New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 378581 | 59 (0.980) | 3 (0.050) | 3/258 | NT | 5.1% | coding (834/1293 nt) | gbcA | glycine‑betaine dioxygenase subunit |
? | NC_002947 | = 378616 | 54 (0.930) | coding (799/1293 nt) | gbcA | glycine‑betaine dioxygenase subunit |
CACGATCATGTGGTCGCCCATGCAGTGGTTCCACGAGTGCGGCAGGTGCAGGATGCGCATCGAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAGGCGGCCACATGGTCCTTGAATT‑CCTGGCTGGCGCGCGGGTCGTTGGTGTCGTCCCACT > NC_002947/378434‑378723 | cacGATCATGTGGTCGCCCATGCAGTGGTTCCACGAGTGCGGCAGGTGCAGGATGCGCATCGAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGagca < 1:201945/149‑1 (MQ=255) cacGATCATGTGGTCGCCCATGCAGTGGTTCCACGAGTGCGGCAGGTGCAGGATGCGCATCGAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGagca > 1:320984/1‑149 (MQ=255) cGATCATGTGGTCGCCCATGCAGTGGTTCCACGAGTGCGGCAGGTGCAGGATGCGCATCGAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGagcagc > 6:93450/1‑149 (MQ=255) cGATCATGTGGTCGCCCATGCAGTGGTTCCACGAGTGCGGCAGGTGCAGGATGCGCATCGAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGagcagc < 3:25252/149‑1 (MQ=255) gATCATGTGGTCGCCCATGCAGTGGTTCCACGAGTGCGGCAGGTGCAGGATGCGCATCGAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCg > 4:339172/1‑149 (MQ=255) gATCATGTGGTCGCCCATGCAGTGGTTCCACGAGTGCGGCAGGTGCAGGATGCGCATCGAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCg > 3:284147/1‑149 (MQ=255) tgGTCGCCCATGCAGTGGTTCCACGAGTGCCGCAGGTGCAGGATGCGCATCGAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATgcg > 1:352652/1‑149 (MQ=255) gTCGCCCATGCAGTGGTTCCACGAGTGCGGCAGGTGCAGGATGCGCATCGAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCa > 6:259080/1‑149 (MQ=255) cccATGCAGTGGTTCCACGAGTGCGGCAGGTGCAGGATGCGCATCGAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGCTGCGACCGATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGGCATCGAGACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGAt > 1:212820/1‑149 (MQ=255) cccATGCAGTGGTTCCACGAGTGCGGCAGGTGCAGGATGCGCATCGAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGAt < 3:270057/149‑1 (MQ=255) tGCAGTGGTTCCACGAGTGCGGCAGGTGCAGGATGCGCATCGAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCgg < 4:284147/149‑1 (MQ=255) gCAGTGGTTCCACGAGTGCGGCAGGTGCAGGATGCGCATCGAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGt > 5:195373/1‑149 (MQ=255) cAGTGGTTCCACGAGTGCGGCAGGTGCAGGATGCGCATCGAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGt < 2:76658/148‑1 (MQ=255) cACGAGTGCGGCAGGTGCAGGATGCGCATCGAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGAGGCATGCGCACGAAGCGGTTAC‑GCAGGcc > 7:178938/1‑149 (MQ=255) cGAGTGCGGCAGGTGCAGGATGCGCATCGAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGt < 6:195373/149‑1 (MQ=255) gAGTGCGGCAGGTGCAGGATGCGCATCGAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTg > 1:267467/1‑149 (MQ=255) ggcaggggcaggATGCGCATCGCGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCGTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGGGCCCTTGAGCcacggcctgcgtaaccgcatcgtgcgcatgccgctgcgcaa < 5:224951‑M1/149‑42 (MQ=255) ggCAGGTGCAGGATGCGCATCGAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCTCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCtt < 5:58368/149‑1 (MQ=255) ggCAGGTGCAGGATGCGCATCGAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCtt < 3:339172/149‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGGATGCGCATCGAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTtgt < 7:137036/149‑1 (MQ=255) gATGCGCATCGAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACg > 3:222881/1‑149 (MQ=255) aTGCGCATCGAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACgg < 5:259080/149‑1 (MQ=255) aTCGAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGAtctt > 5:160866/1‑149 (MQ=255) aTCGAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGAtctt > 5:184781/1‑149 (MQ=255) gAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACg > 4:39094/1‑139 (MQ=255) gAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACg < 3:39094/139‑1 (MQ=255) gAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTtctc < 2:320984/149‑1 (MQ=255) gAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTtctc > 1:257374/1‑149 (MQ=255) aGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCg > 7:245848/1‑149 (MQ=255) ccAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGc > 8:213123/1‑149 (MQ=255) aGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTc < 2:267467/149‑1 (MQ=255) ggTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTcc < 4:222881/149‑1 (MQ=255) tCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTcc > 5:81961/1‑147 (MQ=255) ggTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAgg < 5:118195/147‑1 (MQ=255) ttGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGg > 8:142436‑M2/1‑104 (MQ=255) ttGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGg < 7:142436‑M2/105‑2 (MQ=255) ttGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAgcggc > 1:286811/1‑149 (MQ=255) ttGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAgcggc < 2:352652/149‑1 (MQ=255) gATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGGACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAgcggcg > 2:15882/1‑148 (MQ=255) aTGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAgcggcg > 1:259406/1‑147 (MQ=255) tGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAg > 2:325300/1‑149 (MQ=255) aCCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGTCAGCGGCGGAggcgg < 6:160866/149‑1 (MQ=255) tCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCcacggcctgcgtaaccgcatcgtgcgcatgccgctgctcaagg > 2:278462‑M1/1‑56 (MQ=255) tCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCcacggcctgcgtaaccgcatcgtgcgcatgccgctgctcaagg < 1:278462‑M1/99‑44 (MQ=255) aGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAGGCGGCCACAt < 6:184781/148‑1 (MQ=255) cTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAGGCGGCCACATGGt < 8:245848/149‑1 (MQ=255) ttCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAGGCGGCCACATGGTc > 3:170849/1‑149 (MQ=255) tGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAGGCGGCCACATGGTCCtt > 5:218766/1‑149 (MQ=255) ggCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAGGCGGCCACATGGTCCtt > 3:355838/1‑148 (MQ=255) gCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAGGCGGCCACATGGTCCtt < 5:93450/147‑1 (MQ=255) gCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAGGCGGCCACATGGTCCTTg > 8:45494/1‑148 (MQ=255) gCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCACGCAGCGGCGGAGGCGGCCACATGGTCCtt < 6:218766/147‑1 (MQ=255) cAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAGGCGGCCACATGGTCCTTGaa > 1:99979/1‑149 (MQ=255) aGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAGGCGGCCACATGGTCCTTGAAt > 6:337523/1‑149 (MQ=255) ggCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAGGCGGCCACATGGTCCTTGAAtt > 7:185378/1‑149 (MQ=255) gCCGTCGATTGTCATCGACACGGTGCCCGTGTGCAGCTGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAGGCGGCCACATGGTCCTTGAATT‑Cctggctg < 8:178938/148‑1 (MQ=255) ccGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAGGCGGCCACATGGTCCTTGAATT‑CCtggctggc < 1:15882/149‑1 (MQ=255) cGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAGGCGGCCACATGGTCCTTGAATT‑CCTGGCTGgcg < 7:213123/149‑1 (MQ=255) gTCCATGGTCATCGATACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCTGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAGGCGCCCACATGGTCCGTGATTA‑CCTGGCTGgcgc > 6:205322/1‑149 (MQ=255) gTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAGGCGGCCACATGGTcc > 4:65262/1‑130 (MQ=255) gTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAGGCGGCCACATGGTcc < 3:65262/130‑1 (MQ=255) aTGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAGGCGGCCACATGGTCCTTGAATT‑CCTGGCTGGCGCGCgg < 4:170849/149‑1 (MQ=255) tGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAGGCGGCCACATGGTCCTTGAATT‑CCTGGCTGGCGCGCggg > 1:151317/1‑149 (MQ=255) tCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAGGCGGCCACATGGTCCTTGAATT‑CCTGGCTGGCGCGCGGGTCg > 2:228863/1‑149 (MQ=255) tCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAGGCGGCCACATGGTCCTTGAATT‑CCTGGCTGGCGCGCGGGTCGTTg < 4:355838/149‑1 (MQ=255) ggTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAGGCGGCCACATGGTCCTTGAATT‑CCTGGCTGGCGCGCGGGTCGTTGGTgtcgt < 2:259406/149‑1 (MQ=255) ggTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAGGCGGCCACATGGTCCTTGAATT‑CCTGGCTGGCGCGCGGGTCGTTGGTgtcgt < 4:267078/149‑1 (MQ=255) cccTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAGGCGGCCACATGGTCCTTGAATTCCCTGGCTGGCGCGCGGGTCGTTGGTGTCGTcc < 1:228863/148‑1 (MQ=255) ccTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGgctcaagggcaccgtgtcgatgaccatggacggcaagcaggcctgccagaagctga > 2:278462‑M2/1‑43 (MQ=255) ccTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGgctcaagggcaccgtgtcgatgaccatggacggcaagcaggcctgccagaagctga < 1:278462‑M2/99‑57 (MQ=255) cTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTACGGCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAGGCGGCCACATGGTCCTTGAATT‑CCTGGCTGGCGCGCGGGTCGTTGGTGTCGTCCCAc > 1:50513/1‑149 (MQ=255) cTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGCGGCGGCCACATGGTCCTTGAATT‑CCTGGCTGGCGCGCGGGTCGTTGGTGTCGTCCCACt > 7:316158/1‑149 (MQ=255) ttGCGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGgctcaagggccccgtgtcgatgaccatggacggcacgcaggcctgccagaagctgatgggtcgcatcaagaacccagaccttggcgcgatgcgcatcctgcccctgcc < 5:224951‑M2/149‑109 (MQ=255) ccacggcctgcgtaaccgcatcgtgcgcatgccgctgctcaagggcaccgtgtcgatgaccatggacggcaagcaggcctgccagaagctgatgggtcgcatcaa < 7:142436‑M1/105‑105 (MQ=255) ccacggcctgcgtaaccgcatcgtgcgcatgccgctgctcaagggcaccgtgtcgatgaccatggacggcaagcaggcctgccagaagctgatgggtcgcatcaa > 8:142436‑M1/1‑1 (MQ=255) | CACGATCATGTGGTCGCCCATGCAGTGGTTCCACGAGTGCGGCAGGTGCAGGATGCGCATCGAGCCAAGGTCTGGGTTCTTGATGCGACCCATCAGCTTCTGGCAGGCCTGCTTGCCGTCCATGGTCATCGACACGGTGCCCTTGAGCAGCGGCATGCGCACGATGCGGTTAC‑GCAGGCCGTGGCTCTTGTGCAGGTACGGGATCTTCTCGGCTTCCCAGGCAGCGGCGGAGGCGGCCACATGGTCCTTGAATT‑CCTGGCTGGCGCGCGGGTCGTTGGTGTCGTCCCACT > NC_002947/378434‑378723 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |