New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1357142 | 58 (0.980) | 3 (0.050) | 3/244 | NT | 5.0% | coding (323/1608 nt) | PP_1182 | sensor histidine kinase |
? | NC_002947 | = 1357169 | 58 (1.030) | coding (350/1608 nt) | PP_1182 | sensor histidine kinase |
GATCTGGGAACGCCTGCTTGGCGTGCAGTTGGCGCTGCAGCCGATGAGCGCACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAATTGGTGCGCTACCCGGTAGCCGAACAGCAGCAGCGTCTGGCACAGATCAAGCA > NC_002947/1357023‑1357310 | gATCTGGGAACGCCTGCTTGGCGTGCAGTTGGCGCTGCAGCCGATGAGCGCACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTgg < 7:305654‑M2/149‑3 (MQ=255) aTCTGGGAACGCCTGCTTGGCGTGCAGTTGGCGCTGCAGCCGATGAGCGCACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTggg < 2:48422‑M2/149‑4 (MQ=255) aTCTGGGAACGCCTGCTTGGCGTGCAGTTGGCGCTGCAGCCGATGAGCGCACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTgg > 4:127253‑M2/1‑146 (MQ=255) ggAACGCCTGCTTGGCGTGCAGTTGGCGCTGTAGCCGATGAGCGCACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAgg < 8:39323/149‑1 (MQ=255) ggAACGCCTGCTTGGCGTGCAGTTGGCGCTGCAGCCGATGAGCGCACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAg > 7:197065/1‑148 (MQ=255) ggAACGCCTGCTTGGCGTGCAGTTGGCGCTGCAGCCGATGAGCGCACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAg > 2:285704/1‑148 (MQ=255) aaCGCCTGCTTGGCGTGCAGTTGGCGCTGCAGCCGATGAGCGCACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGaa < 5:158555/149‑1 (MQ=255) aCGCCTGCTTGGCGTGCAGTTGGCGCTGCAGCCGATGAGCGCACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGGCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAg < 7:111423/149‑1 (MQ=255) cGCCTGCTTGGCGTGCAGTTGGCGCTGCAGCCGATGAGCGCACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCATGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGa < 2:146152/149‑1 (MQ=255) gCCTGCTTGGCGTGCAGTTGGCGCTGCAGCCGATGAGCGCACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGAc < 4:358363/149‑1 (MQ=255) cTTGGCGTGCAGTTGGCGCTGCAGCCGATGAGCGCACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGAt < 3:146348/149‑1 (MQ=255) gCGTGCAGTTGGCGCTGCAGCCGATGAGCGCACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCt < 6:321162/148‑1 (MQ=255) gCGTGCAGTTGGCGCTGCAGCCGATGAGCGCACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTg < 7:30958/149‑1 (MQ=255) gCGTGCAGTTGGCGCTGCAGCCGATGAGCGCACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTg < 3:226288/149‑1 (MQ=255) tGCAGTTGGCGCTGCAGCCGATGAGCGCAGGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCACAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTc < 5:255084/149‑1 (MQ=255) gTTGGCGCTGCAGCCGATGAGCGCACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTcgcg > 4:289311/1‑148 (MQ=255) tGGCGCTGCAGCCGATGAGCGCACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCa < 6:119608/148‑1 (MQ=255) ggCGCTGCAGCCGATGAGCGCACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTcgcg > 2:370498/1‑145 (MQ=255) gcgcTGCAGCCGATGAGCGCACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTgg < 3:162476‑M2/118‑3 (MQ=255) gcgcTGCAGCCGATGAGCGCACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTgg > 4:162476‑M2/1‑116 (MQ=255) gcgcTGCAGCCGATGAGCGCACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGAt < 7:135200/149‑1 (MQ=255) cgcTGCAGCCGATGAGCGCACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATc < 4:291661/149‑1 (MQ=255) cTGCAGCCGATGAGCGCACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCa > 8:222681/1‑148 (MQ=255) cAGCCGATGAGCGCACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCaaa < 1:285704/147‑1 (MQ=255) aGCGCACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCg < 1:370498/148‑1 (MQ=255) gcgcACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAg > 1:187547/1‑149 (MQ=255) gcgcACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAg > 3:162897/1‑149 (MQ=255) gcacgcaGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCa < 6:262325/149‑1 (MQ=255) gACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCgg < 3:289311/147‑1 (MQ=255) gTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCAcc < 2:187547/149‑1 (MQ=255) ccAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCctct < 4:162897/149‑1 (MQ=255) cGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCtctatc > 7:272581/1‑148 (MQ=255) cgcgcCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGGCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGCCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTg < 4:227502/149‑1 (MQ=255) gcgcCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTgg > 3:245383/1‑149 (MQ=255) tACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCcgacg > 5:493/1‑148 (MQ=255) ccGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGCTCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCCCCCTCTATCTATTGGCCGACGAAt > 7:54981/1‑149 (MQ=255) ccGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCcgacga > 1:48164/1‑147 (MQ=255) ccGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCcgacga < 2:48164/147‑1 (MQ=255) ccGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAAt > 6:365393/1‑149 (MQ=255) ccGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAAt > 3:308376/1‑149 (MQ=255) gTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAATTg < 6:72548/149‑1 (MQ=255) ggCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCAcc < 7:220709/123‑1 (MQ=255) ggCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCAcc > 8:220709/1‑123 (MQ=255) ggtCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAATTGGTGCGCTACCCgg < 6:33276/149‑1 (MQ=255) gggcGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGAGCAAGTGCTACTCAAGGTGGTCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAACCAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAATTGGTTCGCTACCCgg < 8:272581/146‑1 (MQ=255) gtCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAATTGGTGCGCTACCCgg < 4:245383/148‑1 (MQ=255) gagaAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAATTGGTg < 5:38794/135‑1 (MQ=255) gagaAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAATTGGTg > 6:38794/1‑135 (MQ=255) gagaAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAATTGGTGCGCTACCCggagct > 7:288300/1‑145 (MQ=255) gagaAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAATTGGTGCGCTACCCg < 8:288300/144‑1 (MQ=255) ataagaTTGGCCCGCATGCGGAGCAAGTGCTACCCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTTATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAATTGGTGCGCTACCCGGTAGcc < 7:235612/147‑1 (MQ=255) agaagaTTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAATTGGTGCGCTACCCGGTAGcc < 4:308376/149‑1 (MQ=255) gaagaTTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGGCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAATTGGTGCGCTACCCGGTAGCCg < 8:197065/149‑1 (MQ=255) gaTTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTgggccaatcttctcgaccaccaccaggccacggtacaggcgcgccccctggccaccgtcaaggctgcgtgcgctcatcggctgcagcgccaactgcacgccaagcaggcgttc < 6:192017‑M2/149‑114 (MQ=255) tGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTgggccaatcttctcgaccaccaccaggccacggtacaggcgcgcccgctggccaccgtcaaggctgcgtgcgctcatcggctgcagcgccaactgcacgccaagcaggcgttcc < 6:158710‑M2/147‑115 (MQ=255) gCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAATTGGTGCGCTACCCGGTAGCCGAAcagcag > 1:207058/1‑149 (MQ=255) gCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAATTGGTGCGCTACCCGGTAGCCGAAcagcag < 7:222681/149‑1 (MQ=255) cccGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTgggccaatcttctcgaccaccaccaggccacggtacaggcgcgcccgctggccaccgtcaaggctgcgtgcgctcatcggctgcagcgccaactgcacgccaagcaggcgttcccagat > 5:192017‑M2/1‑30 (MQ=255) cATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGGGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATC‑AACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAATTGGTGCGCTACCCGGTAGCCGAACAGCAGCAGCGt < 4:209400/149‑1 (MQ=255) cggcgCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAATTGGTGCGCTACCCGGTAGCCGAACAGCAGCAGCGTCTg > 7:309992/1‑149 (MQ=255) gcAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAATTGGTGCGCTACCCGGTAGCCGAACAGCAGCAGCGTCTGGca > 1:314444/1‑148 (MQ=255) aaGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGGGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAATTGGTGCGCTACCCGGTAGCCGAAcag < 4:346813/131‑1 (MQ=255) aaGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGGGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAATTGGTGCGCTACCCGGTAGCCGAAcag > 3:346813/1‑131 (MQ=255) gCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAATTGGTGCGCTACCCGGTAGCCGAACAGCAGCAGCGTCTGGCACAGATc > 5:256860/1‑148 (MQ=255) cTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAATTGGTGCGCTACCCGGTAGCCGAACAGCAGCAGCGTCTGGCACAGATCa < 5:365393/148‑1 (MQ=255) aCGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAATTGGTGCGCTACCCGGTAGCCGAACAGCAGCAGCGTCTGGCACAGATCAAg > 5:205470/1‑148 (MQ=255) cGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCTAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAATTGGTGCGCTACCCGGTAGCCGAACAGCAGCAGCGTCTGGCACAGATCAAGCa < 6:493/149‑1 (MQ=255) cGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAATTGGTGCGCTACCCGGTAGCCGAACAGCAGCAGCGTCTGGCACAGATCAAg > 4:164707/1‑147 (MQ=255) cGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAATTGGTGCGCTACCCGGTAGCCGAACAGCAGCAGCGTCTGGCACAGATCAAGCa < 3:164707/149‑1 (MQ=255) cGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGGTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGAAGAATTGGTGCGCTACCCGGTAGCCGAACAGCAGCAGCGTCTGGCACAGATCAAGc < 8:305654/148‑1 (MQ=255) gCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTgg > 4:50113/1‑87 (MQ=255) | GATCTGGGAACGCCTGCTTGGCGTGCAGTTGGCGCTGCAGCCGATGAGCGCACGCAGCCTTGACGGTGGCCAGCGGGCGCGCCTGTACCGTGGCCTGGTGGTGGTCGAGAAGATTGGCCCGCATGCGGCGCAAGTGCTACGCAAGGTGGGCCAGGAAGACCTGATGCTGGTCGCGCAGATCAAACAGATCAGCGAGCAGTTGGCGCGGGCCACCCTCTATCTATTGGCCGACGAATTGGTGCGCTACCCGGTAGCCGAACAGCAGCAGCGTCTGGCACAGATCAAGCA > NC_002947/1357023‑1357310 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |