New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2110535 | 55 (0.910) | 4 (0.070) | 4/250 | NT | 6.9% | coding (3751/4899 nt) | PP_1882 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 2110619 | 56 (0.990) | coding (3667/4899 nt) | PP_1882 | membrane protein |
TGCCTTTCTGCTGCTGGCCCAGCGCCTGCTCGTCATGATGCAGGTACAGGGTTTGCAGGCTGTCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGC > NC_002947/2110391‑2110679 | tGCCTTTCTGCTGCTGGCCCAGCGCCTGCTCGTCATGATGCAGGTACAGGGTTTGCAGGCTGTCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCt > 6:219794/1‑149 (MQ=255) tCTGCTGCTGGCCCAGCGCCTGCTCGTCATGATGCAGGTACAGGGTTTGCAGGCTGTCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGcgtcg > 2:124632/1‑149 (MQ=255) tgctgctgGCCCAGCGCCTGCTCGTCATGATGCAGGTACAGGGTTTGCAGGCTGTCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTa < 2:139460/149‑1 (MQ=255) ctgctgGCCCAGCGCCTGCTCGTCATGATGCAGGTACAGGGTTTGCAGGCTGTCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTa < 8:78427/147‑1 (MQ=255) tgctgGCCCAGCGCCTGCTCGTCATGATGCAGGTACAGGGTTTGCAGGCTGTCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGc > 2:206746/1‑148 (MQ=255) ctgGCCCAGCGCCTGCTCGTCATGATGCAGGTACAGGGTTTGCAGGCTGTCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGcc < 1:104726/147‑1 (MQ=255) tgGCCCAGCGCCTGCTCGTCATGATGCAGGTACAGGGTTTGCAGGCTGTCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑Ta > 7:257853/1‑149 (MQ=255) gCCCAGCGCCTGCTCGTCATGATGCAGGTACAGGGTTTGCAGGCTGTCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAgg > 3:124316/1‑149 (MQ=255) gCCCAGCGCCTGCTCGTCATGATGCAGGTACAGGGTTTGCAGGCTGTCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAgg > 3:129765/1‑149 (MQ=255) gCCCAGCGCCTGCTCGTCATGATGCAGGTACAGGGTTTGCAGGCTGTCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAg < 6:270728/148‑1 (MQ=255) gCCCAGCGCCTGCTCGTCATGATGCAGGTACAGGGTTTGCAGGCTGTCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAg < 1:192667/148‑1 (MQ=255) gCCCAGCGCCTGCTCGTCATGATGCAGGTACAGGGTTTGCAGGCTGTCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAg < 3:15425/148‑1 (MQ=255) tCGTCATGATGCAGGTACAGGGTTTGCAGGCTGTCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCgggg < 6:262977/145‑1 (MQ=255) tCGTCATGATGCAGGTACAGGGTTTGCAGGCTGTCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCgggg > 5:262977/1‑145 (MQ=255) gCAGGTACAGGGTTTGCAGGCTGTCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGtt > 3:303229/1‑148 (MQ=255) ggTACAGGGTTTGCAGGCTGTCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAgg < 2:294320/149‑1 (MQ=255) ggTACAGGGTTTGCAGGCTGTCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAgg < 6:377311/149‑1 (MQ=255) cAGGGTTTGCAGGCTGTCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGccct < 8:257853/149‑2 (MQ=255) cAGGGTTTGCAGGCTGTCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCa < 6:2683/149‑1 (MQ=255) tggTTTGCAGGCTGTCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAg > 7:323876/2‑148 (MQ=255) ggTTTGCAGGCTGTCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGc > 6:102672/1‑148 (MQ=255) tGCAGGCTGTCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCCcggccaattcgctacgacagccagaaccggttgctgggccttaacgacagcggcgcc > 7:91658‑M1/1‑92 (MQ=255) ggCTGTCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTc < 4:303229/149‑1 (MQ=255) tCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTgg < 4:173422/147‑1 (MQ=255) tCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCt > 5:379636/1‑149 (MQ=255) acgcacgGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTg < 1:206746/148‑1 (MQ=255) acgGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCg > 2:61537/1‑147 (MQ=255) acgGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTa < 5:219794/149‑1 (MQ=255) cgGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCCTAACCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGt < 1:302861/149‑1 (MQ=255) tGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAAtt < 6:145626/149‑1 (MQ=255) gcgcAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTg > 6:61251/1‑149 (MQ=255) cgcatggccGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGg > 7:311513‑M2/5‑147 (MQ=255) aCGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCa < 7:325465/113‑1 (MQ=255) aCGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCa > 8:325465/1‑113 (MQ=255) cGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCGGggc > 7:93962‑M2/1‑146 (MQ=255) gCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCATGCTGACCAGCCAGCC‑‑GCCAGCGTCGTAGCCA‑GAGGTGTCCGGGGAGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTGCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGggct < 7:152352‑M2/149‑5 (MQ=255) cTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGggctt < 7:236169‑M2/149‑6 (MQ=255) ccGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCCcggccaattcgctacgacagccagaaccggttgctgggccttaacgacagcggcgccccggacacctatggctacgacgcaggcggcttgctg < 8:91658‑M1/149‑94 (MQ=255) tgaTGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGtc > 3:81042/3‑149 (MQ=255) tCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCCcggccaattcgctacgacagccagaaccggttgctgggccttaacgacagcggcgccccggacacctatggctacgacgcaggcggcttgctggtc < 6:144499‑M1/149‑97 (MQ=255) aTGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGtctc > 6:342327/1‑149 (MQ=255) tGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCg < 5:110753/149‑1 (MQ=255) gcagcagcaGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACGGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGggc > 7:182778‑M2/1‑133 (MQ=255) gcagcagcaGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATAGCCCGggc < 8:182778‑M2/136‑4 (MQ=255) cagcagcagCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCgg < 6:379636/148‑1 (MQ=255) cagcagcagCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCgg < 1:124632/148‑1 (MQ=255) cagcagcagCGCGCGCTCGCCGGCCTCTGGCCGGCGTACCAGCAAGCCcggccaattcgctacgacaggcacaaccggttgctgggccttaacgacagcggcgccccggacacctatggctacgacgcaggcggcttgctggtcagca < 3:235910‑M1/148‑101 (MQ=255) agcagcagcGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCg > 6:246759/1‑117 (MQ=255) agcagcagcGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCg < 5:246759/117‑1 (MQ=255) agcGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGtt > 2:36576/1‑149 (MQ=255) agcGTGCGCCCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGtt < 8:236169/149‑1 (MQ=255) cGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGc > 8:25909/1‑149 (MQ=255) tGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCa < 7:298811/149‑1 (MQ=255) gcTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGGGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGGTCGTCTCGGGTCAg > 5:306846/1‑139 (MQ=255) gcTCGCCGGCCACGGGCCTGCTGACCACCAAGCC‑‑CCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAACGCCCAGCAACCCGTTCTGGCTGTCGTACCGAATTGGCCGGGCTTGCGCGTCTCGGGTCAg < 6:306846/139‑1 (MQ=255) cTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTgg > 4:193052/1‑149 (MQ=255) cTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTgg < 8:323876/149‑1 (MQ=255) gCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCATTAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCa > 1:82635/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATc < 2:107978/149‑1 (MQ=255) ccTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAg < 5:342327/149‑1 (MQ=255) gggCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCAtt < 3:63670/135‑1 (MQ=255) gggCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCAtt > 4:63670/1‑135 (MQ=255) gggCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTg > 2:265448/1‑148 (MQ=255) ctgctgACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTc < 4:275431/149‑1 (MQ=255) tgctgACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTGTGCCTGTCGTAGCGAATTGGCCGggcttgctggtacgccggccagaggccggcgagcgcgcgctgctgctg < 3:235910‑M2/148‑49 (MQ=255) ctgACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAg < 5:61251/148‑1 (MQ=255) gACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGggcttgctggtcagcaggcccgaggccggcgagcgcacgctgctgctgcatga < 6:144499‑M2/149‑54 (MQ=255) cAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGggcttgctggtcagcaggcccgaggccggcgagcgcacgctgctgctgcatgacgg < 8:91658‑M2/149‑57 (MQ=255) cAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTgg > 6:335871/1‑149 (MQ=255) aaGCCcggccaattcgctacgacagccagaaccggttgctgggccttaacgacagcggcgccccggacacctatggctacgacgcaggcggcttgctggtcagcaggcccgaggccggcgagcgcacgctgctgctgcatgacggccag < 7:236169‑M1/149‑145 (MQ=255) aaGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGgcgc < 3:193052/149‑1 (MQ=255) aGCCcggccaattcgctacgacagccagcaccggttgctgggccttaacgacagcggctccccggacacctctggctacgacgctggcggctggctggtcagcatgcccgaggccggcgagcgcacgctgctgctgcatgacggccagc < 7:152352‑M1/149‑146 (MQ=255) gCCcgggctattcgctacgacagccagaaccggttgctgggccttaacgacagcggcgccccggacacctatggctacgacgcaggcggcttgctggtcagcaggcccgaggccggcgagcgcacgctgctgctgc < 8:182778‑M1/136‑134 (MQ=255) gCCcggccaattcgctacgacagccagaacccgttgctgggccttaacgacagcggcgccccggacacctatggctacgacgcaggcggcttgctggtcagcaggcccgaggccggcgagcgcacgctgctgctgc > 7:182778‑M1/1‑3 (MQ=255) gCCccgccaattcgctacgacagccagaaccggttgctgggccttaacgacagcggcgccccggacacctatggctacgacgcaggcggcttgctggtcagcaggcccgaggccggcgagcgcacgctgctgctgcatgacggccagcg > 7:93962‑M1/1‑3 (MQ=255) ccggccaattcgctacgacagccagaaccggttgctgggccttaacgacagcggcgccccggacacctatggctacgacgcaggcggcttgctggtcagcaggcccgaggccggcgagcgcacgctgctgctgcatgacggccatgcg > 7:311513‑M1/1‑1 (MQ=255) | TGCCTTTCTGCTGCTGGCCCAGCGCCTGCTCGTCATGATGCAGGTACAGGGTTTGCAGGCTGTCACGCACGGCCATGCGCAAACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCC‑‑GCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGC > NC_002947/2110391‑2110679 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |