New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 893783 = | 51 (0.860) | 6 (0.110) | 4/236 | NT | 11.8% | coding (266/303 nt) | PP_0775 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 893872 = | 43 (0.790) | coding (177/303 nt) | PP_0775 | hypothetical protein |
TCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGA‑TGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTCGCAATCGGACGATGGCAAGGTTACACTTGTCCGCTC > NC_002947/893724‑894018 | tcGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCtggtgg > 4:125299/1‑149 (MQ=255) aTAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAg < 7:93616/149‑1 (MQ=255) aaGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGt > 1:261769/1‑149 (MQ=255) gTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTgg < 3:125299/149‑1 (MQ=255) cAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCAGCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGt < 3:118296/148‑1 (MQ=255) aaGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTAt > 6:312953/1‑149 (MQ=255) aGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATg > 2:45258/1‑149 (MQ=255) gAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATgg < 5:360284/149‑1 (MQ=255) aTTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCg < 7:303191/149‑1 (MQ=255) aGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCa < 2:209124/148‑1 (MQ=255) ggTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCg < 2:261769/149‑1 (MQ=255) aTCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGt > 3:181472/1‑149 (MQ=255) tCGGCCCCTTCTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTg < 4:300174/149‑1 (MQ=255) ggCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGTGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGc > 2:122893/1‑149 (MQ=255) gCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCg < 4:162553/136‑1 (MQ=255) gCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCg > 3:162553/1‑136 (MQ=255) gCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGcc < 7:288763/149‑1 (MQ=255) cccTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCctt < 1:43509/149‑1 (MQ=255) 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CCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCtgat > 5:312953‑M1/1‑149 (MQ=255) CCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCtgat > 2:331185‑M1/1‑149 (MQ=255) GCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCtgatga < 2:219516‑M1/148‑1 (MQ=255) CCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATgg > 7:329378‑M1/1‑102 (MQ=255) CCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATgg < 8:329378‑M1/102‑1 (MQ=255) aaGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCg < 1:206599/149‑1 (MQ=255) aaGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCg > 5:177313/1‑149 (MQ=255) aGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGt < 6:230377/149‑1 (MQ=255) aaaGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGt > 3:359164/1‑145 (MQ=255) aaaGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGt < 4:359164/145‑1 (MQ=255) aaGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATc < 4:233423/149‑1 (MQ=255) gCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCtgat > 1:357701/1‑132 (MQ=255) gCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCtgat < 2:357701/132‑1 (MQ=255) gCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGa > 1:360747/1‑149 (MQ=255) ccGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGA‑t < 6:177313/149‑1 (MQ=255) gATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGTGCAGGTCCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGA‑Tgg < 1:122893/149‑1 (MQ=255) gATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGA‑Tgg < 4:181472/149‑1 (MQ=255) gcgcACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACTGCGGCTGCTGGAGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGAGGCCTTCTTCATCCTGATGAAAGCCGATGATCCGACTGA‑TGGGCCGTTGc > 5:256739/1‑149 (MQ=255) gacccggcacaacgtgcgcaacacatcggccagcctttcgcttgcggctggtgGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCATCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGA‑TGGGCCGTTGCTc < 8:114512‑M2/96‑1 (MQ=255) gacccggcacaacgtgcgcaacacatcggccagcctttcgcttgcggctggtgGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCATCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGA‑TGGGCCGTTGCTc < 8:109180‑M2/96‑1 (MQ=255) gtgCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGA‑TGGGCCGTTGCTCGTCTGca > 7:124096/1‑149 (MQ=255) ccGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGt < 3:17353/114‑1 (MQ=255) ccGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGt > 4:17353/1‑114 (MQ=255) ccGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGA‑TGGGCCGTTGCTCGTCTGcacc < 2:360747/148‑1 (MQ=255) cGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGA‑TGGGCCGTTGCTCGTCTGcaccac > 7:151386/1‑149 (MQ=255) tCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGA‑TGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCATGTTc < 5:307491/149‑1 (MQ=255) cgcaacacatcggccagcctttcgcttgcggctggtgGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGA‑TGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTCg < 2:36389‑M2/112‑1 (MQ=255) gCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGA‑TGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTCGCaa > 3:206579/1‑149 (MQ=255) aCCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGATTGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTCGCAAt < 1:45258/149‑1 (MQ=255) ccAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGA‑TGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTCGCAATCg > 2:157043/1‑148 (MQ=255) tgccACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGt > 4:238944/1‑88 (MQ=255) tgccACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGt < 3:238944/88‑1 (MQ=255) aCGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGA‑TGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTCGCAATCGGACGATGGCAAGGTTaca < 8:151386/149‑1 (MQ=255) cggctggtgGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGA‑TGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTCGCAATCGGACGATGGCAAGGTTACACTTg > 1:256861‑M2/10‑149 (MQ=255) tgGCTCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCTCCCAGTGGCATTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGAGTGA‑TGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTCGCAATCGTACGATGTCAAGGTTACACTTGTCCGctc < 6:256739‑M2/147‑1 (MQ=255) | TCGAAATAAGCGGTGCAAGAAATTAGCGGTCAAGGGTAGCGCTATCGGCCCCTTGTGCGCACCAGCCGCAAGCGAAAGGCTGGCCGATGTGTTGCGCACGTTGTGCCGGGTCGAGCACCCAGGGGCGTGCCTGCCACGGCGGCTGGTGGCGCAGGTGCTGGGTATGGCCGCACGAAAGTTCCGCCACCCAGTGGCCTTCTTCGTCCTGATGAAAGCCGTTGATCCGACTGA‑TGGGCCGTTGCTCGTCTGCACCACGTTCGCAATCGGACGATGGCAAGGTTACACTTGTCCGCTC > NC_002947/893724‑894018 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |