New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4255310 | 61 (1.010) | 3 (0.050) | 3/250 | NT | 5.1% | coding (818/2253 nt) | PP_3728 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
? | NC_002947 | = 4255385 | 55 (0.970) | coding (743/2253 nt) | PP_3728 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
GAGAATCGCCAACAGCCCCTCGCCGGCCTTGTACAAGGCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCT > NC_002947/4255168‑4255458 | gagaATCGCCAACAGCCCCTCGCCGGCCTTGTACAAGGCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCaaa > 7:137066/1‑148 (MQ=255) tCGCCAACAGCCCCTCGCCGGCCTTGTACAAGGCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAgcgc < 3:17207/149‑1 (MQ=255) gCCAACAGCCCCTCGCCGGCCTTGTACAAGGCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCTCCAAAAAGCGCGa > 8:235337/1‑149 (MQ=255) gCCAACAGCCCCTCGCCGGCCTTGTACAAGGCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGa > 6:308530/1‑149 (MQ=255) ccAACAGCCCCTCGCCGGCCTTGTACAAGGCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGAc < 5:93882/149‑1 (MQ=255) ccAACAGCCCCTCGCCGGCCTTGTACAAGGCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGAc > 7:269231/1‑149 (MQ=255) ccAACAGCCCCTCGCCGGCCTTGTACAAGGCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGAc > 7:215769/1‑149 (MQ=255) ccAACAGCCCCTCGCCGGCCTTGTACAAGGCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGAc > 6:349049/1‑149 (MQ=255) ccAACAGCCCCTCGCCGGCCTTGTACAAGGCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGAc > 6:3951/1‑149 (MQ=255) cccTCGCCGGCCTTGTACAAGGCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAg > 6:246270/1‑149 (MQ=255) cccTCGCCGGCCTTGTACAAGGCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAg > 3:14177/1‑149 (MQ=255) cTCGCCGGCCTTGTACAAGGCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGt > 8:189217/1‑149 (MQ=255) cGGCCTTGTACAAGGCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCa < 8:215769/149‑1 (MQ=255) gTACAAGGCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACtt < 2:244460/129‑1 (MQ=255) gTACAAGGCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACtt > 1:244460/1‑129 (MQ=255) gTACAAGGCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAgcctcg < 3:66/148‑1 (MQ=255) gTACAAGGCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAgcctcg < 5:308530/148‑1 (MQ=255) tACAAGGCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAgcctcggc < 7:189217/149‑1 (MQ=255) tACAAGGCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCAAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAgcctcggc > 7:104149/1‑149 (MQ=255) aaGGCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGagcggcgtacggccagcctggctcgggccaaggacgaggc > 5:346305‑M1/1‑109 (MQ=255) aaGGCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAgcctcggcctc > 6:64218/1‑149 (MQ=255) aaGGCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAgcctcggcctc > 5:118337/1‑149 (MQ=255) gCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTc < 3:135123/149‑1 (MQ=255) gCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTc < 8:1824/149‑1 (MQ=255) gCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTc < 2:192142/149‑1 (MQ=255) cTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCt > 7:347687/1‑149 (MQ=255) gACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTg < 5:246270/148‑1 (MQ=255) cacGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGcc > 3:78963/1‑149 (MQ=255) gTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGccc > 3:160462/1‑147 (MQ=255) gTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGa < 5:3951/149‑1 (MQ=255) gTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGa < 4:78963/149‑1 (MQ=255) gTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGa < 8:45156/149‑1 (MQ=255) ggCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTgg > 3:293750/1‑149 (MQ=255) cAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTAcgcc > 2:277229/1‑149 (MQ=255) cAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTAcgc < 5:64218/148‑1 (MQ=255) cAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTAcg < 4:78256/147‑1 (MQ=255) ggCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTAcgccgc < 4:160462/149‑1 (MQ=255) ccgccgCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTcgac > 4:69455‑M2/1‑145 (MQ=255) gccgcGCAGCAGTTGGGCCATGCCCAGAATACCGTTGTTCGGCGTATTCAATTTTTGGCTCATGGTCGCCAAAAATCTCTTTTTGGCCAGGTTGGTAGCCTCGTCCTCGTCCTTGGCCCTAGCCTGTCTGGCCGTACGCCGCTCGACCa < 7:235337/149‑1 (MQ=255) gccgcGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCCTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTcgacca < 3:227990‑M2/149‑7 (MQ=255) ccgcGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGagcggcgtacggccagcctggctcgggccaaggacgaggccgaggctgccaacctggccaagtcgcgctttttggcgaccat < 6:346305‑M1/149‑83 (MQ=255) gcgcAGCAGTTC‑GCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGc > 5:7536/1‑149 (MQ=255) cgcAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGagcggcgtacggccagcctggctcgggccaaggacgaggccgaggctgccaacctggccaagtcgcgctttttggcgaccatgag < 1:780‑M1/149‑86 (MQ=255) cgcAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGc < 5:349049/149‑1 (MQ=255) gcagcaGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGcc > 3:15482/1‑149 (MQ=255) gTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAgcctcggcc > 4:211682/1‑95 (MQ=255) gTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAgcctcggcc < 3:211682/95‑1 (MQ=255) gTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAAt > 7:288064/1‑149 (MQ=255) gTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAAt > 7:293195/1‑149 (MQ=255) ccATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATtcgtcg < 8:269231/149‑1 (MQ=255) cATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTcgc < 6:118337/149‑1 (MQ=255) aTGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTcgcg < 4:15482/149‑1 (MQ=255) ccAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTg > 5:12580/1‑149 (MQ=255) aGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTc > 3:276200/1‑149 (MQ=255) aTACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCCTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTg < 4:227990/149‑1 (MQ=255) gTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGtt < 4:293750/149‑1 (MQ=255) aGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAg < 4:276200/149‑1 (MQ=255) ggcgTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCg < 8:137066/149‑1 (MQ=255) cggaaTTGATGGCTCATGGTCGCCAATAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCAc < 8:104149/145‑1 (MQ=255) cGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTc < 2:59197/128‑1 (MQ=255) cGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTc > 1:59197/1‑128 (MQ=255) gCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGCCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTATTTCCAGGCGGTCACGc > 6:223489/1‑149 (MQ=255) aaTTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTATGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTc > 6:373762/1‑149 (MQ=255) aaTTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGAGGTCACGCt > 5:232811/1‑148 (MQ=255) cTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTcgaccatgagccatgaattgcgtacgccgctcaacggtattctgggcatggccgaactgctgcg < 1:780‑M2/149‑65 (MQ=255) cTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTc > 4:121449/1‑149 (MQ=255) tCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACgg < 1:369737/143‑1 (MQ=255) tCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACgg > 2:369737/1‑143 (MQ=255) aTGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTcgaccatgagccatgaattgcgtacgccgctcaacggtattctgggcatggccgaactgctgcgcgg < 6:346305‑M2/149‑68 (MQ=255) tGGTCGagcggcgtacggccagcctggctcgggccagggacgaggccgaggctgccaacctggccaagtcgcgctttttggcgaccatgagccatgaattgcgtacgccgctcaacggtattctgggcatggccgaactgctgcgcggc < 3:227990‑M1/149‑144 (MQ=255) ggTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCAT‑GCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATc > 8:74464/1‑149 (MQ=255) ggTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGACGTACGCCGCTCGACCATGCCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGatat > 5:227423/1‑149 (MQ=255) gTCGagcggcgtacggccagcctggctcgggccaaggacgaggccgaggctgccaacctggccaagtcgcgctttttggcgaccatgagccatgaattgcgtacgccgctcaacggtattctgggcatggccgaactgctgcgcggcgg > 4:69455‑M1/1‑4 (MQ=255) gCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCt > 1:65209/1‑149 (MQ=255) gCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCAT‑GCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCgat < 7:74464/148‑3 (MQ=255) | GAGAATCGCCAACAGCCCCTCGCCGGCCTTGTACAAGGCCTCGACACGTTGGCGGTCGGCGACCTCCAGGCGCCCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCT > NC_002947/4255168‑4255458 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |