New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4255310 | 61 (1.010) | 3 (0.050) | 3/250 | NT | 5.1% | coding (818/2253 nt) | PP_3728 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
? | NC_002947 | = 4255385 | 55 (0.970) | coding (743/2253 nt) | PP_3728 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
CCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGGCGCGACGCATATCGTCCAGGGCATTGGCCACCGTGTCGATTTCGTCGGGGCGCGATGATCGGCGGCG > NC_002947/4255241‑4255533 | ccgccgCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTcgac > 4:69455‑M2/1‑145 (MQ=255) gccgcGCAGCAGTTGGGCCATGCCCAGAATACCGTTGTTCGGCGTATTCAATTTTTGGCTCATGGTCGCCAAAAATCTCTTTTTGGCCAGGTTGGTAGCCTCGTCCTCGTCCTTGGCCCTAGCCTGTCTGGCCGTACGCCGCTCGACCa < 7:235337/149‑1 (MQ=255) gccgcGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCCTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTcgacca < 3:227990‑M2/149‑7 (MQ=255) gcgcAGCAGTTC‑GCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGc > 5:7536/1‑149 (MQ=255) cgcAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGc < 5:349049/149‑1 (MQ=255) gcagcaGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGcc > 3:15482/1‑149 (MQ=255) gTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAAt > 7:293195/1‑149 (MQ=255) gTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAAt > 7:288064/1‑149 (MQ=255) ccATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATtcgtcg < 8:269231/149‑1 (MQ=255) cATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTcgc < 6:118337/149‑1 (MQ=255) aTGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTcgcg < 4:15482/149‑1 (MQ=255) ccAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTg > 5:12580/1‑149 (MQ=255) aGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTc > 3:276200/1‑149 (MQ=255) aTACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCCTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTg < 4:227990/149‑1 (MQ=255) gTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGtt < 4:293750/149‑1 (MQ=255) aGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAg < 4:276200/149‑1 (MQ=255) ggcgTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCg < 8:137066/149‑1 (MQ=255) cggaaTTGATGGCTCATGGTCGCCAATAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCAc < 8:104149/145‑1 (MQ=255) cGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTc < 2:59197/128‑1 (MQ=255) cGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTc > 1:59197/1‑128 (MQ=255) gCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGCCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTATTTCCAGGCGGTCACGc > 6:223489/1‑149 (MQ=255) aaTTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTATGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTc > 6:373762/1‑149 (MQ=255) aaTTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGAGGTCACGCt > 5:232811/1‑148 (MQ=255) cTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTcgaccatgagccatgaattgcgtacgccgctcaacggtattctgggcatggccgaactgctgcg < 1:780‑M2/149‑65 (MQ=255) cTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTc > 4:121449/1‑149 (MQ=255) tCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACgg > 2:369737/1‑143 (MQ=255) tCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACgg < 1:369737/143‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTcgaccatgagccatgaattgcgtacgccgctcaacggtattctgggcatggccgaactgctgcgcgg < 6:346305‑M2/149‑68 (MQ=255) ggTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCAT‑GCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATc > 8:74464/1‑149 (MQ=255) ggTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGACGTACGCCGCTCGACCATGCCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGatat > 5:227423/1‑149 (MQ=255) gCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCt > 1:65209/1‑149 (MQ=255) gCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCAT‑GCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCgat < 7:74464/148‑3 (MQ=255) cAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCt > 3:246634/1‑147 (MQ=255) aGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATg < 3:121449/149‑1 (MQ=255) aGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATg > 6:365616/1‑149 (MQ=255) cgcgACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGgc > 6:350804/1‑149 (MQ=255) gcgACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGgcg > 8:59941/1‑149 (MQ=255) gACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGgcgc > 8:11050/1‑148 (MQ=255) ggCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGGCGCGACGc < 1:277229/148‑1 (MQ=255) ccAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGGCGCGACGCata < 6:7536/149‑1 (MQ=255) aGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTGCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGGCGCGACGCATATc < 1:273270/149‑1 (MQ=255) gTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGGCGCGACGCATATCGt > 6:52545/1‑149 (MQ=255) gCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGGCGCGACGCATATCGTCCa < 5:350804/148‑1 (MQ=255) cAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGGCGCGACGCATATCGTCCAgg < 8:293195/149‑1 (MQ=255) cAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTCGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGGCGCGACGCATATCGTCCAgg < 8:288064/149‑1 (MQ=255) cctcggcctcgTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGGCGCGACGCATATCGTCCAGGGCa > 2:291078/1‑149 (MQ=255) gcctcgTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTcgaccatgagccatgaattgcgtacgccgctcaacggtattctgggcatggccgaactgctgcgcggcgggcgcctggaggtcgccgaccgccaacgtgtcgaggcctt > 5:346305‑M2/1‑40 (MQ=255) gcctcgTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGGCGCGACGCATATCGTCCAGGGCATTGGc > 1:340280/1‑149 (MQ=255) ttGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGGCGCGACGCATATCGTCCAGGGCATTGGCCACCGTGTc > 1:271821/1‑149 (MQ=255) ttGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGGCGCGACGCATATCGTCCAGGGCATTGGCCACCGTGTc > 3:132401/1‑149 (MQ=255) ggCCCGAGCCAGGCTGGCAGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCTGGCGGTCACGCTCACGGCGCTGGATATCTCTGAGGATGGCGCGACGCATATCGTCCAGGGCATTGGCCACCGTGTc < 8:347687/147‑1 (MQ=255) gCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGGCGCGACGCATATCGTCCAGGGCATTGG‑CACCGTGTCGAtt > 2:340802/1‑149 (MQ=255) cccGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGGCGCGACGCATATCGTCCAGGGCATTGGCCACCGTGTCGAtt < 6:12580/149‑1 (MQ=255) cccGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGGCGCGACGCATATCGTCCAGGGCATTGGCCACCGTGTCGAtt > 7:208266/1‑149 (MQ=255) aGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGGCGCGACGCATATCGTCCAGGGCATTGGCCACCGTGTCGATTtcgt > 3:100603/1‑149 (MQ=255) ccAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGGCGCGACGCATATCGTCCAGGGCATTGGCCACCGTGTCGATTtcgtcg < 6:330155/149‑1 (MQ=255) ccAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGGCGCGACGCATATCGTCCAGGGCATTGGCCACCGTGTCGATTtcgtcg > 5:330155/1‑149 (MQ=255) gCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGGCGCGACGCATATCGTCCAGGGCATTGGCCACCGTGTCGATTTCGTCGGGGCGCga < 2:326165/149‑1 (MQ=255) gCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGGCGCGACGCATATCGTCCAGGGCATTGGCCACCGTGTCGATTTCGTCGGGGCGCga < 2:129397/149‑1 (MQ=255) cGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGTATGGCGCGACGCATATCGTCCAGGGCATTGGCCACCGTGTCGATTTCGTCGGGGCGCgatg < 4:14177/149‑1 (MQ=255) gTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGGCGCGACGCATATCGTCCAGGGCATTGGCCACCGTGTCGATTTCGTCGGGGCGCgatga < 7:11050/149‑1 (MQ=255) gTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGGCGCGACGCATATCGTCCAGGGCATTGGCCACCGTGTCGATTTCGTCGGGGCGCgatga > 6:119164/1‑149 (MQ=255) gccgcTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGGCGCGACGCATATCGTCCAGGGCATTGG‑CACCGTGTCGATTTCGTCGGGGCGCGATGATcggc < 1:340802/149‑1 (MQ=255) gccgcTCAACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGGCGCGACGCATATCGTCCAGGGCATTGGCCACCGTGTCGATTTCGTCGGGGCGCGATGATcgg > 2:187678/1‑149 (MQ=255) tCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGGCGCGACGCATATCGTCCAGGGCATTGGCCACCGTGTCGATTTCGTCGGGGCGCGATGATcggcggcg > 2:280330/1‑149 (MQ=255) | CCGCCGCGCAGCAGTTCGGCCATGCCCAGAATACCGTTGAGCGGCGTACGCAATTCATGGCTCATGGTCGCCAAAAAGCGCGACTTGGCCAGGTTGGCAGCCTCGGCCTCGTCCTTGGCCCGAGCCAGGCTGGCCGTACGCCGCTCGACCATGGCCTGCAATTCGTCGCGTTTGTCCTGTAGTTCCAGGCGGTCACGCTCACGGCGCTCGATATCGCTGAGGATGGCGCGACGCATATCGTCCAGGGCATTGGCCACCGTGTCGATTTCGTCGGGGCGCGATGATCGGCGGCG > NC_002947/4255241‑4255533 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |