| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 364761 | 74 (1.230) | 4 (0.070) | 4/250 | NT | 5.2% | coding (841/945 nt) | caiX | carnitine uptake ABC transporter substrate‑binding protein |
| ? | NC_002947 | = 364794 | 75 (1.330) | coding (808/945 nt) | caiX | carnitine uptake ABC transporter substrate‑binding protein | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
GCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCACCGTCCACACC > NC_002947/364616‑364906 | gcTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCg < 2:4989/149‑1 (MQ=255) cccGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTCGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGa > 4:268172/1‑149 (MQ=255) ctgTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGAt < 7:298635/147‑1 (MQ=255) gTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTc > 5:189013/1‑149 (MQ=255) ggAGCGGGCTTACCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAg < 4:296416/149‑1 (MQ=255) gAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAgc < 1:342615/149‑1 (MQ=255) ggCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTc > 3:171091/1‑149 (MQ=255) gCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCtt < 5:283233/147‑1 (MQ=255) cgcgAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGAt < 7:314993/130‑1 (MQ=255) ggCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTGTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGctcgaccacaaggacgcgctggaatcagcccgccag > 1:33738‑M1/1‑113 (MQ=255) ggCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGcagt < 6:189852‑M2/149‑5 (MQ=255) gCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCCTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGctcgaccacaaggacgcgctggaatcagcccgccagtg < 6:32913‑M1/149‑39 (MQ=255) cTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGcagtggct > 7:6785‑M2/1‑141 (MQ=255) gTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGATCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGc > 4:137505/1‑149 (MQ=255) tCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGctcgaccacaaggacgcgctggaatcagcccgccagtggctcaa < 2:33738‑M1/149‑45 (MQ=255) tCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCCCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGc < 1:10562/148‑1 (MQ=255) tCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGA‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGctcgaccacaatgacgcgctggaatcagcccgccagtggctc < 7:255646‑M1/147‑43 (MQ=255) aGTTGGCGGTAAGCTTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGcat > 5:258727/1‑148 (MQ=255) gTTGGCGGTAAGCTTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGcatca > 5:283066/1‑149 (MQ=255) gTAAGCTTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCGGAATCCACCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGc > 3:109380/1‑148 (MQ=255) tAAGCTTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTc > 5:237001/1‑124 (MQ=255) tAAGCTTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTc < 6:237001/124‑1 (MQ=255) aGCTTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCtctc < 7:179873/149‑1 (MQ=255) gCTTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGcagtg < 3:119514‑M2/129‑6 (MQ=255) gCTTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGcagtg > 4:119514‑M2/1‑124 (MQ=255) gCTTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCg < 6:258727/149‑1 (MQ=255) cTTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑GGGCTGCATCATGCGGCTCTCGt > 5:335164/1‑149 (MQ=255) ttGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCACGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCGTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTc > 6:341726/1‑149 (MQ=255) aGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTCGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTc < 4:224906/149‑1 (MQ=255) gT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCgg > 7:180445/1‑149 (MQ=255) gT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCgg > 3:343048/1‑149 (MQ=255) gT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCgg > 7:213220/1‑149 (MQ=255) gT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCgg > 4:133593/1‑149 (MQ=255) tCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACGCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCggg > 1:239501/1‑86 (MQ=255) tCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCggg < 2:239501/85‑1 (MQ=255) 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ccGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGGCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTc < 6:293302/149‑1 (MQ=255) ccGGCTGGCCATCGAACGGGGGCACTC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCCG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCGCGTCCTCGGCGCTGAACTTc < 8:232085/149‑1 (MQ=255) cGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCa < 3:105835/149‑1 (MQ=255) cTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGt < 3:133593/149‑1 (MQ=255) ttGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGtt > 6:326243/1‑149 (MQ=255) 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ggCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAATTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCgg < 1:259050/149‑1 (MQ=255) ggCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTg < 1:169365/136‑1 (MQ=255) ggCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTg > 2:169365/1‑136 (MQ=255) cTTGTCCTCGGGGGGGTACGTGAGCCACTGGCGGTCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCTTCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCCGGTTGGGCAGCAGGCGGTGGGCATTGGGGCAGCGTTCAGCAt < 4:109380/149‑1 (MQ=255) cTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCg > 6:272709/1‑149 (MQ=255) ggggTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGa < 1:267385/148‑1 (MQ=255) ggtCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTc < 6:571/149‑1 (MQ=255) gtCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATGCCAGCGCGTCCTTGTGGGCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTGGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCa < 3:268172/149‑1 (MQ=255) tCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCAc > 3:295436/1‑149 (MQ=255) tCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCAc < 5:137071/149‑1 (MQ=255) ccTTTAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCAcc > 7:245120/1‑149 (MQ=255) ccTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCAcc < 5:272709/149‑1 (MQ=255) ttGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGcagtggctcaaggaccaccccgaggacaaggcccgctggcttgagggtgtgaccaccttcgatggcaagccggctgcggacaacctcaagcttaccgccaactga < 2:33738‑M2/149‑106 (MQ=255) gAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCATTGTGGTCG‑AGcagtggctcaaggaccaccccgaggacaaggcccgctggcttgagggtgtgaccaccttcgatggcaagccggctgcggacatcctcaagcttaccgccaactga < 7:255646‑M2/147‑106 (MQ=255) aGCCACTGctcgaccacaaggacgcgctggaatcagcccgccagtggctcaaggaccaccccgaggacaaggcccgctggcttgagggtgtgaccaccttcgatggcaagccggctgcggacaacctcaagcttaccgccaactgacag > 7:6785‑M1/1‑8 (MQ=255) aGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCACCGTcc < 4:295436/148‑1 (MQ=255) ccACTGctcgaccacaaggacgcgctggaatcagcccgccagtggctcaaggaccaccccgaggacaaggcccgctggcttgagggtgtgaccaccttcgatggcaagccggctgcg < 1:31374‑M1/117‑112 (MQ=255) ccACTGctcgaccacaaggacgcgctggaatcagcccgccagtggctcaaggaccaccccgaggacaaggcccgctggcttgagggtgtgaccaccttcgatggcaagccggctgcg > 2:31374‑M1/1‑6 (MQ=255) ccACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCACCGTCcaca > 3:235574/1‑149 (MQ=255) cACTGctcgaccacaaggacgcgctggaatcagcccgccagtggctcaaggaccaccccgaggacaaggcccgctggcttgagggtgtgaccaccttcgatggcaagccggctgcggacaacctcaagc < 3:119514‑M1/129‑125 (MQ=255) cACTGctcgaccacaaggacgcgctggaatcagcccgccagtggctcaaggaccaccccgaggacaaggcccgctggcttgagggtgtgaccaccttcgatggcaagccggctgcggacaacctcaagc > 4:119514‑M1/1‑5 (MQ=255) cACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGcagtggctcaaggaccaccccgaggacaaggcccgctggcttgagggtgtgaccaccttcgatggcaagccggctgcggacaacctcaggcttaccgccaactgacagggc < 6:32913‑M2/149‑112 (MQ=255) cACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCACCGTCCacac < 3:137505/149‑1 (MQ=255) aCTGctcgaccacaaggacgcgctggaatcagcccgccagtggctcaaggaccaccccgaggacaaggcccgctggcttgagggtgtgaccaccttcgatggcaagccggctgcggacaacctcaagcttaccgccaactgacagggcc < 6:189852‑M1/149‑146 (MQ=255) aCTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCGCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCACCGTCcaca > 2:234901/1‑147 (MQ=255) cTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGcagtggctcaaggaccaccccgaggacaaggcccgctggcttgagggtgtgaccaccttcgatggcaagccggctgcggacacacctcaagcttaccgccaactgacagggcc > 1:33738‑M2/1‑36 (MQ=255) cTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCa < 5:18365/121‑1 (MQ=255) cTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCa > 6:18365/1‑121 (MQ=255) | GCTGTACCCGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAAGGGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGT‑TGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACAC‑CCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCACCGTCCACACC > NC_002947/364616‑364906 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |