New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2880423 = | 38 (0.630) | 4 (0.070) | 4/254 | NT | 8.6% | coding (265/1176 nt) | PP_2535 | transport protein |
? | NC_002947 | 2880518 = | 49 (0.850) | coding (360/1176 nt) | PP_2535 | transport protein |
TGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGTGCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTT > NC_002947/2880278‑2880570 | tgctgcGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGCCCCTGCCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTCATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTAGGGCAACCTGATGTCGGCCCTgg > 6:46285/1‑149 (MQ=255) cGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGc < 6:191668/149‑1 (MQ=255) gggCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATGGGCGTGCTGATCGGCGCGGCGGTGATGACGCTGGCCAGGGTTAAGATCCCGGGCCGTTACCTGTTGAGCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTGGGGCGTGgcgagcga < 6:271077/149‑1 (MQ=255) ggCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGAc > 7:282001/1‑149 (MQ=255) ctgGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGc < 4:100529/149‑1 (MQ=255) gTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCa < 8:324695/148‑1 (MQ=255) tCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAg > 7:344549/1‑148 (MQ=255) tCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGc < 5:210239/149‑1 (MQ=255) ccTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCctgctg < 6:29388/149‑1 (MQ=255) cTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGCCCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCtgg > 4:239767/1‑149 (MQ=255) tGCCCTCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGAAGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCtggtg < 8:208378/148‑1 (MQ=255) gccaacccagcatttcacccaaccaggtcgccaacggcacgccgccgatggtggccagggtcaaacccatgaacattgcagccacggccccggcgcgcttctcgggcggcaccacaCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGcc < 5:204274‑M1/33‑1 (MQ=255) ccATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCAGGCtggcgta < 8:344549/148‑5 (MQ=255) gCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTTGCCAGCAACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTg > 3:245449/1‑149 (MQ=255) cGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTgg < 8:57776/149‑1 (MQ=255) gATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGtcactt > 7:183207/1‑149 (MQ=255) aTCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGtcactt < 5:53495/148‑1 (MQ=255) ggCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGtcacttcac < 8:282001/148‑1 (MQ=255) gcgcgcCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTc < 8:326281/149‑1 (MQ=255) gcgcgcCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTCGCCAGCAACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTc < 4:245449/149‑1 (MQ=255) cgcgcCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCa < 5:330869/149‑1 (MQ=255) atgaCCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGgcgc > 3:352593/1‑149 (MQ=255) gCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTg < 5:243501/148‑1 (MQ=255) cACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTg > 1:246474/1‑146 (MQ=255) cACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTg < 2:246474/146‑1 (MQ=255) aCGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCAt < 8:293107/149‑1 (MQ=255) aCGGTGAAGATCCCGCGCCGGTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCAt < 7:150085/149‑1 (MQ=255) gccgatggtggccagggtcaaacccatgaacattgcagccacggccccggcgcgcttctcgggcggcaccacaCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCg < 4:345139‑M1/76‑1 (MQ=255) ccagggtcaaacccatgaacattgcagccacggccccggcgcgcttctcgggcggcaccacaCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGAtcgtc > 3:345139‑M1/63‑149 (MQ=255) gtcaaacccatgaacattgcagccacggccccggcgcgcttctcgggcggcaccacaCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGc > 6:204274‑M1/58‑149 (MQ=255) aCCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAgt > 6:84952/1‑149 (MQ=255) ttGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTgtggt < 3:239767/149‑1 (MQ=255) gATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTgtggtg < 5:7159/148‑1 (MQ=255) aacGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGTgcc > 1:348161/3‑149 (MQ=255) tGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGTGCCGccc > 6:144591/1‑146 (MQ=255) ggCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGTGCCGCCCGAGAAgc > 7:280489/1‑149 (MQ=255) gCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGTGCCGCCCGAGAAgc < 4:352593/148‑1 (MQ=255) aTTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGTGCCGCCCGAGAAgcgcgc > 8:208539/1‑149 (MQ=255) tCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGTGCCGCCCGAGAAGCGCGCCggg > 6:332436/1‑149 (MQ=255) gCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGTGCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCt < 5:84952/149‑1 (MQ=255) gATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGTGCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGt > 2:120249/1‑149 (MQ=255) gTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGTGCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCa > 6:335050/1‑149 (MQ=255) tCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCTGCGTGGTGGTGGCGCGCGTGGTCACTTCACTCATGCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGTTCGTCGCGGCCAGTGTGGTGCCGCCCGAGAAGCGCGGCGGGGCCGTGGCTGCATTGTTCAt < 2:348161/149‑1 (MQ=255) ggCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATGGTCGCGGCCAGTGTGGTGCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATgg < 5:46285/149‑1 (MQ=255) ggCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGTGCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATgg < 7:208539/149‑1 (MQ=255) ggCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGTGCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATgg > 2:308310/1‑149 (MQ=255) cccTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGTGCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATg > 6:198200/1‑146 (MQ=255) cccTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACATCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGGGGCCAGTGTGGTGCCGGCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATg < 5:198200/146‑1 (MQ=255) ccTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGTGCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGtt > 1:242468/1‑149 (MQ=255) | TGCTGCGGGGCTGCTGGTCAGTGCCTATGCCATCGGCGTGCTGATCGGCGCGCCGCTGATGACCCTGGCCACGGTGAAGATCCCGCGCCGTTACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGTGCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTT > NC_002947/2880278‑2880570 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |