New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1444115 | 58 (0.960) | 4 (0.070) | 3/250 | NT | 6.9% | coding (71/948 nt) | PP_1262 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 1444148 | 53 (0.940) | coding (38/948 nt) | PP_1262 | LysR family transcriptional regulator |
AGAATCTGTTCGCAACGCATCAGGTAACGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCTTCGACC > NC_002947/1443968‑1444258 | aGAATCTGTTCGCAACGCATCAGGTAACGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGGTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCGTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTgcgc < 2:267288/149‑1 (MQ=255) aaTCTGTTCGCAACGCATCAGGTAGCGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGcgccg > 6:339299/1‑149 (MQ=255) ttCGCAACGCATCAGGTAACGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCgg > 3:256813/1‑149 (MQ=255) gCAACGCATCAGGTAACGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCgg < 6:40463/146‑1 (MQ=255) gCAACGCATCAGGTAACGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCgg > 5:40463/1‑146 (MQ=255) gCAACGCATCAGGTAACGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCa < 1:204732/148‑1 (MQ=255) gCAACGCATCAGGTAACGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCa < 7:1918/148‑1 (MQ=255) gCAACGCATCAGGTAACGCTTGCCGGCTTCGCTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑g > 7:222122/1‑149 (MQ=255) gCATCAGGTAACGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAg > 6:167304/1‑149 (MQ=255) cATCAGGTAACGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGc < 8:7637/149‑1 (MQ=255) aTCAGGTAACGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCt > 4:215918/1‑149 (MQ=255) aTCAGGTAACGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCt > 8:212803/1‑149 (MQ=255) aGGTAACGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGcc > 6:194012/1‑149 (MQ=255) gTAACGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGcc > 4:99145/1‑147 (MQ=255) gTAACGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGcc > 7:179297/1‑147 (MQ=255) aaCGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGt > 6:295442/1‑149 (MQ=255) cGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTg < 5:279593/149‑1 (MQ=255) gCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGc < 8:179297/147‑1 (MQ=255) cTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTAcgca < 1:258913‑M2/148‑5 (MQ=255) ggTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGtagcccaactcggcagcttcactgccgctgcggcgcaactg < 6:226747‑M1/148‑42 (MQ=255) cAGCGCAATGGGGCGGGTGGTACGGTTGCCCAGCCATGTTTGCAGATTGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGGTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCATGTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGaaa < 1:233412/149‑1 (MQ=255) aGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGtagcccaactcggcagcttcactgccgctgcggcgcaactggata < 3:136281‑M1/148‑46 (MQ=255) cgcAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCAc > 2:24818/1‑149 (MQ=255) cAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACg > 4:210109/1‑148 (MQ=255) cAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACg > 4:256546/1‑148 (MQ=255) aaTGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCa > 4:49925/1‑149 (MQ=255) tggtACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAgg < 3:258316/149‑1 (MQ=255) gtACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGgt < 3:215918/149‑1 (MQ=255) tACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGtagcccaactcggcagcttcactgccgctgcggcgcaactggata < 3:300557‑M1/129‑46 (MQ=255) tACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGtagcccaactcggcagcttcactgccgctgcggcgcaactggata > 4:300557‑M1/1‑84 (MQ=255) tACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGgtg > 3:212970/1‑149 (MQ=255) ttGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCAt > 2:70960/1‑149 (MQ=255) agcagcCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCTAGTTGGGCTACGCAACTGAAATCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATgg < 7:212803/148‑1 (MQ=255) cagcCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAgg > 5:62486/1‑136 (MQ=255) cagcCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAgg < 6:62486/136‑1 (MQ=255) cagcCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGt < 2:258913/148‑1 (MQ=255) gcCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCAc > 8:335283/1‑149 (MQ=255) ccTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGgt > 2:73309/1‑135 (MQ=255) ccTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGgt < 1:73309/135‑1 (MQ=255) gATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTaga < 7:335283/149‑1 (MQ=255) aTGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTagag < 5:339299/149‑1 (MQ=255) tGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTagag < 8:222122/148‑1 (MQ=255) gCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGAc > 5:120594/1‑148 (MQ=255) gCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACAGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGAc > 4:247840/1‑148 (MQ=255) ttCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACaa > 2:125886/1‑148 (MQ=255) ccAGGTTGTAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTTGGCTACGCAACTGAAATCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACaaaa < 5:65447/148‑1 (MQ=255) cAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGtttt > 1:21466/1‑107 (MQ=255) cAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGtttt < 2:21466/107‑1 (MQ=255) cAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCGATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAAtt > 6:5576/1‑149 (MQ=255) cAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGACGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAAtt > 2:129879/1‑149 (MQ=255) aGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATtg > 3:154780/1‑149 (MQ=255) aGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATtg > 7:269905/1‑149 (MQ=255) ttGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCGTGGGTCACACTCGAGGTAGAGGACAAAATTgtgt > 5:101414/1‑149 (MQ=255) ttGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTgtgt > 6:12096/1‑149 (MQ=255) aCCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGaa < 5:167304/149‑1 (MQ=255) cgACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTg < 3:49925/149‑1 (MQ=255) acGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGaaa < 1:175805/149‑1 (MQ=255) ttCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAaga < 1:24818/149‑1 (MQ=255) cgcgGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAagag < 3:99145/148‑1 (MQ=255) tCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTg > 2:104090/1‑149 (MQ=255) gTATCCAGTTGCGCCGCAGCTGCA‑GTTAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGc < 3:256546/148‑1 (MQ=255) gTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTg < 4:37032/41‑1 (MQ=255) gTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTg > 3:37032/1‑41 (MQ=255) tATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTAcgcaactggatacgaccaccgcgaacgtgtcgcgggcggtctccaacctggaagcccatctgcaaacaaggctgctcaaccgtaccacccgccgcattgcgct < 3:136281‑M2/148‑104 (MQ=255) tATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTAcgcaactggatacgaccaccgcgaacgtgtcgcgggcggtctccaacctggaagcccatctgcaaacaaggctgctcaaccgta > 4:300557‑M2/1‑45 (MQ=255) tATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTAcgcaactggatacgaccaccgcgaacgtgtcgcgggcggtctccaacctggaagcccatctgcaaacaaggctgctcaaccgta < 3:300557‑M2/129‑85 (MQ=255) aTCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCtt > 7:199020/1‑149 (MQ=255) cAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTAcgcaactggatacgaccaccgcgaacgtgtcgcgggcggtctccaacctggaagcccatctgcaaacaaggctgctcaaccgtaccacccgccgcattgcgctgacc < 6:226747‑M2/148‑108 (MQ=255) cAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCTTCg < 3:247840/148‑1 (MQ=255) tGCGtagcccaactcggcagcttcactgccgctgcggcgcaactggatacgaccaccgcgaacgtgtcgcgggcggtctccaacctggaagcccatctgcaaacaaggctgctcaaccgtaccacccgccgcattgcgctgaccgaag < 1:258913‑M1/148‑145 (MQ=255) | AGAATCTGTTCGCAACGCATCAGGTAACGCTTGCCGGCTTCGGTCAGCGCAATGCGGCGGGTGGTACGGTTGAGCAGCCTTGTTTGCAGATGGGCTTCCAGGTTGGAGACCGCCCGCGACACGTTCGCGGTGGTCGTATCCAGTTGCGCCGCAGCGGCA‑GTGAAGCTGCCGAGTTGGGCTACGCAACTGAAAGCACGCATGTTTTGCAGGGTGTCCATGGGTCACTCTCGAGGTAGAGGACAAAATTGTGTCACGAAGTAACTTGGAAAAGAGAAAAAGTTGCCTTCGACC > NC_002947/1443968‑1444258 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |