New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2095626 | 67 (1.110) | 5 (0.080) | 5/264 | NT | 6.7% | coding (852/1212 nt) | alaA | glutamate‑pyruvate aminotransferase |
? | NC_002947 | = 2095675 | 72 (1.210) | coding (803/1212 nt) | alaA | glutamate‑pyruvate aminotransferase |
GCATACAGCGCGCCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGT > NC_002947/2095480‑2095774 | gCATAGAGCGCGCCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGGTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGc < 4:21642/149‑1 (MQ=255) gCATAGAGCGCGCCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGGTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTTGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGc < 4:26587/149‑1 (MQ=255) cATACAGCGCGCCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGCGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGc < 1:72256/149‑1 (MQ=255) cgcgcgcCCATCGGTTGCACGCAGCTGACGCCAGGGAGGGCGTTGAGCAGTGCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTg < 4:288170/148‑1 (MQ=255) aGCGCGCCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGacatgctg > 1:58550‑M1/1‑141 (MQ=255) cgcgcCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTggg > 1:317932/1‑149 (MQ=255) cgcgcCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTggg > 8:3000/1‑149 (MQ=255) cATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCa > 7:28017/1‑149 (MQ=255) aTCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTAGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGCCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCAc > 7:346166/1‑149 (MQ=255) ggTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GGCGTTGATGCGCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGtt < 5:265545/149‑1 (MQ=255) gTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTg > 1:179254/1‑149 (MQ=255) tttCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTgg > 8:289372/1‑149 (MQ=255) aCGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATAGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGca > 7:312601/1‑149 (MQ=255) gCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGca > 5:211967/1‑147 (MQ=255) cTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGgc‑g < 4:311833/149‑1 (MQ=255) aCGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGgc‑gc < 5:318228/147‑1 (MQ=255) cAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTg < 4:92020/149‑1 (MQ=255) cAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTg > 3:172642/1‑149 (MQ=255) aGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTgg < 4:140018/149‑1 (MQ=255) gggATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGc < 1:123498/149‑1 (MQ=255) gggATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGc < 8:28017/149‑1 (MQ=255) aTGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAg > 1:29237/1‑149 (MQ=255) aGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTgg < 2:302422/118‑1 (MQ=255) aGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTgg > 1:302422/1‑118 (MQ=255) ggtCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCt > 8:30749/3‑149 (MQ=255) tCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCGTc > 6:348998/1‑149 (MQ=255) cGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTc < 5:119179/148‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGACATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGAt < 2:58550/149‑1 (MQ=255) ggTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATg > 1:348575/1‑148 (MQ=255) tGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAg < 3:270506/149‑1 (MQ=255) ggTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCtg > 8:77939/1‑149 (MQ=255) ggTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCtg > 8:177676/1‑149 (MQ=255) ttGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGacatgctggccaacatgcgcctgtgcgccaacgtgccggcccagcatgcca < 2:369040‑M1/129‑52 (MQ=255) ttGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGacatgctggccaacatgcgcctgtgcgccaacgtgccggcccagcatgcca > 1:369040‑M1/1‑78 (MQ=255) gctgctCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCg > 2:249827/1‑149 (MQ=255) gctgctCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCg > 5:361455/1‑149 (MQ=255) ctCCAGCAGGCGGCCCCGCGGCAGCACCAG‑CCCGTCGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCCC‑AGGC‑GCAGGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCgtg < 8:268868/147‑1 (MQ=255) tCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCgtggtg > 6:117910/1‑149 (MQ=255) ccAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGc < 6:211967/149‑1 (MQ=255) cagcagGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCt > 7:145793/1‑149 (MQ=255) cccctgcggcCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTAGATGCGCTGCTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGAGGGCTTGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGTCCAGCATGTCGATGCGTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCtt < 8:346166/144‑1 (MQ=255) agcagGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCtt > 3:287127/1‑149 (MQ=255) gcagGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTg > 4:124873/1‑149 (MQ=255) cagGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTgg < 3:124873/149‑1 (MQ=255) ggcggcCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGc > 7:139891/1‑149 (MQ=255) ggcCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCg < 7:289372/149‑1 (MQ=255) gcCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCgg < 6:47411/149‑1 (MQ=255) ccGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGaa < 5:332695/149‑1 (MQ=255) cggcggCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGacatgctggccaacatgcgcctgtgcgccaacgtgccggcccagcatgc > 7:277054‑M1/1‑55 (MQ=255) cggcggCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGacatgctggccaacatgcgcctgtgcgccaacgtgccggcccagcatgc < 8:277054‑M1/104‑50 (MQ=255) cggcggCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGaaa < 7:3000/149‑1 (MQ=255) cagcaCCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATca < 1:136636/149‑1 (MQ=255) cAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATcag‑ccagc < 2:348575/149‑1 (MQ=255) g‑gTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATcag‑ccagc > 7:20433/1‑147 (MQ=255) gTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATcag‑ccagc > 3:110530/1‑146 (MQ=255) gTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAg‑ccagcca < 4:110530/148‑1 (MQ=255) gTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGc > 2:168785/1‑149 (MQ=255) gATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCgg > 4:355398/1‑148 (MQ=255) aTGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTg > 3:11373/1‑72 (MQ=255) aTGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTg < 4:11373/72‑1 (MQ=255) aTGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGaa < 7:30749/149‑1 (MQ=255) ctGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGc > 4:334809/1‑140 (MQ=255) ctGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGc < 3:334809/140‑1 (MQ=255) gTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCa < 8:139891/149‑1 (MQ=255) gTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCa < 2:317932/149‑1 (MQ=255) gTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCa > 6:341682/1‑149 (MQ=255) gccgccCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCAccc < 5:348998/149‑1 (MQ=255) ccgccCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACGAGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCAccc > 1:275082/1‑149 (MQ=255) ccgccCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGaa > 6:174363/1‑137 (MQ=255) ccgccCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGaa < 5:174363/137‑1 (MQ=255) cgccCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGCGGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCg > 1:92443/1‑149 (MQ=255) cccAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTa > 7:40368/1‑149 (MQ=255) gcgGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑TCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACtt < 2:316994/149‑1 (MQ=255) ggTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTgg < 8:40368/149‑1 (MQ=255) gTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTgg < 1:249827/149‑1 (MQ=255) gATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGAc > 7:51302/1‑145 (MQ=255) gATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGAc < 8:51302/145‑1 (MQ=255) gATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACaa < 2:29237/147‑1 (MQ=255) tGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTcatccagaccgcgctgggcggctaccagagcatcaacgacctggtgctgccgccgggccgcctgctggagcagcgcaa > 1:369040‑M2/1‑51 (MQ=255) tGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTcatccagaccgcgctgggcggctaccagagcatcaacgacctggtgctgccgccgggccgcctgctggagcagcgcaa < 2:369040‑M2/129‑79 (MQ=255) ggCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGt > 7:163323/1‑149 (MQ=255) | GCATACAGCGCGCCCATCGGTTTCACGCAGCTGACGCCAGGGATGTCGTTGAGCAGTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAG‑GTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGT > NC_002947/2095480‑2095774 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |