New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3590042 = | 49 (0.810) | 4 (0.070) | 3/250 | NT | 8.3% | coding (563/1251 nt) | nicP‑I | porin‑like protein |
? | NC_002947 | 3590096 = | 42 (0.740) | coding (617/1251 nt) | nicP‑I | porin‑like protein |
TGCCGGTGCTGACCTTCAGTGATATTCGCCTGTTGCCACCCACCTATCAGGGCGTGAGTTTGAGCTCGTCGGAAATCGACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGTTCAATGCCAACCAAAGCAGCGTCAGCCTTTGGTACGGTCAGCTGGAGGACATCTACCAACAAGGCTTTG > NC_002947/3589895‑3590188 | ccaggttggcactgagtacccagtcgccgacgggtttgctgtgcttcaggccaacaaagccttgttggtagatgtcctccagctgaccgtaccaaaggctgacgctgctttggttggcattgaacgcatagtccccacccacatagtTg > 7:104102‑M1/148‑149 (MQ=255) caggttggcactgagtacccagtcgccgacgggtttgctgtgcttcaggccaacaaagccttgttggtagatgtcctccagctgaccgtaccaaaggctgacgctgctttggttggcattgaacgcatagtccccacccacatagtTGa > 2:19674‑M1/147‑149 (MQ=255) aggttggcactgagtacccagtcgccgacgggtttgctgtgcttcaggccaacaaagccttgttggtagatgtcctccagctgaccgtaccaaaggctgacgctgctttggttggcattgaacgcatagtccccacccacatagtTGaa > 3:89187‑M1/146‑149 (MQ=255) ggttggcactgagtacccagtcgccgacgggtttgctgtgcttcaggccaacaaagccttgttggtagatgtcctccagctgaccgtaccaaaggctgacgctgctttggttggcattgaacgcatagtccccacccacatagtTGAAc > 4:39036‑M1/145‑149 (MQ=255) gCTGACCTTCAGTGATATTCGCCTGTTGCCACCCACCTATCAGGGCGTGAGTTTGAGCTCGTCGGAAATCGACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGa > 5:234399/1‑149 (MQ=255) cTTCAGTGATATTCGCCTGTTGCCACCCACCTATCAGGGCGTGAGTTTGAGCTCGTCGGAAATCGACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCg > 2:177773/1‑149 (MQ=255) cTTCAGTGATATTCGCCTGTTGCCACCCACCTATCAGGGCGAGAGTTTGAGCTCGTCGGAAATCGACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGAAGAACGCGATGCTCg > 2:183488/1‑149 (MQ=255) ttCAGTGATATTCGCCTGTTGCCACCCACCTATCAGGGCGTGAGTTTGAGCTCGTCGGAAATCGACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCgg > 5:342335/1‑149 (MQ=255) tGATATTCGCCTGTTGCCACCCACCTATCAGGGCGTGAGTTTGAGCTCGTCGGAAATCGACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCAtg > 4:186780/1‑149 (MQ=255) ttCGCCTGTTGCCACCCACCTATCAGGGCGTGAGTTTGAGCTCGTCGGAAATCGACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGcc > 6:372725/1‑148 (MQ=255) tCGCCTGTTGCCACCCACCTATCAGGGCGTGAGTTTGAGCTCGTCGGAAATCGACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGa > 7:59981/1‑149 (MQ=255) gCCTGTTGCCACCCACCTATCAGGGCGTGAGTTTGAGCTCGTCGGAAATCGACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATg > 7:347468/1‑149 (MQ=255) gCCTGTTGCCACCCACCTATCAGGGCGTGAGTTTGAGCTCGTCGGAAATCGACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATg > 3:284019/1‑149 (MQ=255) ccTGTTGCCACCCACCTATCAGGGCGTGAGTTTGAGCTCGTCGGAAATCGACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGc > 2:271605/1‑149 (MQ=255) acccaccTATCAGGGCGTGAGTTTGAGCTCGTCGGAAATCGACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCCATGGCAAGATCAACGCGATGGTCGGCCAt > 3:241083/1‑130 (MQ=255) ccaccTATCAGGGCGTGAGTTTGAGCTCGTCGGAAATCGACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGa > 4:61838/1‑148 (MQ=255) accTATCAGGGCGTGAGTTTGAGCTCGTCGGAAATCGACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAg > 7:104720/1‑149 (MQ=255) accTATCAGGGCGTGAGTTTGAGCTCGTCGGAAATCGACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAg < 3:247944/149‑1 (MQ=255) tATCAGGGCGTGAGTTTGAGCTCGTCGGAAATCGACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGTACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGa > 8:323957/1‑149 (MQ=255) tCAGGGCGTGAGTTTGAGCTCGTCGGAAATCGACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGAc < 5:200805/148‑1 (MQ=255) aGGGCGTGAGTTTGAGCTCGTCGGAAATCGACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGTACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGAcgc < 7:323957/148‑1 (MQ=255) aGGGCGTGAGTTTGAGCTCGTCGGAAATCGACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGAcgc < 1:247420/148‑1 (MQ=255) ggCGTGAGTTTGAGCTCGTCGGAAATCGACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGtt < 7:179991/149‑1 (MQ=255) gTGAGTTTGAGCTCGTCGGAAATCGACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCaa < 3:62927/149‑1 (MQ=255) acaaagccttgttggtagatgtcctccagctgaccgtaccaaaggctgacgctgctttggttggcattgaacgcatagtccccacccacatagtTGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCaa > 3:336240‑M1/95‑149 (MQ=255) aaagccttgttggtagatgtcctccagctgaccgtaccaaaggctgacgctgctttggttggcattgaacgcatagtccccacccacatagtTGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCaa < 6:252941‑M1/55‑1 (MQ=255) aaagccttgttggtagatgtcctccagctgaccgtaccaaaggctgacgctgctttggttggcattgaacgcatagtccccacccacatagtTGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCaa > 5:252941‑M1/93‑147 (MQ=255) gTTTGAGCTCGTCGGAAATCGACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACACACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTAGGCCATGTGCAGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTAt > 1:164647/1‑149 (MQ=255) agccttgttggtagatgtcctccagctgaccgtaccaaaggctgacgctgctttggttggcattgaacgcatagtccccacccacatagtTGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTAt > 8:62049‑M1/91‑149 (MQ=255) gtcgGAAATCGACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAGGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGtgggtggg > 2:203154/1‑148 (MQ=255) tcgGAAATCGACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGa < 6:342335/149‑1 (MQ=255) aTCGACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGc < 4:284019/149‑1 (MQ=255) gACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAGGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGt < 1:203154/148‑1 (MQ=255) gACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGATGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGt < 8:104720/148‑1 (MQ=255) aCGTGCTGACTTTTCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCAGCCACCTGCGTTACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTTGGTGTGGACTATGCGTTc < 2:164647/149‑1 (MQ=255) aCGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGTTc < 1:183488/149‑1 (MQ=255) aCGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGTTc < 1:177773/149‑1 (MQ=255) gCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGTTCAATg < 8:347468/149‑1 (MQ=255) cTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGTTCAATGccaac < 6:253392/149‑1 (MQ=255) cAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGTTCAATGCCAACCaaa < 1:271605/148‑1 (MQ=255) aGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGTTCAATGCCAACCAAag > 2:324930/1‑148 (MQ=255) ggCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGTTCAATGCCAACCAAag > 1:46886/1‑147 (MQ=255) ccGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGTTCAATGCCAACCAAagcagc < 5:372725/149‑1 (MQ=255) gggCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGTTCAATGCCAACCAAAGCAGCg > 8:276561/1‑148 (MQ=255) ttGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGTTCAATGCCAACCAAAGCAGCGTCAGCCt > 3:265070/1‑149 (MQ=255) aaaaGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGTGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGTTCAATGCCAACCAAAGCAGCGTCAGCCttt < 5:245592/148‑1 (MQ=255) aaGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGTTCAATGCCAACCAAAGCAGCGTCAGCCTTTgg > 4:40192/1‑148 (MQ=255) aaGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGTTCAATGCCAACCAAAGCAGCGTCAGCCTTTGGt < 1:324930/149‑1 (MQ=255) ccaccTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGtt > 5:35304/1‑111 (MQ=255) ccaccTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGTTCAATGCCAACCAAAGCAGCGTCAGCCTTTGGTACGGt > 1:7136/1‑148 (MQ=255) ccaccTGAGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGTTGAACGCGATGCTCGTCCATGTGCCGATGCGAGAGGCCGAAAGCTACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGtt < 6:35304/111‑1 (MQ=255) tGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGTTCAATGCCAACCAAAGCAGCGTCAGCCTTTGGTACGGTCAGCTg > 4:132504/1‑149 (MQ=255) cGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGTTCAATGCCAACCAAAGCAGCGTCAGCCTTTGGTACGGTCAGCTgg < 3:40192/148‑1 (MQ=255) tAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGTTCAATGCCAACCAAAGCAGCGTCAGCCTTTGGTACGGTCAGCTggag > 7:73385/1‑148 (MQ=255) cGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGTTCAATGCCAACCAAAGCAGCGTCAGCCTTTGGTACGGTCAGCTGGAGGACa < 2:7136/149‑1 (MQ=255) gCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGTTCAATGCCAACCAAAGCAGCGTCAGCCTTTGGTACGGTCAGCTGGAGGACATCTACCAACAAgg < 6:234399/148‑1 (MQ=255) gCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGTTCAATGCCAACCAAAGCAGCGTCAGCCTTTGGTACGGTCAGCTGGAGGACATCTACCAACAAGGc > 3:147517/1‑149 (MQ=255) aaGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGTTCAATGCCAACCAAAGCAGCGTCAGCCTTTGGTACGGTCAGCTGGAGGACATCTACCAACAAGGCtt > 6:194961/1‑149 (MQ=255) gATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGTTCAATGCCAACCAAAGCAGCGTCAGCCTTTGGTACGGTCAGCTGGAGGACATCTACCAACAAGGCTttg > 6:75735/1‑149 (MQ=255) | TGCCGGTGCTGACCTTCAGTGATATTCGCCTGTTGCCACCCACCTATCAGGGCGTGAGTTTGAGCTCGTCGGAAATCGACGGGCTGACTATGCAGGCCGGGCACTTGAAAAGCACCCACCTGCGTAACGAAGGTGGCGATGGCAAGATGAACGCGATGCTCGGCCATGTGCCGATGCGACAGGCCGAAAGCGACGCGTTCAACTATGTGGGTGGGGACTATGCGTTCAATGCCAACCAAAGCAGCGTCAGCCTTTGGTACGGTCAGCTGGAGGACATCTACCAACAAGGCTTTG > NC_002947/3589895‑3590188 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |