New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2110535 | 55 (0.910) | 4 (0.070) | 4/250 | NT | 6.9% | coding (3751/4899 nt) | PP_1882 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 2110619 | 56 (0.990) | coding (3667/4899 nt) | PP_1882 | membrane protein |
ACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGATACGCTGCAGCTGGCAGGGGTCGCGTTCGGCATGAATGAACGTGGCGCGTTCAGCGGCCGGCCC > NC_002947/2110473‑2110766 | cgcatggccGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGg > 7:311513‑M2/5‑147 (MQ=255) cGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCGGggc > 7:93962‑M2/1‑146 (MQ=255) gCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCATGCTGACCAGCCAGCCGCCAGCGTCGTAGCCA‑GAGGTGTCCGGGGAGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTGCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGggct < 7:152352‑M2/149‑5 (MQ=255) cTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGggctt < 7:236169‑M2/149‑6 (MQ=255) tgaTGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGtc > 3:81042/3‑149 (MQ=255) aTGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGtctc > 6:342327/1‑149 (MQ=255) tGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCg < 5:110753/149‑1 (MQ=255) gcagcagcaGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACGGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGggc > 7:182778‑M2/1‑133 (MQ=255) gcagcagcaGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATAGCCCGggc < 8:182778‑M2/136‑4 (MQ=255) cagcagcagCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCgg < 1:124632/148‑1 (MQ=255) cagcagcagCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCgg < 6:379636/148‑1 (MQ=255) agcGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGtt > 2:36576/1‑149 (MQ=255) agcGTGCGCCCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGtt < 8:236169/149‑1 (MQ=255) cGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGc > 8:25909/1‑149 (MQ=255) tGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCa < 7:298811/149‑1 (MQ=255) gcTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCCGCCTGGGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGGTCGTCTCGGGTCAg > 5:306846/1‑139 (MQ=255) gcTCGCCGGCCACGGGCCTGCTGACCACCAAGCCCCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAACGCCCAGCAACCCGTTCTGGCTGTCGTACCGAATTGGCCGGGCTTGCGCGTCTCGGGTCAg < 6:306846/139‑1 (MQ=255) cTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTgg < 8:323876/149‑1 (MQ=255) cTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTgg > 4:193052/1‑149 (MQ=255) gCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCATTAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCa > 1:82635/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATc < 2:107978/149‑1 (MQ=255) ccTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAg < 5:342327/149‑1 (MQ=255) gggCCTGCTGACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCAtt < 3:63670/135‑1 (MQ=255) gggCCTGCTGACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCAtt > 4:63670/1‑135 (MQ=255) gggCCTGCTGACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTg > 2:265448/1‑148 (MQ=255) ctgctgACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTc < 4:275431/149‑1 (MQ=255) tgctgACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTGTGCCTGTCGTAGCGAATTGGCCGggcttgctggtacgccggccagaggccggcgagcgcgcgctgctgctg < 3:235910‑M2/148‑49 (MQ=255) ctgACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAg < 5:61251/148‑1 (MQ=255) gACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGggcttgctggtcagcaggcccgaggccggcgagcgcacgctgctgctgcatga < 6:144499‑M2/149‑54 (MQ=255) cAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGggcttgctggtcagcaggcccgaggccggcgagcgcacgctgctgctgcatgacgg < 8:91658‑M2/149‑57 (MQ=255) cAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTgg > 6:335871/1‑149 (MQ=255) aaGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGgcgc < 3:193052/149‑1 (MQ=255) gtAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGgt < 7:25909/148‑1 (MQ=255) tAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGGTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGgtgt > 1:66695/1‑149 (MQ=255) a‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCTTCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACt > 5:341667/1‑149 (MQ=255) a‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACt < 2:82635/149‑1 (MQ=255) ggTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGa < 4:81042/149‑1 (MQ=255) gtgtCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGa > 1:167270/1‑148 (MQ=255) gtCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCa > 6:15269/1‑112 (MQ=255) gtCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCa < 5:15269/112‑1 (MQ=255) gggCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGATACGCTg > 5:321711/1‑148 (MQ=255) ggCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGggcttgctggtcagcaggcccgaggccggcgagcgcacgctgctgctgcatgacggccagcgtttgcgcatggccgtgcgtgacagcctgca > 7:91658‑M2/1‑57 (MQ=255) gcgcCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGATACGCTGCAg > 7:85594/1‑149 (MQ=255) cgcTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑Cgcggcg < 4:328920/123‑1 (MQ=255) gcTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGATACGCTGCAGCTGGc < 4:124316/149‑1 (MQ=255) gcTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGATACGCTGCAGCTGGc < 4:129765/149‑1 (MQ=255) ttAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGATACGCTGCAGCTGGCAGGGGTc < 2:167270/149‑1 (MQ=255) aGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGATACGCTGCAGCTGGCAGGGGTcgc < 2:66695/148‑1 (MQ=255) ggCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGATACGCTGCAGCTGGCAGGGGTCGCGt > 5:47421/1‑149 (MQ=255) cccAGCAACCGGTTCAGGCTGTCGTATCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTGCCTCGGCGGTGTGTACTCGATACGCTGCAGCTGGCAGGGGTCGCGtt < 1:265448/149‑1 (MQ=255) ccAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGATACGCTGCAGCTGGCAGGGGTCGCGTTCg < 1:61537/149‑1 (MQ=255) ccAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGATACGCTGCAGCTGGCAGGGGTCGCGTTCg > 3:146051/1‑149 (MQ=255) ccAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGATACGCTGCAGCTGGCAGGGGTCGCGTACg > 8:304764/1‑149 (MQ=255) gCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGATACGCTGCAGCTGGCAGGGGTCGCGTTCGGCa > 5:140594/1‑149 (MQ=255) cAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGATACGCTGCAGCTGGCAGGGGTCGCGTTCGGCat < 5:102672/149‑1 (MQ=255) aCCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCTGTGTGTACTCGAt < 6:290384/115‑1 (MQ=255) aCCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGAt > 5:290384/1‑115 (MQ=255) aCCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGATACGCTGCAGCTGGCAGGGGTCGCGTTCGGCatg > 5:182095/1‑148 (MQ=255) aCCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGATACGCTGCAGCTGGCAGGGGTCGCGTTCGGCatg > 5:86300/1‑148 (MQ=255) cTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGATACGCTGCAGCTGGCAGGGGTCGCGTTCGGCATGAATGAAc < 1:36576/148‑1 (MQ=255) tGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGCACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGATACGCTGCAGCTGGCAGGGGTCGCGTTCGGCATGAATGAACGt > 2:312562/1‑149 (MQ=255) gCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGATACGCTGCAGCTGGCAGGGGTCGCGTTCGGCATGAATGAACGt < 8:85594/147‑1 (MQ=255) gCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGATACGCTGCAGCTGGCAGGGGTCGCGTTCGGCATGAATGAACGTg < 6:140594/148‑1 (MQ=255) gTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGATACGCTGCAGCTGGCAGGGGTCGCGTTCGGCATGAATGAACGTGgcgc < 7:121628/149‑1 (MQ=255) gCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGATACGCTGCAGCTGGCAGGGGTCGCGTTCGGCATGAATGAACGTGGCGCGTTCAg > 5:295969/1‑149 (MQ=255) aaTTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCTGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGATACGCTGCAGCTGGCAGGGGTCGCGTTCGGCATGAATGAACGTGGCGCGTTCAGcgg < 6:321711/149‑1 (MQ=255) aaTTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGATACGCTGCAGCTGGCAGGGGTCGCGTTCGGCATGAATGAACGCGCCACGTTCattca < 6:47421/149‑5 (MQ=255) gCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGATACGCTGCAGCTGGCAGGGGTCGCGTTCGGCATGAATGAACGTGGCGCGTTCAGcggccggc > 3:110804/1‑149 (MQ=255) cGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGAAACGCTGCAGCTGGCAGGGGTCGCGTTAGGCATGAATGAACGGTCCGCGTTCAGctgccggcac > 4:204371/1‑147 (MQ=255) | ACGCTGGCCGTCATGCAGCAGCAGCGTGCGCTCGCCGGCCTCGGGCCTGCTGACCAGCAAGCCGCCTGCGTCGTAGCCA‑TAGGTGTCCGGGGCGCCGCTGTCGTTAAGGCCCAGCAACCGGTTCTGGCTGTCGTAGCGAATTGGCCGGGCTTGCTCGTCTCGGGTCAGGTTGCCATTGGCATCGTAGCTGAACTCAGGATTGGGCGCGGTG‑CGCGGCGGTGTGTACTCGATACGCTGCAGCTGGCAGGGGTCGCGTTCGGCATGAATGAACGTGGCGCGTTCAGCGGCCGGCCC > NC_002947/2110473‑2110766 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |