New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4407467 | 75 (1.270) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 5.2% | coding (377/1299 nt) | PP_3889 | putative Phage integrase |
? | NC_002947 | = 4407483 | 74 (1.310) | coding (361/1299 nt) | PP_3889 | putative Phage integrase |
TGCCGAACATCTGTCGCAGGTAGGACAGGGACAGCTTGGCCTGGCCGGGCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGTGGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTC > NC_002947/4407339‑4407630 | tGCCGAACATCTGTCGCAGGTAGGACAGGGACAGCTTGGCCTGGCCGGGCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTggca > 6:39227‑M2/1‑145 (MQ=255) cGAACATCTGTCGCAGGTAGGACAGGGACAGCTTGGCCTGGCCGGGCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCTGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGcc < 1:248764/149‑1 (MQ=255) gAACATCTGTCGCAGGTAGGACAGGGACAGCTTGGCCTGGCCGGGCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGAGCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCt < 6:256926/149‑1 (MQ=255) gAACATCTGTCGCAGGTAGGACAGGGACAGCTTGGCATGGCCGGGCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGATGCGCGGGTGGCAGCCt > 7:344139/1‑149 (MQ=255) gTCGCAGGTAGGACAGGGACAGCTTGGCCTGGCCGGGCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCttt > 7:222386/1‑149 (MQ=255) gCAGGTAGGACAGGGACAGCTTGGCCTGGCCGGGCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTg > 2:377199/1‑147 (MQ=255) ccAGGTAGGACAGGGACAGCTTGGCCTGGCCGGGCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGc < 5:333376/147‑1 (MQ=255) aGGTAGGACAGGGACAGCTTGGCCTGGCCGGGCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGa > 4:345844/1‑149 (MQ=255) acagggacagCTTGGCCTGGCCGGGCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAg < 7:290585/149‑1 (MQ=255) acagggacagCTTGGCCTGGCCGGGCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAg > 5:10922/1‑149 (MQ=255) acagCTTGGCCTGGCCGGGCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCa > 1:12882/1‑149 (MQ=255) cagCTTGGCCTGGCCGGGCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCAt < 5:138712/149‑1 (MQ=255) agCTTGGCCTGGCCGGGCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATg < 2:12882/149‑1 (MQ=255) gCTTGGCCTGGCCGGGCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATgg > 8:232779/1‑149 (MQ=255) gCTTGGCCTGGCCGGGCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATgg < 1:377199/149‑1 (MQ=255) cTTGGCCTGGCCGGGCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGc > 7:228970/1‑149 (MQ=255) ttGGCCTGGCCGGGCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGTGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCt > 4:201642/1‑149 (MQ=255) ggcctggccGGGCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCt < 3:345844/147‑1 (MQ=255) gcctggccGGGCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCa < 7:232779/148‑1 (MQ=255) gccGGGCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCTGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGt > 3:316353/1‑149 (MQ=255) gccGGGCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGt > 6:205640/1‑149 (MQ=255) gcagctccAGATCAGGAGCTTATCAATAAGCTCGGCGGTGATGTACTAGAACTGCAGATAGCCTAATCACGGCAGCACATGCTCACCAAATCCTGAGAGGTATGCAGCCGTACGCTTTTCATACAACAACCTATCATGGATCATGCGGt > 6:320426/7‑149 (MQ=255) ccGGGCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTc < 8:228970/149‑1 (MQ=255) gggCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGATCTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGa < 1:315617/149‑1 (MQ=255) ggCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCttt < 2:190302/114‑1 (MQ=255) ggCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCttt > 1:190302/1‑114 (MQ=255) gCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACa > 5:374021/1‑149 (MQ=255) aGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATAc < 8:222386/149‑1 (MQ=255) aGGTGCTTATCAATCATCGCGGCTCTGATTTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGGGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGATCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGt < 8:344139/148‑1 (MQ=255) ggTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTc > 5:134605/1‑148 (MQ=255) gTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTc > 3:256286/1‑147 (MQ=255) tGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTCATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAg < 3:216086/149‑1 (MQ=255) ttATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAg > 3:364837/1‑149 (MQ=255) atcaatcaGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGTGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAg < 3:201642/147‑1 (MQ=255) tcaatcaGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGtt < 5:205640/148‑1 (MQ=255) caatcaGCTCGGCGGTGAAGTACTTGATCCGCAGATAGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCAAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGACGTCGACATACCAGTACAGCAGATgg > 4:261025/1‑149 (MQ=255) aatcaGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGGAGATCGCCTAAGCACGTCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTgg < 5:320426/148‑1 (MQ=255) aatcaGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTgg < 4:364837/148‑1 (MQ=255) aatcaGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTg < 2:260543/147‑1 (MQ=255) aatcaGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTg > 1:260543/1‑147 (MQ=255) tcaGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATc < 4:56820/109‑1 (MQ=255) tcaGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATc > 3:56820/1‑109 (MQ=255) gatCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCTGATCGACTAAGCACCTCCGAACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCATACAACGAGAGATCATGGCTCATGCTTTCGACATACCATTCGAGAAGTTGTccaaag > 6:138136/3‑145 (MQ=255) gCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGt < 4:33403/132‑1 (MQ=255) gCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGt > 3:33403/1‑132 (MQ=255) gCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACg < 4:256286/149‑1 (MQ=255) gCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACg < 6:134605/149‑1 (MQ=255) cggTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGcc < 6:374021/149‑1 (MQ=255) cggTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGc > 5:20232/1‑148 (MQ=255) ggTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCa > 3:13467/1‑149 (MQ=255) gTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGccc > 7:260773/1‑148 (MQ=255) cTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCACGaca > 5:226930/1‑149 (MQ=255) ggCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACcg < 6:10922/148‑1 (MQ=255) gCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACcggt > 8:45143/1‑149 (MQ=255) cAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTTGCCCACGGGGGCCATGCCCGACACTACcggtg < 3:163396/149‑1 (MQ=255) gATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACcggtgcg > 7:273048/1‑149 (MQ=255) ccTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGTGGc > 7:175153/1‑149 (MQ=255) cTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGTGGcc > 1:100410/1‑149 (MQ=255) tAAGCAGGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGTGGCCg > 8:141824/1‑149 (MQ=255) aGCACGGCTGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGTGGCCgg < 4:316353/148‑1 (MQ=255) aGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGTGGCCgg < 8:175153/148‑1 (MQ=255) gCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGTGGCCGGGt > 3:263440/1‑149 (MQ=255) cACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGTGGcc > 4:25586/1‑144 (MQ=255) cACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGTGGcc < 3:25586/144‑1 (MQ=255) aCGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGAGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGTGGCCGGGTgg > 2:361026/1‑149 (MQ=255) ggCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTggcagcatgtgcggccgtgcttaggcgatctgccgatcaagtacatcaccgccgagctgattgataagcacctgatctggcccggccaggccaagctgtccctgtcctacctgcga < 2:51962‑M2/148‑117 (MQ=255) ccGCACATGCTGCCCAATTTCTGCGCGGGTCGCAGCCTTAAGCTATGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGAGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGTGGCCGGGTGgcgc > 8:7373/1‑148 (MQ=255) gCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGTGGCCGGGTGGCGCAt > 6:252324/1‑148 (MQ=255) acaTGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTggcagcatgtgcggccgtgcttaggcgatctgccgatcaagtacatcaccgccgagctgattgataagcacctgatctggcccggccaggccaag > 4:170578‑M2/1‑26 (MQ=255) acaTGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTggcagcatgtgcggccgtgcttaggcgatctgccgatcaagtacatcaccgccgagctgattgataagcacctgatctggcccggccaggccaag < 3:170578‑M2/121‑96 (MQ=255) acaTGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGTGGCCGGGTGGCGCATCAg > 6:48590/1‑149 (MQ=255) caTGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGTGGCCGGGTGGCGCATCAgg < 7:45143/149‑1 (MQ=255) caTGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTAGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGTGGCCGGGTGGCGCATCAgg < 8:260773/149‑1 (MQ=255) aTGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTggcagcatgtgcggccgtgcttaggcgatctgccgatcaagtacatcaccgccgagctgattgataagcacctgatctggcccggccaggccaagctgtccctgtcctacctgcgacagatgttc < 4:266969‑M2/149‑126 (MQ=255) tgctgcCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGTGGCCGGGTGGCGCATCAGgcg > 6:58609/1‑149 (MQ=255) cccAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGTGGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGa < 4:13467/148‑1 (MQ=255) cccAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGTGGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGa < 5:48590/148‑1 (MQ=255) cccAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGTGGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGAc > 8:35075/1‑149 (MQ=255) ccAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGTGGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACg < 8:273048/149‑1 (MQ=255) gctgcGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCTATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGTGGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAgcg < 6:20232/148‑1 (MQ=255) cgcgGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGTGGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCggg > 4:343884/1‑148 (MQ=255) cgcgGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGTGGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCggg < 7:141824/148‑1 (MQ=255) ggTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCCCGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGTGGCCGGGTGGCGCAGCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCt > 8:205778/1‑149 (MQ=255) gTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGTGGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTc > 8:3246/1‑149 (MQ=255) | TGCCGAACATCTGTCGCAGGTAGGACAGGGACAGCTTGGCCTGGCCGGGCCAGATCAGGTGCTTATCAATCAGCTCGGCGGTGATGTACTTGATCGGCAGATCGCCTAAGCACGGCCGCACATGCTGCCCAATTGCTGCGCGGGTGGCAGCCTTACGCTTTGCAGACAACGAGCGATCATGGCTCATGCGGTCGACATACCAGTCGAGCAGTTGGCCCACGGTGGCCATGCCCGACACTACCGGTGCGGTGGCCGGGTGGCGCATCAGGCGCTGACGCAGCGCGGGCAGCTC > NC_002947/4407339‑4407630 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |