New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2880423 = | 38 (0.630) | 4 (0.070) | 4/254 | NT | 8.6% | coding (265/1176 nt) | PP_2535 | transport protein |
? | NC_002947 | 2880518 = | 49 (0.850) | coding (360/1176 nt) | PP_2535 | transport protein |
ACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGTTGGGTGAAATGCTGGGTTGGCGCACGGCGTTCTGGGGTATTGCCG > NC_002947/2880370‑2880657 | aCCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAgt > 6:84952/1‑149 (MQ=255) ttGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTgtggt < 3:239767/149‑1 (MQ=255) gATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTgtggt‑g < 5:7159/148‑1 (MQ=255) aacGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑gcc > 1:348161/3‑149 (MQ=255) tGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGccc > 6:144591/1‑146 (MQ=255) ggCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAgc > 7:280489/1‑149 (MQ=255) gCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAgc < 4:352593/148‑1 (MQ=255) aTTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAgcgcgc > 8:208539/1‑149 (MQ=255) tCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCggg > 6:332436/1‑149 (MQ=255) gCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCt < 5:84952/149‑1 (MQ=255) gATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGt > 2:120249/1‑149 (MQ=255) gTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCa > 6:335050/1‑149 (MQ=255) tCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCTGCGTGGTGGTGGCGCGCGTGGTCACTTCACTCATGCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGTTCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGGCGGGGCCGTGGCTGCATTGTTCAt < 2:348161/149‑1 (MQ=255) ggCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATGGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATgg < 5:46285/149‑1 (MQ=255) ggCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATgg < 7:208539/149‑1 (MQ=255) ggCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATgg > 2:308310/1‑149 (MQ=255) cccTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATg > 6:198200/1‑146 (MQ=255) cccTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACATCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGGGGCCAGTGTGGT‑GCCGGCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATg < 5:198200/146‑1 (MQ=255) ccTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGtt > 1:242468/1‑149 (MQ=255) gccgcgacgatcgagccgatgccaaagaaggcgccgtggttgagtgaagtgaccacgcgggccaccagcaggctggcgtagtcgctggccagTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGAc > 6:204274‑M2/93‑149 (MQ=255) CCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGAcc < 3:237876‑M1/149‑1 (MQ=255) CCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGAcc > 8:183207‑M1/1‑149 (MQ=255) gacgatcgagccgatgccaaagaaggcgccgtggttgagtgaagtgaccacgcgggccaccagcaggctggcgtagtcgctggccagTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTgg > 3:345139‑M2/88‑149 (MQ=255) cGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCgg < 3:258847/108‑1 (MQ=255) cGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCgg > 4:258847/1‑108 (MQ=255) cAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATcg > 1:36561/1‑149 (MQ=255) cAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATcg > 4:139343/1‑149 (MQ=255) cgatgccaaagaaggcgccgtggttgagtgaagtgaccacgcgggccaccagcaggctggcgtagtcgctggccagTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATcggc < 4:345139‑M2/73‑1 (MQ=255) gtggCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGc < 5:335050/148‑1 (MQ=255) cccGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTg < 5:332436/149‑1 (MQ=255) ccGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTgg > 7:250605/1‑149 (MQ=255) gTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTg < 8:250605/149‑1 (MQ=255) acttcactCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGtt > 7:339147/1‑149 (MQ=255) acttcaccCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCAt > 2:98871/1‑122 (MQ=255) acttcaccCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCAt < 1:98871/122‑1 (MQ=255) actCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGTTGGGt > 2:217964/1‑148 (MQ=255) acccAACCCCGGCGCCTTCTTTGCCATCGGCTCGATCGGCGCGGCCAGTGTGCTATCCGCCCGTATAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGTTGGGt < 1:308310/146‑1 (MQ=255) tCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTGGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGTTGGGTGa > 1:32638/1‑148 (MQ=255) aaCCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGTTGGGTGAAAt > 1:168486/1‑149 (MQ=255) aaCCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGTTGGGTGAAAt > 1:174137/1‑149 (MQ=255) cACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGTTGGGTGAAATGCt > 6:210736/1‑149 (MQ=255) aCGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGTTGGGTGAAATGCTg < 3:139343/149‑1 (MQ=255) cGGCGCCTTCTTTGGCATCGGGTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGTTGGGTGAAATGCttg < 1:276276/149‑3 (MQ=255) gcgcCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGTTGGGTGAAATGCTGGGt > 8:244244/1‑149 (MQ=255) gcgcCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGTTGGGTGAAATGCTGGGt < 5:210736/149‑1 (MQ=255) gcCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGTTGGGTGAAATGCTGGGTTg < 5:144591/149‑1 (MQ=255) ggccaccagcaggctggcgtagtcgctggccagTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGTTGGGTGAAATGCTGGGTTGgc < 5:204274‑M2/116‑1 (MQ=255) ttcttTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGTTGGGTGAAATGCTGGGTTGgcg > 1:337481/1‑149 (MQ=255) tttGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGTTGGGTGAAATGCTGGGTTGGCGCAc > 2:355069/1‑149 (MQ=255) gCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGTTGGGTGAAATGCTGGGTTGGCGCACGGCGTTCTgg > 1:311344/1‑149 (MQ=255) cTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGTTGGGTGAAATGCTGGGTTGGCGCACGGCGTTCTggg < 1:120249/149‑1 (MQ=255) cTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGTTGGGTGAAATGCTGGGTTGGCGCACGGCGTTCTggg < 2:168486/149‑1 (MQ=255) cTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGTTGGGTGAAATGCTGGGTTGGCGCACGGCGTTCTggg < 2:174137/149‑1 (MQ=255) cTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGTTGGGTGAAATGCTGGGTTGGCGCACGGCGTTCTggg < 2:36561/149‑1 (MQ=255) gATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGTTGGGTGAAATGCTGGGTTGGCGCACGGCGTTCTGGGGTa > 7:298202/1‑149 (MQ=255) aTCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGTTGGGTGAAATGCTGGGTTGGCGCACGGCGTTCTGGGGTAt > 1:353346/1‑149 (MQ=255) tcgCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCGGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGTTGGGTGAAATGGTGGGTTGGCGCACGGCGTTCTGGGGTATTGcc > 7:56187/1‑149 (MQ=255) tcgCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGGTGGGTGATATGCTGGGTTGGCGCACGGCGTTCTGGGGTATTGcc > 6:309431/1‑149 (MQ=255) gcgGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGTTGGGTGAAATGCTGGGTTGGCGCACGGCGTTCTGGGGTATTGCCg < 2:32638/148‑1 (MQ=255) | ACCTGTTGATCGGGCTGATGGCCATTTTCACCTTGGGCAACCTGATGTCGGCCCTGGCCAGCGACTACGCCAGCCTGCTGGTGGCCCGCGTGGTCACTTCACTCAACCACGGCGCCTTCTTTGGCATCGGCTCGATCGTCGCGGCCAGTGTGGT‑GCCGCCCGAGAAGCGCGCCGGGGCCGTGGCTGCAATGTTCATGGGTTTGACCCTGGCCACCATCGGCGGCGTGCCGTTGGCGACCTGGTTGGGTGAAATGCTGGGTTGGCGCACGGCGTTCTGGGGTATTGCCG > NC_002947/2880370‑2880657 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |