New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5135362 | 66 (1.120) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 5.8% | coding (1208/1566 nt) | PP_4521 | aerotaxis receptor |
? | NC_002947 | = 5135384 | 68 (1.210) | coding (1186/1566 nt) | PP_4521 | aerotaxis receptor |
GCCGCCTGCACCGCCTCGACACTGTGCACACTGTCCCGGGAAATCTGCTCGCCCCGGCTGGCAGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGCTCGGCAATCGAAGTGATCACGTCGACCACACTACCAATCGACTGGGTCT > NC_002947/5135236‑5135530 | gccgccTGCACCGCCTCGACACTGTGCACACTGTCCCGGGAAATCTGCTCGCCCCGGCTGGCAGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCaa > 7:23726/1‑149 (MQ=255) ccgccTGCACCGCCTCGACACTGTGCACACTGTCCCGGGAAATCTGCTCGCCCCGGCTGGCAGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAAc < 1:183865‑M2/149‑2 (MQ=255) cACCGCCTCGACACTGTGCACACTGTCCCGGGAAATCTGCTCGCCCCGGCTGGCAGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAAcgaccg > 5:31700‑M2/1‑141 (MQ=255) aCCGCCTCGACACTGTGCACACTGTCCCGGGAAATCTGCTCGCCCCGGCTGGCAGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTTCGCTGCGCACAcgaccgacc < 6:264060‑M2/149‑10 (MQ=255) aCCGCCTCGACACTGTGCACACTGTCCCGGGAAATCTGCTCGCCCCGGCTGGCAGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCAc < 4:222888/149‑1 (MQ=255) aCCGCCTCGACACTGTGCACACTGTCCCGGGAAATCTGCTCGCCCCGGCTGGCAGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCAc > 2:198392/1‑149 (MQ=255) cTCGACACTGTGCACACTGTCCCGGGAAATCTGCTCGCCCCGGCTGGCAGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCtca‑t < 3:59363/149‑1 (MQ=255) cTCGACACTGTGCACACTGTCCCGGGAAATCTGCTCGCCCCGGCTGGCAGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCtca > 5:68097/1‑148 (MQ=255) gACACTGTGCACACTGTCCCGGGAAATCTGCTCGCCCCGGCTGGCAGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAg > 7:340705/1‑149 (MQ=255) tgtgCACACTGTCCCGGGAAATCAGCTCGCCCCGGCTGGCAGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGccac > 2:108202/1‑148 (MQ=255) ccGGGAAATCTGCTCGCCCCGGCTGGCAGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGc < 4:12685/132‑1 (MQ=255) ccGGGAAATCTGCTCGCCCCGGCTGGCAGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGc > 3:12685/1‑132 (MQ=255) aTCTGCTCGCCCCGGCTGGCAGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTg < 8:23726/149‑1 (MQ=255) tCTGCTCGCCCCGGCTGGCAGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGc > 1:222276/1‑149 (MQ=255) cTCGCCCCGGCTGGCAGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCa < 2:108809/148‑1 (MQ=255) tCGCCCCGGCTGGCAGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGc > 1:77293/1‑144 (MQ=255) tCGCCCCGGCTGGCAGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGc < 2:77293/144‑1 (MQ=255) gCCCCGGCTGGCAGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCgg < 1:198392/149‑1 (MQ=255) gCCCCGGCTGGCAGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCgg > 4:307020/1‑149 (MQ=255) gCCCCGGCTGGCAGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCgg < 4:10802/149‑1 (MQ=255) ccccGGCTGGCAGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGgc > 7:79215/1‑149 (MQ=255) ccGGCTGGCAGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGgcgc > 3:213431/1‑149 (MQ=255) gCAGTGTTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑CCCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGcgccgc > 7:104070/1‑149 (MQ=255) gCAGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGcgccgc > 7:250048/1‑149 (MQ=255) cAGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCt > 4:251513/1‑149 (MQ=255) aGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCtt < 5:115946/149‑1 (MQ=255) ttCACCGCTCGCTCCTCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAAt < 7:155766/148‑1 (MQ=255) cTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAAt > 7:213364/1‑149 (MQ=255) aCCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCtt < 2:97998/142‑1 (MQ=255) aCCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCtt > 1:97998/1‑142 (MQ=255) aCCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATggc > 8:341901/1‑149 (MQ=255) aCCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATggc > 6:20352/1‑149 (MQ=255) gctcgctcCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATggcggc < 6:340888/149‑1 (MQ=255) gctcgctcCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATggcggc > 8:78596/1‑149 (MQ=255) ctcgctcCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATggcgg < 5:213935/147‑1 (MQ=255) ctcgctcCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATggcgg > 6:213935/1‑147 (MQ=255) gctcCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGGGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCACTCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGt < 1:108202/148‑1 (MQ=255) tcCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAg > 3:308039/1‑149 (MQ=255) tcCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTATTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCAAGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAg > 8:31496/1‑149 (MQ=255) ccGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGTCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCg < 6:262306/119‑1 (MQ=255) ccGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCg > 5:262306/1‑119 (MQ=255) cGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAgc < 2:222276/148‑1 (MQ=255) gCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACGCACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGaa < 1:22067/99‑1 (MQ=255) gCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGaa > 2:22067/1‑98 (MQ=255) gCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAgcgc < 7:341901/149‑1 (MQ=255) gCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAgcgc < 3:68762/149‑1 (MQ=255) ccccGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGcc < 3:307020/149‑1 (MQ=255) ggCCCTCAACGCGGCGATTATATGGTGT‑TGCTGTTCGGGCGACGCGGGGGTAGGCTGCGCCATCG‑ACCGCACCTCT‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGCcagca < 2:183865/149‑1 (MQ=37) tCAACGAGGCGATGATATGGTGGAATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGCCAGCAGGtt > 7:55454/1‑149 (MQ=255) aCGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGCCAGCAGGTTGGTc > 3:347212/1‑149 (MQ=255) aCGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGCCAGCAGGTTGGTc > 7:283698/1‑149 (MQ=255) aCGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGCCAGCAGGTTGGTc > 7:278458/1‑149 (MQ=255) gatgatATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGCTCgg > 6:277215/1‑149 (MQ=255) tggtgg‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCtca‑tc > 5:70054/1‑56 (MQ=255) tggtgg‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCtca‑tc < 6:70054/56‑1 (MQ=255) gtgg‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAgc < 5:322242/118‑1 (MQ=255) gtgg‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAgc > 6:322242/1‑118 (MQ=255) tgg‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATggcggc < 6:224574/110‑1 (MQ=255) tgg‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATggcggc > 5:224574/1‑110 (MQ=255) tgg‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGCTCGGCAATCGAAGt < 3:251513/149‑1 (MQ=255) tgg‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGCTCGGCAATCGAAGt < 5:264060/149‑1 (MQ=255) tgg‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGCTCGGCAATCGAAGt > 6:20254/1‑149 (MQ=255) tctTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGCTCGGCAATCGAAGTGATCAc > 4:113494/1‑149 (MQ=255) ctTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAAcgaccgaagagatccaccatatcatcgcctcgttgagggccggggcggagcgagcggtgagcactgccagccggggcgagcagatttcccgggacagtgtgcacagtgtcgaggcggt < 1:189858‑M2/149‑119 (MQ=255) cGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAAcgaccgaagagatccaccatatcatcgcctcgttgagggccggggcggagcgagcggtgagcactg > 8:4130‑M2/1‑28 (MQ=255) cGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAAcgaccgaagagatccaccatatcatcgcctcgttgagggccggggcggagcgagcggtgagcactg < 7:4130‑M2/94‑67 (MQ=255) cGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGCTCGGCAATCGAAGTGATc < 2:186693/143‑1 (MQ=255) cGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGCTCGGCAATCGAAGTGATc > 1:186693/1‑143 (MQ=255) cGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGCTCGGCAATCGAAGTGATCACGt < 4:213431/147‑1 (MQ=255) ggTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAAcgaccgaagagatccaccatatcatcgcctcgttgagggccggggcggagcgagcggtgagcactgccagccggggcgagcagatttcccgggacagtgtgcacagtgtcgaggcggtgca > 2:189858‑M2/1‑27 (MQ=255) gACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGCTCGGCAATCGAAGTGATCACGTCGACcac < 3:113494/149‑1 (MQ=255) gACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGCTCGGCAATCGAAGTGATCACGTCGACca > 7:118489/1‑148 (MQ=255) gACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGCTCGGCAATCGAAGTGATCACGTCGACca < 8:118489/148‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGCTCGGCAATCGAAGTGATc < 7:296901/136‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGCTCGGCAATCGAAGTGATc > 8:296901/1‑136 (MQ=255) cgcgGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGCTCGGCAATCGAAGTGATCACGTCGACCACACTa < 5:20254/149‑1 (MQ=255) gCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTAAAGGGCGGCTTTAACCCCAAGCAGGTTGGAAGGGACGGCAATCGAATTGAACACTGCGACCACACAACCAATCg > 8:291705/1‑147 (MQ=255) cTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGCTCGGCAATCGAAGTGATCACGTCGACCACACTACCAATCGACt < 8:55454/149‑1 (MQ=255) gcCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGCTCGGCAATCGAAGTGATCACGTCGACCACACTACCAATCGACTGGGt < 8:250048/149‑1 (MQ=255) ccAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGCTCGGCAATCGAAGTGATCACGTCGACCACACTACCAATCGACTg > 3:221243/1‑145 (MQ=255) ccAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGCTCGGCAATCGAAGTGATCACGTCGACCACACTACCAATCGACTg < 4:221243/145‑1 (MQ=255) cAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGTCGTTAAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGCTCGGCAATCGAAGTGATCACGTCGACCACACTACCAATCGACTGTGTCt < 7:31496/149‑1 (MQ=255) cAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGCTCGGCAATCGAAGTGATCACGTCGACCACACTACCAATCGACTGGGTCt > 4:85242/1‑149 (MQ=255) | GCCGCCTGCACCGCCTCGACACTGTGCACACTGTCCCGGGAAATCTGCTCGCCCCGGCTGGCAGTGCTCACCGCTCGCTCCGCCCCGGCCCTCAACGAGGCGATGATATGGTGG‑ATCTCTTCGGTCGACGCGCGGGTACGCTGCGCCAACG‑ACCGCACCTCA‑TCAGCCACCACGGCGAACCCGCGTCCTTGCTCACCGGCGCGCGCCGCTTCAATGGCGGCGTTAAGCGCCAGCAGGTTGGTCTGCTCGGCAATCGAAGTGATCACGTCGACCACACTACCAATCGACTGGGTCT > NC_002947/5135236‑5135530 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |