New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1936355 | 48 (0.800) | 3 (0.050) | 3/258 | NT | 5.7% | coding (657/1149 nt) | PP_1736 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 1936390 | 53 (0.910) | coding (692/1149 nt) | PP_1736 | hypothetical protein |
CGCCACCGGCGTATCGGCGTACCCGCACCGTTGACCATCGACCACCTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAGATCGGCGGGCACATGCTCAACAGTA > NC_002947/1936209‑1936500 | cgcCACCGGCGTATCGGCGTACCCGCACCGTTGACCATCGACCACCTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGc > 5:283188/1‑149 (MQ=255) ccACCGGCGTATCGGCGTACCCGCACCGTTGACCATCGACCACCTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCt < 3:94980/149‑1 (MQ=255) cACCGGCGTATCGGCGTACCCGCACCGTTGACCATCGACCACCTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCtt < 6:64840/149‑1 (MQ=255) ggCGTATCCGCGTACCCGCACCGTTGACCATCGACCACCTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTCTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCAc < 5:5328/149‑1 (MQ=255) aTCGGCGTACCCGCACCGTTGACCATCGACCACCTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTggg > 8:47359/1‑149 (MQ=255) gCGTACCCGCACCGTTGACCATCGACCACCTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGgcgc > 1:320122/1‑148 (MQ=255) ccGCACCGTTGACCATCGACCACCTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCgg > 7:4830/1‑149 (MQ=255) cGCACCGTTGACCATCGACCACCTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCggg > 6:189134/1‑149 (MQ=255) gCACCGTTGACCATCGACCACCTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGt > 8:281907/1‑149 (MQ=255) gCACCGTTGACCATCGACCACCTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGt > 8:10537/1‑149 (MQ=255) cGTTGACCATCGACCTCCTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCtg < 6:302221/149‑1 (MQ=255) gTTGACCATCGACCACCTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTgacga > 5:15119/1‑145 (MQ=255) gTTGACCATCGACCACCTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCtgg < 4:98881/149‑1 (MQ=255) gTTGACCATCGACCACCTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCtgg < 7:47359/149‑1 (MQ=255) gTTGACCATCGACCACCTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCtgg < 3:335960/149‑1 (MQ=255) gACCATCGACCACCTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCtggt > 7:260872/1‑147 (MQ=255) gACCATCGACCACCTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCtggt < 8:260872/147‑1 (MQ=255) ccaccTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGaccaccagcacccggctggcgcccaggtgcaaggccgggctga < 6:333756‑M1/149‑44 (MQ=255) ctgGCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGaaa < 1:255590/149‑1 (MQ=255) ccAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCg < 6:314852/149‑1 (MQ=255) ccAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCg < 1:249293/149‑1 (MQ=255) ccAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCg < 2:320122/149‑1 (MQ=255) cAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCg > 1:103535/1‑148 (MQ=255) aGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACAGGGCGGCGAGTATTACGGCCACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCg > 1:254078/1‑147 (MQ=255) ggcgATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGc < 7:10537/149‑1 (MQ=255) cgATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGTTCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCa < 1:107873/149‑1 (MQ=255) ccGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAgcgc > 4:4264/1‑148 (MQ=255) cGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCa < 1:160928/149‑1 (MQ=255) tcgccGCCCAGTTGCACCGGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTa > 4:349807/5‑149 (MQ=255) ttCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGt < 4:19093/146‑1 (MQ=255) ttCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGt > 3:19093/1‑146 (MQ=255) ccccGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGccc > 7:340202/1‑149 (MQ=255) cccGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGccc > 6:107607/1‑148 (MQ=255) tGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCgt < 7:281907/149‑1 (MQ=255) cAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCgtgt > 4:24693/1‑149 (MQ=255) cAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCgtgt < 3:24693/149‑1 (MQ=255) aaCTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGaccaccagcacccggctggcgcccaggtgcaaggccgggc > 5:93101‑M1/1‑59 (MQ=255) aaCTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGaccaccagcacccggctggcgcccaggtgcaaggccgggc < 6:93101‑M1/99‑41 (MQ=255) tGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGtt > 3:112698/1‑148 (MQ=255) ggcgAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCgg > 5:364442/1‑149 (MQ=255) gcgAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCggg < 6:283188/149‑1 (MQ=255) cgAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGgc < 8:4830/149‑1 (MQ=255) gAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGgca < 2:254078/149‑1 (MQ=255) cGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCCGCGGGCAGCAGCCGAGcc > 2:277365/1‑149 (MQ=255) gcCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAGATcggc < 5:107607/149‑1 (MQ=255) gcCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAGATcggc < 7:332133/149‑1 (MQ=255) cAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAGATcggcgg > 2:7061/1‑149 (MQ=255) cAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAGATcggcgg < 2:103535/149‑1 (MQ=255) aGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAAc > 6:317009/1‑71 (MQ=255) aGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAAc < 5:317009/71‑1 (MQ=255) gcgcCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAGATCGGCGGGcaca < 5:100685/148‑1 (MQ=255) gATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAGATCGGCGGGCACATGCTc > 5:326981/1‑148 (MQ=255) tCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTcgggctgatcggcgccgactggcgcactgcaccgtcgccgtaatactcgccgcccagttgcaccggggcgaacagcagcgggatcgccgcactggccagcaggtgg < 6:333756‑M2/149‑107 (MQ=255) aGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAGATCGGCGGGc > 4:268046/1‑136 (MQ=255) aGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAGATCGGCGGGc < 3:268046/136‑1 (MQ=255) gCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTcgggctgatcggcgccgactggcgcactgcaccgtcgccgtaatactcgccgcccagtt > 5:93101‑M2/1‑40 (MQ=255) gCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTcgggctgatcggcgccgactggcgcactgcaccgtcgccgtaatactcgccgcccagtt < 6:93101‑M2/99‑60 (MQ=255) cccGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAGATCGGCGGGCACATGCTCAACAGTa > 3:342063/1‑149 (MQ=255) | CGCCACCGGCGTATCGGCGTACCCGCACCGTTGACCATCGACCACCTGCTGGCCAGTGCGGCGATCCCGCTGCTGTTCGCCCCGGTGCAACTGGGCGGCGAGTATTACGGCGACGGTGCAGTGCGCCAGTCGGCGCCGATCAGCCCGGCCTTGCACCTGGGCGCCAGCCGGGTGCTGGTGGTCGGGGTCAGCGGAAACCCGCAGCGGCCAGCGCCACCTGTACCGCCCCAGCGTGTGTTCAGCGGGCAGCAGCCGAGCCTGGCGCAGATCGGCGGGCACATGCTCAACAGTA > NC_002947/1936209‑1936500 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |