New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3605651 = | 40 (0.660) | 5 (0.090) | 5/260 | NT | 12.3% | coding (871/1041 nt) | PP_3180 | Smp‑30/Cgr1 family protein |
? | NC_002947 | 3605686 = | 32 (0.540) | coding (906/1041 nt) | PP_3180 | Smp‑30/Cgr1 family protein |
GCCGAAACCCCCGCCGAACTGGGGCGGCCGGATGGTCTGGCGCTGGACCGCGAAGGCGGGCTGTGGGTGTGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTACATCAGCACCGCGCGTTACGACATGACGCCAGAAGACCTGCACCATTATCCGGACGCTGGCGACCTGTATGCCATCCGCCCGGAAACGGGCGGCGTCGC > NC_002947/3605507‑3605799 | gCCGAAACCCCCGCCGAACTGGGGCGGCCGGATGGTCTGGCGCTGGACCGCGAAGGCGGGCTGTGGGTGTGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGt < 7:15327/148‑1 (MQ=255) gCCGAAACCCCCGCCGAACTGGGGCGGCCGGATGGTCTGGCGCTGGACCGCGAAGGCGGGCTGTGGGTGTGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTg > 6:165936/1‑149 (MQ=255) ccGAAACCCCCGCCGAACTGGGGCGGCCGGATGGTCTGGCGCTGGACCGCGAAGGCGGGCTGTGGGTGTGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTg < 4:323314/148‑1 (MQ=255) ccGAAACCCCCGCCGAACTGGGGCGGCCGGATGGTCTGGCGCTGGACCGCGAAGGCGGGCTGTGGGTGTGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGc < 4:233003/149‑1 (MQ=255) cgtaaCCCCCGCCGAACTGGGGCGGCCGGATGGTCTGGCGCTGGACCGCGAAGGCGGGCTGTGGGTGTGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGc < 5:147251/145‑1 (MQ=255) ccccGCCGAACTGGGGCGGCCGGATGGTCTGGCGCTGGACCGCGAAGGCGGGCTGTGGGTGTGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCccac > 6:321848/1‑147 (MQ=255) ccccGCCGAACTGGGGCGGCCGGATGGTCTGGCGCTGGACCGCGAAGGCGGGCTGTGGGTGTGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCccac > 6:131823/1‑147 (MQ=255) cccGCCGAACTGGGGCGGCCGGATGGTCTGGCGCTGGACCGCGAAGGCGGGCTGTGGGTGTGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAg < 6:57657/149‑1 (MQ=255) cgAACTGGGGCGGCCGGATGGTCTGGCGCTGGACCGCGAAGGCGGGCTGTGGGTGTGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAgctgct > 7:60054/1‑149 (MQ=255) gAACTGGGGCGGCCGGATGGTCTGGCGCTGGACCGCGAAGGCGGGCTGTGGGTGTGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAgctgctg > 6:326056/1‑149 (MQ=255) ggggCGGCCGGATGGTCTGGCGCTGGACCGCGAAGGCGGGCTGTGGGTGTGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGc > 3:338193/1‑130 (MQ=255) ggggCGGCCGGATGGTCTGGCGCTGGACCGCGAAGGCGGGCTGTGGGTGTGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGc < 4:338193/130‑1 (MQ=255) tgtgcctggcgacgccgcccgtttccgggcggatggcatacaggtcgccagcgtccggataatggtgcaggtcttctggcgtcatgtcgtaacgcgcggtgctgatgtacaaggtgttcatcC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGc < 7:273285‑M1/27‑1 (MQ=255) ggcggcCGGATGGTCTGGCGCTGGACCGCGAAGGCGGGCTGTGGGTGTGCCAGTACTATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGc < 7:33857/149‑1 (MQ=255) ggcggcCGGATGGTCTGGCGCTGGACCGCGAAGGCGGGCTGTGGGTGTGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGc < 2:320595/149‑1 (MQ=255) ggATGGTCTGGCGCTGGACCGCGAAGGCGGGCTGTGGGTGTGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCg < 5:326056/149‑1 (MQ=255) gATGGTCTGGCGCTGGACCGCGAAGGCGGGCTGTGGGTGTGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCACACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCgg > 4:253126/1‑149 (MQ=255) gcccgtttccgggcggatggcatacaggtcgccagcgtccggataatggtgcaggtcttctggcgtcatgtcgtaacgcgcggtgctgatgtacaaggtgttcatcC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATg > 3:53384‑M1/107‑145 (MQ=255) gcccgtttccgggcggatggcatacaggtcgccagcgtccggataatggtgcaggtcttctggcgtcatgtcgtaacgcgcggtgctgatgtacaaggtgttcatcC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATg < 4:53384‑M1/39‑1 (MQ=255) gcgcTGGACCGCGAAGGCGGGCTGTGGGTGTGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGTATGaaga < 5:131823/148‑3 (MQ=255) gcgcTGGACCGCGAAGGCGGGCTGTGGGTGTGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGaa < 5:165936/146‑1 (MQ=255) ccgtttccgggcggatggcatacaggtcgccagcgtccggataatggtgcaggtcttctggcgtcatgtcgtaacgcgcggtgctgatgtacaaggtgttcatcC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACAcc > 8:273285‑M1/105‑149 (MQ=255) cTGGACGGCGTAGGCGGTCTGTGGGTGTGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTTCGACCGCGTCGGGTACCTGTCCGACCTTGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑GGTGCCGCTCCAGGTGGTGCTTTTGCGGGCTCGGGATGATCACGtt < 8:276984/149‑1 (MQ=255) ggACCGCGAAGGCGGGCTGTGGGTGTGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTg > 4:95492/1‑148 (MQ=255) gACCGCGAAGGCGGGCTGTGGGTGTGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGt < 5:203738/148‑1 (MQ=255) gACCGCGAAGGCGGGCTGTGGGTGTGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGAATGAACACCTTGTa > 2:104408/1‑149 (MQ=255) ggatggcatacaggtcgccagcgtccggataatggtgcaggtcttctggcgtcatgtcgtaacgcgcggtgctgatgtacaaggtgttgatgcCAGTACCGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTAc > 4:8490‑M1/94‑149 (MQ=255) gtgGGTGTGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTACATCAGCACCGCGCGt > 3:370085/1‑148 (MQ=255) tgGGTGTGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTACATCAGCACCGCGCGTTa > 6:329637/1‑149 (MQ=255) gggTGTGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTACATCAGCACCGCGCGTTa < 5:321848/148‑1 (MQ=255) gtgtGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTACATCAGCACCGCGCGTTACGa < 3:95492/149‑1 (MQ=255) tgtgCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTACATCAGCACCGCGCGTTACGAc < 3:253126/149‑1 (MQ=255) ccAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTACATCAGCACCGCGCGTTACGACATGa > 7:268477/1‑149 (MQ=255) aGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTACATCAGCACCGCGCGTTACGACATGACg > 5:235476/1‑149 (MQ=255) gCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTACATCAGCACCGCGCGTTACGACATGACGCCAGAAGAc < 5:267162/149‑1 (MQ=255) cAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTACATCAGCACCGCGCGTTACGACATGACGCCAGAAGAcc > 6:268771/1‑149 (MQ=255) tgcctgcTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTACATCAGCACCGCGCGTTACGACATGACGCCAGAAGACCTGCa > 1:164611/1‑149 (MQ=255) ctgcGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTACATCAGCACCGCGCGTTACGACATGACGCCAGAAGACCTGCACCAtt < 2:17877/148‑1 (MQ=255) cgcTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTACATCAGCACCGCGCGTTACGACATGACGCCAGAAGACCTGCACCATTATcc > 2:41095/1‑149 (MQ=255) cGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTACATCAGCACCGCGCGTTACGACATGACGCCAGAAGACCTGCACCATTATCCGGACGCTgg > 2:111302/1‑149 (MQ=255) ccACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTACATCAGCACCGCGCGTTACGACATGACGCCAGAAGACCTGCACCATTATCCGGACGCTGGCg > 1:206858/1‑149 (MQ=255) aCGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTACATCAGCACCGCGCGTTACGACATGACGCCAGAAGACCTGCACCATTATCCGGACGCTGGCGAc > 2:204923/1‑149 (MQ=255) gaccgaccAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTACATCAGCACCGCGCGTTACGACATGACGCCAGAAGACCTGCACCATTATCCGGACGCTGGCGACCTGTATGCCa > 6:276006/1‑149 (MQ=255) gaccgaccAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTACATCAGCACCGCGCGTTACGACATGACGCCAGAAGACCTGCACCATTATCCGGACGCTGGCGACCTGTATGCCa > 1:14805/1‑149 (MQ=255) gtTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTACATCAGCACCGCGCGTTACGACATGACGCCAGAAGACCTGCACCATTATCCGGACGCTGGCGACCTGTATGCCATCCGCCCGGaaa < 8:60054/149‑1 (MQ=255) ttGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTACATCAGCACCGCGCGTTACGACATGACGCCAGAAGACCTGCACCATTATCCGGACGCTGGCGACCTGTAt < 6:210548/132‑1 (MQ=255) ttGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTACATCAGCACCGCGCGTTACGACATGACGCCAGAAGACCTGCACCATTATCCGGACGCTGGCGACCTGTAt > 5:210548/1‑132 (MQ=255) ttGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTACATCAGCACCGCGCGTTACGACATGACGCCAGAAGACCTGCACCATTATCCGGACGCTGGCGACCTGTATGCCATCCGCCCGGAAAc > 2:88519/1‑149 (MQ=255) C‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTACATCAGCACCGCGCGTTACGACATGACGCCAGAAGACCTGCACCATTATCCGGACGCTGGCGACCTGTATGCCATCCGCCCGGAAACGGGCGGCGTc > 6:235476‑M1/1‑147 (MQ=255) C‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTACATCAGCACCGCGCGTTACGACATGACGCCAGAAGACCTGCACCATTATCCGGACGCTGGCGACCTGTATGCCATCCGCCCGGAAACGGGCGGCGTCg > 5:268771‑M1/1‑148 (MQ=255) C‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTACATCAGCACCGCGCGTTACGACATGACGCCAGAAGACCTGCACCATTATCCGGACGCTGGCGACCTGTATGCCATCCGCCCGGAAACGGGCGGCGTCGc < 4:264849‑M1/149‑1 (MQ=255) | GCCGAAACCCCCGCCGAACTGGGGCGGCCGGATGGTCTGGCGCTGGACCGCGAAGGCGGGCTGTGGGTGTGCCAGTACCATGGCAGCTGCCTGCTGCGCTACGACCGCCACGGGTACCTGACCGACCAGGTGTTGATGCCAGTAC‑‑‑‑‑CGTGCCCCACCAGCTGCTGCTTTGGCGGGCCCGGGATGAACACCTTGTACATCAGCACCGCGCGTTACGACATGACGCCAGAAGACCTGCACCATTATCCGGACGCTGGCGACCTGTATGCCATCCGCCCGGAAACGGGCGGCGTCGC > NC_002947/3605507‑3605799 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |