New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2418682 = | 37 (0.620) | 4 (0.070) | 4/252 | NT | 9.8% | coding (1717/1764 nt) | PP_2119 | ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | 2418728 = | 39 (0.680) | coding (1763/1764 nt) | PP_2119 | ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
AGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGCCTCAACTGTTGCGTAAGTGCTCGACCTGGCTGCCATTGCGTGATGGCA > NC_002947/2418536‑2418827 | gctgaggccgctgtacagcctcattactggcaggccaaaaaaaagctgccatcacgcaatggcagccaggtcgagcacttacgcaacagttgaggcaaatcttctcaggcaattactacagaaatgttacaaggccacgacacgctAGc < 4:191776‑M1/3‑1 (MQ=255) gCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCACGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCAACGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGAGGGCCCCCACCGTCAGATGAATCAGGACAccc > 7:261649/1‑149 (MQ=255) tgaggccgctgtacagcctcattactggcaggccaaaaaaaagctgccatcacgcaatggcagccaggtcgagcacttacgcaacagttgaggcaaatcttctcaggcaattactacagaaatgttacaaggccacgacacgctAGccc < 3:34501‑M1/5‑1 (MQ=255) cgcTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTg < 6:232255/149‑1 (MQ=255) gcTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGt < 7:274180/149‑1 (MQ=255) cccAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATgc > 1:105845/1‑149 (MQ=255) ccAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATgcg < 5:118009/149‑1 (MQ=255) ccTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGc < 3:72592/149‑1 (MQ=255) ggccggccGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGCCCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAg > 6:293202/1‑149 (MQ=255) cggccgTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAgcgc < 8:208080/149‑1 (MQ=255) cggccgTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAgcgc > 8:328472/1‑149 (MQ=255) ccgTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGc < 6:47873/149‑1 (MQ=255) tACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAAt < 4:140763/149‑1 (MQ=255) cACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTca > 1:286642/1‑149 (MQ=255) caaaaaaaagctgccatcacgcaatggcagccaggtcgagcacttacgcaacagttgaggcaaatcttctcaggcaattactacagaaatgttacaaggccacgacacgctAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTcac < 4:107173‑M1/38‑1 (MQ=255) tGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGc < 5:293202/149‑1 (MQ=255) gCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCg < 6:136403/149‑1 (MQ=255) ccatcacgcaatggcagccaggtcgagcacttacgcaacagttgaggcaaatcttctcaggcaattactacagaaatgttacaaggccacgacacgctAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGc > 3:107173‑M1/99‑147 (MQ=255) gCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTg > 2:228288/1‑149 (MQ=255) gCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCtt > 5:111140/1‑149 (MQ=255) cACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGACATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCATTTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTg > 1:216706/1‑148 (MQ=255) aCGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATg > 7:345785/1‑97 (MQ=255) aCGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATg < 8:345785/97‑1 (MQ=255) cGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTaa < 2:105845/149‑1 (MQ=255) gTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGATGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACa > 1:169773/1‑149 (MQ=255) aTGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTg > 1:83685/1‑148 (MQ=255) ccGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTgaag > 4:31359/1‑148 (MQ=255) tCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGATGCCAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACCGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTg < 2:272766/149‑1 (MQ=255) agttgaggcaaatcttctcaggcaattactacagaaatgttacaaggccacgacacgctAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGc > 3:283505‑M1/60‑104 (MQ=255) agttgaggcaaatcttctcaggcaattactacagaaatgttacaaggccacgacacgctAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGc < 4:283505‑M1/45‑1 (MQ=255) aTCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGAAGTAATTGCCTGAGAAGAtt < 3:31359/149‑1 (MQ=255) tCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCATTTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGAttt < 2:216706/149‑1 (MQ=255) tCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGAAAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGAttt > 5:18760/1‑149 (MQ=255) aCCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTTTGCGCGGCTGGCAGCGCTGAAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGcc < 7:94585/149‑1 (MQ=255) gggCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTa > 4:28225/1‑111 (MQ=255) gggCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTa < 3:28225/111‑1 (MQ=255) tggCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGCCTCAACTGTTGCGTaa > 3:59414/1‑149 (MQ=255) tggCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGCCTCAACTGTTGCGTaa < 4:173793/149‑1 (MQ=255) gTGGGTGCCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAAATGCCTGAGAAGATTTGCCTCAACTGTTGCGTAAGTGCt > 5:190584/1‑149 (MQ=255) tCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATCCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGCCTCAACTGTTGCGTAAGTGCTCGACCTGGCTGCCa > 1:175870/1‑149 (MQ=255) gTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGAtt > 2:85099/1‑108 (MQ=255) gTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGAtt < 1:85099/108‑1 (MQ=255) gattgaGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGCCTCAACTGTTGCGTAAGTGCTCGACCTGGCTGCCATTGCGt > 3:68504/1‑149 (MQ=255) gattgaGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGCCTCAACTGTTGCGTAAGTGCTCGACCTGGCTGCCATTGCGt > 4:262808/1‑149 (MQ=255) aGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGCCTCAACTGTTGCGTAAGTGCTCGACCTGGCTGCCATTGCGTGATg < 3:298691/148‑1 (MQ=255) aGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCT‑‑GAAGATTTGCCTCAACTGTTGCGTAAGTGCTCGACCTGGCTGCCATTGCGTGATGGCa < 2:83685/149‑1 (MQ=255) gACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGCCTCAACTGTTGCGTAAGTGCTCGACCTGGCTGCCATTGCGTGATgg > 3:28194/1‑147 (MQ=255) aCAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGCCTCAACTGTTGCg < 2:138713/113‑1 (MQ=255) aCAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGCCTCAACTGTTGCg > 1:138713/1‑113 (MQ=255) | AGCAAGCGCTGCCCAGCCTGATGGCCGGCCGTACCACGCTGGTGATCGCCCATCGCCTGGCCACGGTACAGCATGCCGAGCGCATCGCGGTCATCGACCAGGGCCGGCTGGTGGCGGTGGGCACCCACCGTCAGTTGATTGAGGACAGCCCGTTGTATGCGCGGCTGGCAGCGCTGCAATTCACCACGGGCTAGCGTGTCGTGGCCTTGTAACATTTCTGTAGTAATTGCCTGAGAAGATTTGCCTCAACTGTTGCGTAAGTGCTCGACCTGGCTGCCATTGCGTGATGGCA > NC_002947/2418536‑2418827 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |