New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2954393 | 46 (0.760) | 4 (0.070) | 4/252 | NT | 8.1% | coding (105/1383 nt) | PP_2586 | putative amino acid transporter |
? | NC_002947 | = 2954428 | 47 (0.830) | coding (70/1383 nt) | PP_2586 | putative amino acid transporter |
CCGTAACTGTAGGCGGTCAGCAGCATGGCGGCGAGCGTGAGCAGGTAGGCGGTGGGCAGGTGCCCTTTGGTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATGCGGGGCGGGGCTATGGGCTGTACTTGTTGTTGTATGCATTGCTAACTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCG > NC_002947/2954253‑2954538 | ccGTAACTGTAGGCGGTCAGCAGCATGGCGGCGAGCGTGAGCAGGTAGGCGGTGGGCAGGTGCCCTTTGGTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCGCCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGt < 5:336558/149‑1 (MQ=255) cGTAACTGTAGGCGGTCAGCAGCATGGCGGCGAGCGTGAGCAGGTAGGCGGTGGGCAGGTGCCCTTTGGTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTc < 1:236931/149‑1 (MQ=255) aGGCGGTCAGCAGCATGGCGGCGAGCGTGAGCAGGTAGGCGGTGGGCAGGTGCCCTTTGGTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCggccgcttccgcaagtc > 4:218965‑M1/1‑131 (MQ=255) aGGCGGTCAGCAGCATGGCGGCGAGCGTGAGCAGGTAGGCGGTGGGCAGGTGCCCTTTGGTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATg > 1:278148/1‑149 (MQ=255) ggCGGTCAGCAGCATGGCGGCGAGCGTGAGCAGGTAGGCGGTGGGCAGGTGCCCTTTGGTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATg > 5:366502/1‑148 (MQ=255) gcaTGGCGGCGAGCGTGAGCAGGTAGGCGGTGGGCAGGTGCCCTTTGGTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAg > 8:56073/1‑149 (MQ=255) tGGCGGCGAGCGTGAGCAGGTAGGCGGTGGGCAGGTGCCCTTTGGTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAAAACGGCCAGGGGCACCATGAAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGCCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCgg > 8:281817/1‑149 (MQ=255) cgAGCGTGAGCAGGTAGGCGGTGGGCAGGTGCCCTTTGGTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCggtg > 6:248916‑M2/1‑145 (MQ=255) gTGAGCAGGGAGGCTGTGGGCTGGTGGCCTTTGGTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACTGCCAGGGGCAACATGTATGCCAGGCCAAACAGCACCggccgcttccgcaagtccatgagcatgaccgccctggtggtgtt < 4:132039‑M1/149‑45 (MQ=255) tGAGCAGGTAGGCGGTGGGCAGGTGCCCTTTGGTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCggccgcttccgcaagtccatgagcatgaccgccctggtgctgttt < 3:218965‑M1/149‑46 (MQ=255) tGAGCAGGTAGGCGGTGGGCAGGTGCCCTTTGGTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGc < 1:338533/129‑1 (MQ=255) tGAGCAGGTAGGCGGTGGGCAGGTGCCCTTTGGTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGc > 2:338533/1‑129 (MQ=255) tGAGCAGGTAGGCGGTGGGCAGGTGCCCTTTGGTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTg > 3:189069/1‑149 (MQ=255) aGCAGGTAGGGGGTGGGCAGGTGCCCTTTGGTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGATTACGGCAAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCggccgcttccgcaagtccatgagcatgaccgccctggtgctgtttg < 5:5212‑M1/148‑47 (MQ=255) cAGGTAGGCGGTGGGCAGGTGCCCTTTGGTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCgg > 3:106451/1‑149 (MQ=255) aGGTAGGCGGTGGGCAGGTGCCCTTTGGTCATCTGGGTGACCAGCGCGTAGGTGGTGAATACCGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACATGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCggg < 1:211986/149‑1 (MQ=255) tAGGCGGTGGGCAGGTGCCCTTTGGTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACACCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTg < 6:73920/149‑1 (MQ=255) cGGTGGGCAGGTGCCCTTTGGTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAg < 8:91644/149‑1 (MQ=255) gTGGGCAGGTGCCCTTTGGTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAggg < 4:189069/149‑1 (MQ=255) gTGCCCTTTGGTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATgcg > 1:136216/1‑149 (MQ=255) gTGCCCTTTGGTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATgcg > 7:116173/1‑149 (MQ=255) tGCCCTTTGGTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATgcgg < 6:366502/149‑1 (MQ=255) tGCCCTTTGGTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATgcgg > 5:238986/1‑149 (MQ=255) gCCCTTTGGTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATgcggg > 1:103666/1‑149 (MQ=255) tGGTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATgcggggcggg < 2:103666/148‑1 (MQ=255) ggTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATGcggggcgggg < 8:16499/148‑1 (MQ=255) ggTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATGcggggcgggg < 4:106451/148‑1 (MQ=255) ggTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATGcggggcgggg < 2:136216/148‑1 (MQ=255) gTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATGCggggcggggc > 4:312308/1‑148 (MQ=255) cATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATGCGGGGCGGGGCTAt > 3:168650/1‑149 (MQ=255) gTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCAGGGACTAGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGCGTTGCGAGGGTGCATGCGGGGCGGGGCTATGGGcag > 2:297543/1‑146 (MQ=255) aGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCGAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATGCGGGGCGGGGCTATGGGCTGTa < 8:199051/144‑1 (MQ=255) aGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATGCGGGGCGGGGCTATGGGCTGTa > 7:199051/1‑144 (MQ=255) gCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATGCGGGGCGGGGCTATGGGCTGTACttgtt < 2:341199/149‑1 (MQ=255) gCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATGCGGGGCGGGGCTATGGGCTGTACttgtt < 7:173217/149‑1 (MQ=255) cGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATGCGGGGCGGGGCTATGGGCTGTACttgttgtt < 8:116173/149‑1 (MQ=255) cGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATGCGGGGCGGGGCTATGGGCTGTACttgttgtt > 6:317080/1‑149 (MQ=255) tAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCGAGGCCAAAGAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGTTTGCTGCCGGTTCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATGGGGGGCGGGGCTATGGGCTGTACTttttgttgt < 7:281817/149‑1 (MQ=255) tggtgAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATGCGGGGCGGGGCTATGGGCTGTACTTGTTGTTGTAt > 8:158373/1‑147 (MQ=255) tggtgAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATGCGGGGCGGGGCTATGGGCTGTACTTGTTGTTGTAt < 7:158373/147‑1 (MQ=255) gAATACGGACAGGGGAACCATTTAGGCCAGTCCAAACAGAAAAAGGGCGGTCATGATAATTGACTTGCGGAAGCTGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATGCGGGGCGGGGCTATGGGCTGTACTTGTTGTTGTATGCATTg > 3:172097/1‑149 (MQ=255) atttcgtccAGGGGCACCATGTTGGCCAGGCAAAACAGCACCTGGGCGGTCATGCTCATGGAGTTGCGGTAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATGGGGGGCGGGGCTATGGGCTGTAGTTGTTGTTGTTTGCATTg < 2:186740/141‑1 (MQ=255) aTACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATGCGGGGCGGGGCTATGGGCTGTACTTGTTGTTGTATGCATTGCt < 6:238986/149‑1 (MQ=255) gCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGGATGCGGGGCGGGGCTATGGGCTGTACTTGTTGTTGTATGCATTGCTAACTCCTGaaaa < 6:312652/149‑1 (MQ=255) gCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATGCGGGGCGGGGCTATGGGCTGTACTTGTTGTTGTATGCATTGCTAACTCCTGaaaa < 3:312308/149‑1 (MQ=255) gCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATGCGGGGCGGGGCTATGGGCTGTACTTGTTGTTGTATGCATTGCTAACTCCTGaa > 5:119319/1‑147 (MQ=255) tGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATGCGGGGCGGGGCTATGGGCTGTACTTGTTGTTGTATGCATTGCTAACTCCTGAAAAGGGATg > 1:333327/1‑149 (MQ=255) tAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATGCGGGGCGGGGCTATGGGCTGTACTTGTTGTTGTATGCATTGCTAACTCCTGAAAAGGGATGCa < 2:278148/149‑1 (MQ=255) gccaCACAGCCCCAGGGCGGTCATGCGCCTGGACTTGCGGAAGCGGCCGGGGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATGCGGGGCGGGGCTATGGGCTGTACTTGTTGTTGTATGCATTGCTAACTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACcg < 4:172097/149‑1 (MQ=255) ccaAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATGCGGGGCGGGGCTATGGGCTGTACTTGTTGTTGTATGCATTGCTAACTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACcgc > 8:47683/1‑149 (MQ=255) caAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCggtgctgtttggcctggcctacatggtgccccttgccgtaatcaccacctacgggctggtcacccagatgaccaaagggcacctgcccaccccctacctgct < 5:5212‑M2/148‑103 (MQ=255) caAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATGCGGGGCGGGGCTATGGGCTGTACTTGTTGTTGTATGCATTGCTAACTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACcgcg > 2:363088/1‑149 (MQ=255) aaaCAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCggtgctgtttggcctggcctacatggtgcccctggccgtattcaccacctacgggctggtcacccagatgaccaaagggcacctgcccaccgcctacctgctca < 3:218965‑M2/149‑105 (MQ=255) aaCACCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCggtgctgtttggcctggcatacatgttgcccctggcagtattcaccacctacgggctggtcacccagatgaccaaaggccaccagcccacagcctccctgctcac < 4:132039‑M2/149‑106 (MQ=255) cACCggccgcttccgcaagtccatgagcatgaccgccctggtgctgtttggcctggcctacatggtgcccctggccgtattcaccacctacgggctggtcacccagatgaccaaagggcacctgcccaccgcctacctgctcacgctcg > 6:248916‑M1/1‑4 (MQ=255) | CCGTAACTGTAGGCGGTCAGCAGCATGGCGGCGAGCGTGAGCAGGTAGGCGGTGGGCAGGTGCCCTTTGGTCATCTGGGTGACCAGCCCGTAGGTGGTGAATACGGCCAGGGGCACCATGTAGGCCAGGCCAAACAGCACCAGGGCGGTCATGCTCATGGACTTGCGGAAGCGGCCGGTGCTGGTGCCGGGTTGCGAGGGTGCATGCGGGGCGGGGCTATGGGCTGTACTTGTTGTTGTATGCATTGCTAACTCCTGAAAAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCG > NC_002947/2954253‑2954538 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |