New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5588328 = | 82 (1.390) | 4 (0.070) | 4/242 | NT | 5.4% | coding (820/1905 nt) | parE | DNA topoisomerase IV subunit B |
? | NC_002947 | 5588393 = | 62 (1.110) | coding (755/1905 nt) | parE | DNA topoisomerase IV subunit B |
TCGCAAAACTCACGCATGGCATCCAGCAGGCCCTGGCGCAGGCCGTTGACGTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAGGTAGGAGCGCAGACCATCCTCATAGTGCCATTCCACCTTTTCGCCGCTGGCCTTGTCCTCGAAACTGACCA > NC_002947/5588249‑5588540 | tCGCAAAACTCACGCATGGCATCCAGCAGGCCCTGGCGCAGGCCGTTGACGTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTc > 3:238527/1‑149 (MQ=255) gCAAAACTCACGCATGGCATCCAGCAGGCCCTGGCGCAGGCCGTTGACGTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTcc < 4:171589/148‑1 (MQ=255) ctggtcgactcggtcaacgaattccagcgcctgcccgacgagccgttctgtggcagcctggcgggtaacaaggaagcGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCt > 4:19225‑M1/78‑149 (MQ=255) tCACGCATGGCATCCAGCAGGCCCTGGCGCAGGCCGTTGACGTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTAcc > 4:234555/1‑149 (MQ=255) cATGGCATCCAGCAGGCCCTGGCGCAGGCCGTTGACGTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCa < 2:51566/149‑1 (MQ=255) aTGGCATCCAGCAGGCCCTGGCGCAGGCCGTTGACGTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAg > 1:222018/1‑149 (MQ=255) cATCCAGCAGGCCCTGGCGCAGGCCGTTGACGTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTg < 5:42978/149‑1 (MQ=255) cATCCAGCAGGCCCTGGCGCAGGCCGTTGACGTGGCTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTg > 8:79986/1‑149 (MQ=255) aTCCAGCAGGCCCTGGCGCAGGCCGTTGACGTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCtt < 4:109577/132‑1 (MQ=255) aTCCAGCAGGCCCTGGCGCAGGCCGTTGACGTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCtt > 3:109577/1‑132 (MQ=255) aTCCAGCAGGCCCTGGCGCAGGCCGTTGACGTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGc > 3:370911/1‑149 (MQ=255) ccAGCAGGCCCTGGCGCAGGCCGTTGACGTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGc < 4:296197/139‑1 (MQ=255) ccAGCAGGCCCTGGCGCAGGCCGTTGACGTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGc > 3:296197/1‑139 (MQ=255) agcagGCCCTGGCGCAGGCCGTTGACGTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCcaca < 3:234555/149‑1 (MQ=255) agcagGCCCTGGCGCAGGCCGTTGACGTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCcaca < 4:314631/149‑1 (MQ=255) cccTGGCGCAGGCCGTTGACGTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTCTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACgg < 1:227093/149‑1 (MQ=255) ccTGGCGCAGGCCGTTGACGTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGc > 6:1517/1‑149 (MQ=255) gcgcAGGCCGTTGACGTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCtcg < 4:238527/148‑1 (MQ=255) gcAGGCCGTTGACGTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCtcgtcg > 5:80211/1‑149 (MQ=255) aGGCCGTTGACGTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCggg < 2:222018/149‑1 (MQ=255) aGGCCGTTGACGTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCggg < 7:79986/149‑1 (MQ=255) cGTTGACGTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAgg > 5:367074/1‑149 (MQ=255) gACGTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGcc < 5:108194/123‑1 (MQ=255) gACGTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGcc > 6:108194/1‑123 (MQ=255) aCGTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCAGTCCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGgcgc < 1:289753/148‑1 (MQ=255) aCGTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTg < 1:151194/149‑1 (MQ=255) gTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAgg < 6:359969/142‑1 (MQ=255) gTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAgg > 5:359969/1‑142 (MQ=255) ggTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAAt < 5:237299/148‑1 (MQ=255) gTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTc < 5:1517/149‑1 (MQ=255) ccgccCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGtt < 6:80211/149‑1 (MQ=255) ccgccCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGtt < 7:295176/149‑1 (MQ=255) cgccCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCtt > 6:265091/1‑94 (MQ=255) cgccCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCtt < 5:265091/94‑1 (MQ=255) cccTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTgg < 6:333632/138‑1 (MQ=255) cccTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTgg > 5:333632/1‑138 (MQ=255) cccTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGAc < 5:233614/149‑1 (MQ=255) ggggATCAGGGTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGTCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCa < 6:69359/149‑1 (MQ=255) aggaagcggttgactgggctttgctgtggctgcccgaaggcggcgacagcattcaggaaagctacgtcaaccGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAg > 4:19225‑M2/73‑149 (MQ=255) aTCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAgg > 7:249634/1‑147 (MQ=255) tCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAGGTAg > 7:341839/1‑149 (MQ=255) GGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCggg > 5:240193‑M1/1‑109 (MQ=255) GGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCggg < 6:240193‑M1/109‑1 (MQ=255) GTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAGGTAGGAgc < 8:230260‑M1/149‑1 (MQ=255) GTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAGGTAGGAgc < 4:291085‑M1/149‑1 (MQ=255) ACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTGGACCGAGTCGACCAGGTAGGAGCGCAg < 3:240827‑M1/149‑1 (MQ=255) gTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTAc < 7:130741/71‑1 (MQ=255) gTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTAc > 8:130741/1‑71 (MQ=255) cTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAGGTAGGAGCGCAGACCATc < 6:367074/149‑1 (MQ=255) tCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAGGTAGGAGCGCAGACCATCCt > 2:73154/1‑148 (MQ=255) cTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCATCATCAGCAAAGCCAAGTCA‑AACGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCAGAGAACGGCTCGTCGTGCATGCGCTGGAATTCGTTg < 7:164556/112‑1 (MQ=255) tGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAg > 3:23880/1‑117 (MQ=255) tGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAg < 4:23880/117‑1 (MQ=255) tGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAGGTAGGAGCGCAGACCATCCTCa > 5:338538/1‑147 (MQ=255) tgtggctgcccgaaggcggcgacagcattcaggaaagctacgtcaaccGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAGGTAGGAGCGCAGACCATCCTCa > 1:86114‑M2/49‑147 (MQ=255) gAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGAcc < 4:229066/122‑1 (MQ=255) gAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGAcc > 3:229066/1‑122 (MQ=255) aaTGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAGGTAGGAGCGCAGACCATCCTCATa < 8:341839/147‑1 (MQ=255) tggcgccgcCTTCTGGCAGCCACAGCAAAGCCCCCTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATGCGTTGACCGAGTCGACCAGGGAGGAGCGCAGACCATCCTCATAGTGc < 2:66900/143‑1 (MQ=255) tGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAGGTAGGAGCGCAGCCCATCCTCATAGTGc > 1:66900/1‑146 (MQ=255) cgaaggcggcgacagcattcaggaaagctacgtcaaccGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAGGTAGGAGCGCAGACCATCCTCATAGTGCCATTcc < 3:19225‑M2/111‑1 (MQ=255) cgccTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGAcc < 8:229597/110‑1 (MQ=255) cgccTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAGGTAGGAGCGCAGACCATCCTCATAGTGCCATTCCAcc < 8:249634/149‑1 (MQ=255) aggcggcgacagcattcaggaaagctacgtcaaccGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAGGTAGGAGCGCAGACCATCCTCATAGTGCCATTCCAcc < 2:86114‑M2/114‑1 (MQ=255) ggCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAGGTAGGAGCGCAGACCATCCTCATAGTGCCATTCCACCTTTTcgcc > 4:221986/1‑149 (MQ=255) ccACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAGGTAGGAGCGCAGACCATCCTCATAGTGCCATTCCACCTTTTCGCCGCTgg > 2:178239/1‑149 (MQ=255) ccACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAGGTAGGAGCGCAGACCATCCTCATAGTGCCATTCCACCTTTTCGCCGCTgg > 2:342153/1‑149 (MQ=255) ccACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAGGTAGGAGCGCAGACCATCCTCATAGTGCCATTCCACCTTTTCGCCGCTgg > 5:111875/1‑149 (MQ=255) acaGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAGGTAGGAGCGCAGACCATCCTCATAGTGCCATTCCACCTTTTCGCCGCTg < 8:171347/146‑1 (MQ=255) acaGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAGGTAGGAGCGCAGACCATCCTCATAGTGCCATTCCAACTTTTCGCCGCTg > 7:171347/1‑146 (MQ=255) caGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAGGTAGGAGCGCAGACCATCCTCATAGTGCCATTCCACCTTTTCGCCGCTGGCCt > 5:35735/1‑149 (MQ=255) aGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGCGTCGACCAGGTAGGAGCGCAGACCATCCTCATa > 7:21466/1‑114 (MQ=255) aGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAGGTAGGAGCGCAGACCATCCTCATa < 8:21466/114‑1 (MQ=255) cccAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGt < 5:131207/81‑1 (MQ=255) cccAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGt > 6:131207/1‑81 (MQ=255) cccAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAGGTAGGAGCGCAGACCATCCTCATAGTGCCATTCCACCTTTTCGCCGCTGGCCTTGTCCTc > 6:427/1‑148 (MQ=255) accGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAGGTAGGAGCGCAGACCATCCTCATAGTGCCATTCCACCTTTTCGCCGCTGGCCTTGTCCTCGAAACTGAc < 1:73154‑M2/146‑1 (MQ=255) ccGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTAGACAGAGTCGACCAGGTAGGAGCGCAGACCATCCTCATAGTGCCATTCCACCTTTTCGCCGCTGGCCATGTCCTCGAAACTGAc > 2:221758‑M2/3‑148 (MQ=255) cGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAGGTAGGAGCGCAGACCATCCTCATAGTGCCATTCCACCTTTTCGCCGCTGGCCTTGTCCTCGAAACTGACCa < 4:240827‑M2/148‑1 (MQ=255) | TCGCAAAACTCACGCATGGCATCCAGCAGGCCCTGGCGCAGGCCGTTGACGTGGGTGCCGCCCTGGGCGGTGGGGATCAGGTTGACGTAGCTTTCCTGAATGCTGTCGCCGCCTTCGGGCAGCCACAGCAAAGCCCAGTCA‑ACCGCTTCCTTGTTACCCGCCAGGCTGCCACAGAACGGCTCGTCGGGCAGGCGCTGGAATTCGTTGACCGAGTCGACCAGGTAGGAGCGCAGACCATCCTCATAGTGCCATTCCACCTTTTCGCCGCTGGCCTTGTCCTCGAAACTGACCA > NC_002947/5588249‑5588540 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |