCCGGGGTGCAGCAACTGGCCGCCGTTGACCACTACGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCaccacc < 1:115349/149‑1 (MQ=255) gTACCTGCATGCCGGGGTGCAGCAACTGGCCGCCGTTGACCACTACGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGGGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTAGTCGCCCTCGCCCaccacc > 6:368873/1‑149 (MQ=255) gctggacgatcccaaggtccaggcccatggcttcgtacgtgaaatcacccccacggtgtcggcgcaaagcggcaccgtacaggtcaaggtagggctcaaggacgtgccgcccgggatgcagttgggggcaccggttactgCCaccacc < 7:142576‑M1/8‑1 (MQ=255) cTGCATGCCGGGGTGCAGCAACTGGCCGCCGTTGACCACTACGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCcaca > 5:322583/1‑149 (MQ=255) cTGCATGCCGGGGTGCAGCAACTGGCCGCCGTTGACCACTACGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCcaca < 4:201992/149‑1 (MQ=255) tGCCGGGGTGCAGCAACTGGCCGCCGTTGACCACTACGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGATGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCa < 7:53956/149‑1 (MQ=255) gCCGGGGTGCAGCAACTGGCCGCCGTTGACCACTACGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCccacca < 4:314749/137‑1 (MQ=255) gCCGGGGTGCAGCAACTGGCCGCCGTTGACCACTACGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCccacca > 3:314749/1‑137 (MQ=255) ccGGGGTGCAGCAACTGGCCGCCGTTGACCACTACGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAgg < 1:344034/149‑1 (MQ=255) ggCCGCCGTTGACCACTACGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTg > 8:177433/1‑149 (MQ=255) ggCCGCCGTTGACCACTACGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTg > 1:19002/1‑149 (MQ=255) ccgccgTTGACCACTACGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGt > 3:68660/1‑149 (MQ=255) cgccgTTGACCACTACGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGt > 5:311915/1‑148 (MQ=255) gccgTTGACCACTACGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCa < 8:147517/149‑1 (MQ=255) cgTTGACCACTACGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCAt < 5:326747/132‑1 (MQ=255) cgTTGACCACTACGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCAt > 6:326747/1‑132 (MQ=255) aCCACTACGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGa < 3:269717/149‑1 (MQ=255) aCCACTACGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGa > 3:118992/1‑149 (MQ=255) aCCACTACGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGa > 5:377025/1‑149 (MQ=255) cTACGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCAt < 4:118992/149‑1 (MQ=255) cTACGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCAt < 6:377025/149‑1 (MQ=255) cGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAg > 1:41588/1‑125 (MQ=255) cGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATgg < 5:194978/148‑1 (MQ=255) gTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAg > 2:223128/1‑149 (MQ=255) tCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTggg < 7:177433/148‑1 (MQ=255) cggcaccgtacaggtcaaggtagggctcaaggacgtgccgcccgggatgcagttgggggcaccggttactgCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTggg < 7:358568‑M1/78‑1 (MQ=255) gCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGc > 1:349547/1‑149 (MQ=255) gACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTACCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGt > 4:136309/1‑149 (MQ=255) aCCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGtt < 2:206569/149‑1 (MQ=255) cACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTtgg < 7:346867/149‑1 (MQ=255) cACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTtg < 4:216056/148‑1 (MQ=255) cACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTtg > 3:216056/1‑148 (MQ=255) aggtcaaggtagggctcaaggacgtgccgcccgggatgcagttgggggcaccggttactgCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTtggtggtg > 4:110019‑M1/61‑149 (MQ=255) ggtcaaggtagggctcaaggacgtgccgcccgggatgcagttgggggcaccggttactgCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTtggtggtgg > 8:358568‑M1/60‑149 (MQ=255) gCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTtggtggtgg < 6:322583/146‑1 (MQ=255) gTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTTTCGCCCTCGGCGACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTTGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTTGGCGTTGGTGGTGGCAGTAACCGGTg < 8:211867/149‑1 (MQ=255) gTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTTGGTGGTGGCAGTAACCGGTg > 1:372407/1‑149 (MQ=255) tAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTTGGTGGTGGCAGTAACCGGTGc > 3:320341/1‑149 (MQ=255) cggATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTTGGTGGTGGCAGTAACCGGTGCCCCCaa < 6:311915/149‑1 (MQ=255) ggATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTACCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTTGGTGGTGGCAGTAACCGGTGCCCCCAAc < 3:136309/149‑1 (MQ=255) cGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTTGGTGGTGGCAGTAACCGGTGCCCCCAACTGCAt < 4:68660/148‑1 (MQ=255) aCCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTTGGTGGTGGGAGTAACCGTTGCCCCCAGCTGcttgcc > 8:142576/1‑144 (MQ=255) cTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTTGGTGGTGGCAGTAACCGGTGCCCCCAACTGCATCCCgg > 7:13756/1‑149 (MQ=255) gcgcAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTTGGTGGTGGCAGTAACCGGTGCCCCCAACTGCATCCCGggcg > 1:24692/1‑149 (MQ=255) aGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTTGGTGGTGGCAGTAACCGGTGCCCCCAACTGCATCCCGGGCGGCAc > 7:308408/1‑149 (MQ=255) ttCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTTGGTGGTGGCAGTAACCGGTGccccc > 4:56629/1‑127 (MQ=255) ttCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTTGGTGGTGGCAGTAACCGGTGccccc < 3:56629/127‑1 (MQ=255) ccTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTTGGTGGTGGCAGTAACCGGTGCCCCCAACTGCATCCCGGGCGGCACGTCCtt > 6:151096/1‑148 (MQ=255) cTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTtggtg < 2:40713/100‑1 (MQ=255) cTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTtggtg > 1:40713/1‑100 (MQ=255) gTCGCCCTCGCCCACCACCCACCCGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTTGGTGGTGGCAGTAACCGGTGCCCCCAACTGCATTCCGGGCGGCACGTCCTTGAGc < 6:301599/148‑1 (MQ=255) gTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTTGGTGGTGGCAGTAACCGGTGCCCCCAACTGCATCCCGGGCGGCACGTCCTTGAGcc > 2:57656/1‑149 (MQ=255) gTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTTGGTGGTGGCAGTAACCGGTGCCCCCAACTGCATCCCGGGCGGCACGTCCTTGAGc < 5:286819/148‑1 (MQ=255) tcgccctcgcccACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTTGGTGGTGGCAGTAACCGGTGCCCCCAACTGCATCCCGGGCGGCACGTCCTTGAGccc < 1:57656/149‑1 (MQ=255) gccctcgcccACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTTGGTGGTGGCAGTAACCGGTGCCCCCAACTGCATCCCGGGCGGCACGTCCtt > 4:212271/1‑141 (MQ=255) gccctcgcccACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTTGGTGGTGGCAGTAACCGGTGCCCCCAACTGCATCCCGGGCGGCACGTCCtt < 3:212271/141‑1 (MQ=255) gccctcgcccACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTTGGTGGTGGCAGTAACCGGTGCCCCCAACTGCATCCCGGGCGGCACGTCCTTGAGCCCt < 2:24692/148‑1 (MQ=255) tcgcccACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGCTCAGTGCCCACCATGGCAGCACCATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTTGGTGGTGGCAGTAACCGGTGCCCCCAACTGCATCCCGGGCGGCACGTCCTTGAGCCCTACCtt > 5:76994/1‑149 (MQ=255) gcccACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTTGGTGGTGGCAGTAACCGGTGCCCCCAACTGCATCCCGGGCGGCACGTCCTTGAGCCCTACCTTGa > 6:24918/1‑149 (MQ=255) cccACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTTGGTGGTGGCAGTAACCGGTGCCCCCAACTGCATCCCGGGCGGCACGTCCTTGAGCCCTACCTTGAc < 1:223128/149‑1 (MQ=255) | ACCTTCAGTACCTGCATGCCGGGGTGCAGCAACTGGCCGCCGTTGACCACTACGGTCTCGCCGCCTTTCAGGCCGCTGGCGACCACGATCTTGCCGGTGAGGTAACGGCGGATTTCGACCTTGCGCAGTTCCACCTTGTCGCCCTCGCCCACCACCCACACGGCAGGCTCATGCAAGGCCTTGGTCAGTGCCGACCATGGCAGCTCGATGCTGGGCCGGCCCTGGGCGTTGGTGGTGGCAGTAACCGGTGCCCCCAACTGCATCCCGGGCGGCACGTCCTTGAGCCCTACCTTGAC > NC_002947/5901979‑5902274 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |