New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2095626 | 67 (1.110) | 5 (0.080) | 5/264 | NT | 6.7% | coding (852/1212 nt) | alaA | glutamate‑pyruvate aminotransferase |
? | NC_002947 | = 2095675 | 72 (1.210) | coding (803/1212 nt) | alaA | glutamate‑pyruvate aminotransferase |
GTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCGAGGCGGTGCTGA > NC_002947/2095535‑2095819 | ggtCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCt > 8:30749/3‑149 (MQ=255) tCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCGTc > 6:348998/1‑149 (MQ=255) cGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTc < 5:119179/148‑1 (MQ=255) tAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGACATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGAt < 2:58550/149‑1 (MQ=255) ggTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATg > 1:348575/1‑148 (MQ=255) tGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAg < 3:270506/149‑1 (MQ=255) ggTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCtg > 8:77939/1‑149 (MQ=255) ggTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCtg > 8:177676/1‑149 (MQ=255) gctgctCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCg > 5:361455/1‑149 (MQ=255) gctgctCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCg > 2:249827/1‑149 (MQ=255) ctCCAGCAGGCGGCCCCGCGGCAGCACCAGCCCGTCGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCCC‑AGGC‑GCAGGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCgtg < 8:268868/147‑1 (MQ=255) tCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCgtggtg > 6:117910/1‑149 (MQ=255) ccAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGc < 6:211967/149‑1 (MQ=255) cagcagGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCt > 7:145793/1‑149 (MQ=255) cccctgcggcCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTAGATGCGCTGCTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGAGGGCTTGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGTCCAGCATGTCGATGCGTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCtt < 8:346166/144‑1 (MQ=255) agcagGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCtt > 3:287127/1‑149 (MQ=255) gcagGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTg > 4:124873/1‑149 (MQ=255) cagGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTgg < 3:124873/149‑1 (MQ=255) ggcggcCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGc > 7:139891/1‑149 (MQ=255) ggcCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCg < 7:289372/149‑1 (MQ=255) gcCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCgg < 6:47411/149‑1 (MQ=255) ccGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGaa < 5:332695/149‑1 (MQ=255) cggcggCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGaaa < 7:3000/149‑1 (MQ=255) cagcaCCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATca < 1:136636/149‑1 (MQ=255) cAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATcag‑ccagc < 2:348575/149‑1 (MQ=255) ggTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATcag‑ccagc > 7:20433/1‑147 (MQ=255) gTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATcag‑ccagc > 3:110530/1‑146 (MQ=255) gTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAg‑ccagcca < 4:110530/148‑1 (MQ=255) gTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGc > 2:168785/1‑149 (MQ=255) gATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCgg > 4:355398/1‑148 (MQ=255) aTGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGaa < 7:30749/149‑1 (MQ=255) ctGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGc > 4:334809/1‑140 (MQ=255) ctGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGc < 3:334809/140‑1 (MQ=255) gTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCa < 2:317932/149‑1 (MQ=255) gTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCa > 6:341682/1‑149 (MQ=255) gTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCa < 8:139891/149‑1 (MQ=255) gccgccCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCAccc < 5:348998/149‑1 (MQ=255) ccgccCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCACGAGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCAccc > 1:275082/1‑149 (MQ=255) ccgccCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGaa < 5:174363/137‑1 (MQ=255) ccgccCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGaa > 6:174363/1‑137 (MQ=255) cgccCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGCGGCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCg > 1:92443/1‑149 (MQ=255) cccAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTa > 7:40368/1‑149 (MQ=255) gcgGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑TCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACtt < 2:316994/149‑1 (MQ=255) ggTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTgg < 8:40368/149‑1 (MQ=255) gTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAGCCCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTgg < 1:249827/149‑1 (MQ=255) gATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGAc > 7:51302/1‑145 (MQ=255) gATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGAc < 8:51302/145‑1 (MQ=255) gATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACaa < 2:29237/147‑1 (MQ=255) tGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTcatccagaccgcgctgggcggctaccagagcatcaacgacctggtgctgccgccgggccgcctgctggagcagcgcaa > 1:369040‑M2/1‑51 (MQ=255) tGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTcatccagaccgcgctgggcggctaccagagcatcaacgacctggtgctgccgccgggccgcctgctggagcagcgcaa < 2:369040‑M2/129‑79 (MQ=255) ggCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGt > 7:163323/1‑149 (MQ=255) gCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTcatccagaccgcgctgggcggctaccagagcatcaacgacctggtgctgccgccg > 7:277054‑M2/1‑49 (MQ=255) gCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTcatccagaccgcgctgggcggctaccagagcatcaacgacctggtgctgccgccg < 8:277054‑M2/104‑56 (MQ=255) cATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGtt > 7:203171/1‑148 (MQ=255) aTGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGa < 4:172642/149‑1 (MQ=255) aTGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGa < 7:77939/149‑1 (MQ=255) tGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGaa < 5:341682/149‑1 (MQ=255) cTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAg < 7:177676/148‑1 (MQ=255) gggCCGGCACGGTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGGTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGCTCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTc < 8:145793/149‑1 (MQ=255) ggCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTc < 8:163323/148‑1 (MQ=255) ggCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCa < 3:355398/149‑1 (MQ=255) ccGGCACGTTGGCCCAC‑ATGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAgg < 4:50537/149‑1 (MQ=255) cGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTTGACAAGCCGTTGAAGGTCAgg > 2:300474/1‑148 (MQ=255) cGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAg < 8:161568/147‑1 (MQ=255) cGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAg > 7:161568/1‑147 (MQ=255) gcgcAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGt < 8:203171/148‑1 (MQ=255) gcAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCg > 6:178431/1‑149 (MQ=255) ac‑aGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTTGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGa < 8:312601/149‑1 (MQ=255) ac‑aGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGa < 8:20433/149‑1 (MQ=255) c‑aGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAg < 2:275082/149‑1 (MQ=255) gc‑gcATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGc > 5:359111/1‑147 (MQ=255) gcATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGc < 5:178431/149‑1 (MQ=255) ttGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCGAGGc > 7:143864/1‑149 (MQ=255) tGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCa < 2:103870/120‑1 (MQ=255) tGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCa > 1:103870/1‑120 (MQ=255) cAGCATGTcatccagaccgcgctgggcggctaccagagcatcaacgacctggtgctgccgccgggccgcctgctggagcagcgcaaccgcacctacgaactgctcaacgacatccctggcgtcagctgcgtgaaaccgatgggcgcgct > 1:58550‑M2/1‑8 (MQ=255) gCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCGAGGCGGTGCTg < 6:359111/149‑1 (MQ=255) cATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCGAGGCGGTGCTGa < 6:138140/149‑1 (MQ=255) cATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGATTGTGCCCGGAAATGATCAT‑CCAGCCAGAGAGGAAGCCCGCCAAACGGTACGACTTGGACAACCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCTGAGCCCGCGAGGCGGTGCTgc > 4:227349/1‑148 (MQ=255) | GTTCGTAGGTGCGGTTGCGCTGCTCCAGCAGGCGGCCCGGCGGCAGCACCAGGTCGTTGATGCTCTGGTAGCCGCCCAGCGCGGTCTGGATGGCATGCTGGGCCGGCACGTTGGCGCAC‑AGGC‑GCATGTTGGCCAGCATGTCGATGCCTTCGATGTAGCTGTGTGCGTGGTGCTTGGGCCCGGAAATGATCAG‑CCAGCCAGAGCGGAAGCCCGCCACCCGGTACGACTTGGACAAGCCGTTGAAGGTCAGGCACAGCAGGTCCGGAGCCAGCGAGGCGGTGCTGA > NC_002947/2095535‑2095819 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |