New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 364761 | 74 (1.230) | 4 (0.070) | 4/250 | NT | 5.2% | coding (841/945 nt) | caiX | carnitine uptake ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | = 364794 | 75 (1.330) | coding (808/945 nt) | caiX | carnitine uptake ABC transporter substrate‑binding protein |
GGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCACCGTCCACACCGTCGCGCGGCCTTCGTCAGGGCCGAGTGCATCCTGG > NC_002947/364650‑364942 | ggCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGcagt < 6:189852‑M2/149‑5 (MQ=255) cTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGcagtggct > 7:6785‑M2/1‑141 (MQ=255) gTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGATCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGc > 4:137505/1‑149 (MQ=255) tCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCCCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGc < 1:10562/148‑1 (MQ=255) aGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGcat > 5:258727/1‑148 (MQ=255) gTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGcatca > 5:283066/1‑149 (MQ=255) gTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCGGAATCCACCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGc > 3:109380/1‑148 (MQ=255) aGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCtctc < 7:179873/149‑1 (MQ=255) gCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGcagtg > 4:119514‑M2/1‑124 (MQ=255) gCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGcagtg < 3:119514‑M2/129‑6 (MQ=255) gCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCg < 6:258727/149‑1 (MQ=255) cTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑GGGCTGCATCATGCGGCTCTCGt > 5:335164/1‑149 (MQ=255) ttGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCACGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCGTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTc > 6:341726/1‑149 (MQ=255) aGGTTGTCCGCAGCCGGCTCGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTc < 4:224906/149‑1 (MQ=255) gTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCgg > 7:213220/1‑149 (MQ=255) gTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCgg > 4:133593/1‑149 (MQ=255) gTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCgg > 3:343048/1‑149 (MQ=255) gTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCgg > 7:180445/1‑149 (MQ=255) cGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGcagtgg > 2:31374‑M2/1‑111 (MQ=255) cGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGcagtgg < 1:31374‑M2/117‑7 (MQ=255) cGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTg > 8:309457/1‑148 (MQ=255) gCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGgcgc < 4:360731/145‑1 (MQ=255) gCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGaa > 5:571/1‑149 (MQ=255) gCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGaa > 2:259050/1‑149 (MQ=255) gCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTCGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGgcgc > 3:360731/1‑145 (MQ=255) gCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGT‑‑CACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGCATCCATCGCGTCCTTGTGGTCGCAGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTc < 1:76683/149‑1 (MQ=255) ccGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACtt > 3:111325/1‑148 (MQ=255) ccGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACtt > 3:328376/1‑148 (MQ=255) ccGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTc < 8:180445/149‑1 (MQ=255) ccGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGGCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTc < 6:293302/149‑1 (MQ=255) ccGGCTGGCCATCGAACGGGGGCACTCCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCCG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCGCGTCCTCGGCGCTGAACTTc < 8:232085/149‑1 (MQ=255) cGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCa < 3:105835/149‑1 (MQ=255) cTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGt < 3:133593/149‑1 (MQ=255) ttGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGtt > 6:326243/1‑149 (MQ=255) ccATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTgg < 4:343048/148‑1 (MQ=255) ccATCGAAGGGGGGCGCACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGGGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCGGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGc < 4:242004/149‑1 (MQ=255) cATCGAAGGTTGTCACTCCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGACTCCAGAGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAGCTGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGc < 1:275140/149‑1 (MQ=255) gAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCcagca < 6:335164/149‑1 (MQ=255) aGGGGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAgg < 2:376298/149‑1 (MQ=255) 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gCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAg > 5:133346/1‑149 (MQ=255) ccAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCAACATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGc > 4:317748/1‑149 (MQ=255) gCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGtt > 2:3638/1‑149 (MQ=255) cGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTc > 2:157560/1‑149 (MQ=255) cGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTc < 6:189013/149‑1 (MQ=255) ggCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAATTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCgg < 1:259050/149‑1 (MQ=255) ggCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTg < 1:169365/136‑1 (MQ=255) ggCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTg > 2:169365/1‑136 (MQ=255) cTTGTCCTCGGGGGGGTACGTGAGCCACTGGCGGTCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCTTCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCCGGTTGGGCAGCAGGCGGTGGGCATTGGGGCAGCGTTCAGCAt < 4:109380/149‑1 (MQ=255) cTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCg > 6:272709/1‑149 (MQ=255) 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ccTTTAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCAcc > 7:245120/1‑149 (MQ=255) ccTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCAcc < 5:272709/149‑1 (MQ=255) ttGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGcagtggctcaaggaccaccccgaggacaaggcccgctggcttgagggtgtgaccaccttcgatggcaagccggctgcggacaacctcaagcttaccgccaactga < 2:33738‑M2/149‑106 (MQ=255) gAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCATTGTGGTCG‑AGcagtggctcaaggaccaccccgaggacaaggcccgctggcttgagggtgtgaccaccttcgatggcaagccggctgcggacatcctcaagcttaccgccaactga < 7:255646‑M2/147‑106 (MQ=255) aGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCACCGTcc < 4:295436/148‑1 (MQ=255) ccACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCACCGTCcaca > 3:235574/1‑149 (MQ=255) cACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGcagtggctcaaggaccaccccgaggacaaggcccgctggcttgagggtgtgaccaccttcgatggcaagccggctgcggacaacctcaggcttaccgccaactgacagggc < 6:32913‑M2/149‑112 (MQ=255) cACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCACCGTCCacac < 3:137505/149‑1 (MQ=255) aCTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCGCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCACCGTCcaca > 2:234901/1‑147 (MQ=255) cTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGcagtggctcaaggaccaccccgaggacaaggcccgctggcttgagggtgtgaccaccttcgatggcaagccggctgcggacacacctcaagcttaccgccaactgacagggcc > 1:33738‑M2/1‑36 (MQ=255) cTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCa > 6:18365/1‑121 (MQ=255) cTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCa < 5:18365/121‑1 (MQ=255) gCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCACCGTCCACACCGTcgcgcg < 4:328376/149‑1 (MQ=255) gCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑CGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCACCGTCCACACCGTcgcgcg > 2:23164/1‑149 (MQ=255) aTTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCACCGTCCACACCGTCGCGCGGcc < 1:157560/148‑1 (MQ=255) aTTCCACCGCGTCCATGTGGTCG‑AGCAG‑TCGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCACCGTCCACACCGACGCGCGCCCt > 2:63286/1‑149 (MQ=255) ttCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCACCGTCCACACCGTCGCGCGGCCtt > 4:86839/1‑149 (MQ=255) tCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCACCGTc > 6:146722/1‑129 (MQ=255) tCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCACCGTc < 5:146722/129‑1 (MQ=255) aGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCACCGTCCACACCGTCGCGCGGCCTTCGt > 4:26784/1‑148 (MQ=255) gTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCACCGTCCACACCGTCGCGCGGCCTTCGTCAGGGc > 1:90848/1‑149 (MQ=255) cTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCACCGTCCACACCGTCGCGCGGCCTTCGTCAGGGCCGa < 5:326243/149‑1 (MQ=255) gtgGTCG‑AGCAG‑CGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCACCGTCCACACCGTCGCGCGGCCTTCGTCAGGGCCGAGt < 1:23164/148‑1 (MQ=255) gCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCACCGTCCACACCGTCGCGCGGCCTTCGTCAGGGCCGAGTGCATCCTgg > 7:263519/1‑149 (MQ=255) | GGCCCTGTCAGTTGGCGGTAAGCTTGAGGTTGTCCGCAGCCGGCTTGCCATCGAAGGTGGTCACACCCTCAAGCCAGCGGGCCTTGTCCTCGGGGTGGTCCTTGAGCCACTGGCGGGCTGATTCCAGCGCGTCCTTGTGGTCG‑AGCAG‑TGGCTGCATCATGCGGCTCTCGTCCTCGGCGCTGAACTTCAGGTTGGCCAGCAGGCGGAGGGCATTGGGGCAGCGTTCGGCATAGTCCGGAGCCGTCACCGTCCACACCGTCGCGCGGCCTTCGTCAGGGCCGAGTGCATCCTGG > NC_002947/364650‑364942 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |