| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4271213 = | 63 (1.050) | 4 (0.070) | 4/250 | NT | 6.9% | coding (1353/1896 nt) | mrdA‑I | transpeptidase |
| ? | NC_002947 | 4271308 = | 48 (0.850) | coding (1448/1896 nt) | mrdA‑I | transpeptidase | |||||
TGCACGACTACATGGCCGAGTTCGGCCTGGGCCAGAAGGTGTCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGGCAAGCAAGGGCGTGTGGCACCGCCCGCACCTGGCCATGACCGTGGGCGGCGATACGCCGATCGACCCAAACCCCATGCCCGACATC > NC_002947/4271065‑4271357 | tGCACGACTACATGGCCGAGTTCGGCCTGGGCCAGAAGGTGTCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCAtt > 6:161147/1‑149 (MQ=255)tGCACGACTACATGGCCGAGTTCGGCCTGGGCCAGAAGGTGTCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCAtt > 2:242975/1‑149 (MQ=255) caccggcggccgcggcgcgggcaatgccgcgcgggtcgtgcatgaccatctgcatgccctggctgacctggtcccaggcatgcttgtcgtgcagcacgatgtcgggcatggggtttgggtcgatcggcgtatcgccgcccacggtcaTg > 6:49033‑M1/148‑149 (MQ=255) caccggcggccgcggcgcgggcaatgccgcgcgggtcgtgcatgaccatctgcatgccctggctgacctggtcccaggcatgcttgtcgtgcagcacgatgtcgggcatggggtttgggacgatcggcgtatcgccgcccacggtcaTg > 4:284371‑M1/148‑149 (MQ=255) gACTACTTGGCCGAGTTCGGCCTGGGCCAGAAGGTGTCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCa < 5:279100/149‑1 (MQ=255) gACTACATGGCCGAGTTCGGCCTGGGCCAGAAGGTGTCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCa < 1:44769/149‑1 (MQ=255) aCTACATGGCCGAGTTCGGCCTGGGCCAGAAGGTGTCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAg < 7:240175/149‑1 (MQ=255) gcggccgcggcgcgggcaatgccgcgcgggtcgtgcatgaccatctgcatgccctggctgacctggtcccaggcatgcttgtcgtgcagcacgatgtcgggcatggggtttgggtcgatcggcgtatcgccgcccacggtcaTGGCCAg < 2:68950‑M1/7‑1 (MQ=255) aCATGGCCGAGTTCGGCCTGGGCCAGAAGGTGTCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGt > 6:132979/1‑149 (MQ=255) cATGGCCGAGTTCGGCCTGGGCCAGAAGGTGTCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGt > 8:60222/1‑148 (MQ=255) cATGGCCGAGTTCGGCCTGGGCCAGAAGGTGTCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGt < 3:12405/148‑1 (MQ=255) tGGCCGAGTTCGGCCTGGGCCAGAAGGTGTCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTa > 4:298423/1‑148 (MQ=255) tGGCCGAGTTCGGCCTGGGCCAGAAGGTGTCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTAc < 3:298423/149‑1 (MQ=255) gCCGAGTTCGGCCTGGGCCAGAAGGTGTCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACa < 8:323125/148‑1 (MQ=255) ccGAGTTCGGCCTGGGCCAGAAGGTGTCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATg > 5:32949/1‑149 (MQ=255) cGAGTTCGGCCTGGGCCAGAAGGTGTCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGc < 5:28743/149‑1 (MQ=255) cGAGTTCGGCCTGGGCCAGAAGGTGTCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGc < 8:233538/149‑1 (MQ=255) cGAGTTCGGCCTGGGCCAGAAGGTGTCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGc < 5:34200/149‑1 (MQ=255) ggcctgggcctgAAGGTGTCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCGGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGGCTGGGTCCCCGGCGAGTCGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCAc < 7:293723/149‑1 (MQ=255) gCCTGGGCCAGAAGGTGTCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGGACTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCAc > 1:81583/1‑149 (MQ=255) gCCTGGGCCAGAAGGTGTCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCAcc < 1:369684/149‑1 (MQ=255) gCCTGGGCCAGAAGGTGTCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCAcc > 5:303033/1‑149 (MQ=255) gCCTGGGCCAGAAGGTGTCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGCG‑CTGATGCCCTCCGCCGAGAGGAAGCGCGCCACACGAAGCCAGGCCTGGTTCCCAGGCTAGACGCTGATCCTATGCATAGGCCAAGGTTACATGCAGGTCAcc > 5:245315/1‑149 (MQ=255) gCCAGAAGGTGTCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTg < 6:32949/149‑1 (MQ=255) aaGGTGTCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGtt < 2:291190/149‑1 (MQ=255) gtgtCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGc > 2:313932/1‑149 (MQ=255) tCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGcc > 8:87857/1‑147 (MQ=255) tCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGcc > 8:340533/1‑147 (MQ=255) tGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGcc > 4:5998/1‑149 (MQ=255) tGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGc > 7:305372/1‑148 (MQ=255) ttcATGTTCGAGGAAGGCTCCGTG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCTCGCCAAACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTTGCTTTGGCCAGGTTTACATGCTGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGTcca < 6:245315/146‑1 (MQ=255) gACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGATTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGcca < 6:303033/148‑1 (MQ=255) cATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGccacca < 8:305372/149‑1 (MQ=255) tGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGc < 3:189562/149‑1 (MQ=255) gTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGcc > 6:333937/1‑149 (MQ=255) ttCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCct > 5:317240/1‑149 (MQ=255) cGATGAATCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCTTCATATTTGAAGCGCGCCACACTACGCAAGTCCTGTTTCCCCGTCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTAAATTCAGTGCACCACCCTTAAGTTGGCACAGTCCACCAGActg < 4:270367/148‑1 (MQ=255) aGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCA‑CCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTgg > 3:99305/1‑149 (MQ=255) ccctggctgacctggtcccaggcatgcttgtcgtgcagcacgatgtcgggcatggggtttgggtcgatcggcgtatcgccgcccacggtcaTg < 6:307230‑M1/2‑1 (MQ=255) ccctggctgacctggtcccaggcatgcttgtcgtgcagcacgatgtcgggcatggggtttgggtcgatcggcgtatcgccgcccacggtcaTg > 5:307230‑M1/92‑93 (MQ=255) gAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTgg > 8:250019/1‑148 (MQ=255) aGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGgcaa < 5:132979/149‑1 (MQ=255) cTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGgcacgc > 6:337884/1‑148 (MQ=255) tCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCCCCCCCCGGCAGTTGCCCCAGGCCACCCGCATCGTGgcaacc > 3:21510/1‑145 (MQ=255) tCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGgcaagc > 4:175428/1‑147 (MQ=255) tCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGgcaaga > 1:225578/1‑146 (MQ=255) cGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCA‑CCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGGCAAGCAAgg < 4:99305/148‑1 (MQ=255) acctggtcccaggcatgcttgtcgtgcagcacgatgtcgggcatggggtttgggtcgatcggcgtatcgccgcccacggtcaTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGGcaagcaag < 8:99618‑M1/67‑1 (MQ=255) gATGCACTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGACAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGGCAAGCAAGGGCgtgt > 6:75063/1‑149 (MQ=255) cTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTACCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGGCAAGCAAGGGCGTGTGGCAcc > 5:264068/1‑149 (MQ=255) tCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGGCAAGCAAGGGCGTGTGGCAccg > 2:234193/1‑149 (MQ=255) aGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCctgctg < 8:60574/119‑1 (MQ=255) aGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCctgctg > 7:60574/1‑119 (MQ=255) gTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCa < 4:15723/102‑1 (MQ=255) gTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCa > 3:15723/1‑102 (MQ=255) gtgcagcacgatgtcgggcatggggtttgggtcgatcggcgtatcgccgcccacggtcaTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGGCAAGCAAGGGCGtgtg > 7:112286‑M1/60‑134 (MQ=255) gtgcagcacgatgtcgggcatggggtttgggtcgatcggcgtatcgccgcccacggtcaTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGGCAAGCAAGGGCGtgtg < 8:112286‑M1/75‑1 (MQ=255) gAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGGCAAGCAAGGGCGTGTGGCACCGCCCGCACCTgg < 3:5998/149‑1 (MQ=255) aaGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGGCAAGCAAGGGCGTGTGGCACCGCCCGCACCTGGc > 1:142510/1‑149 (MQ=255) cacgatgtcgggcatggggtttgggtcgatcggcgtatcgccgcccacggtcaTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGGCAAGCAAGGGCGTGTGGCACCGCCCGCACCTGGCCAt > 7:99618‑M1/54‑149 (MQ=255) cacGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGGCAAGCAAGGGCGTGTGGCACCGCCCGCACCTGGCCATGACCGTg < 7:250019/149‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGGCAAGCAAGGGCGTGTGGCACCGCCCGCACCTGGCCATGACCGTGggcggc < 7:87857/149‑1 (MQ=255) ccAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGGCAAGCAAGGGCGTGTGGCACCGCCCGCACCTGGCCATGAcc < 8:9432/139‑1 (MQ=255) ccAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGGCAAGCAAGGGCGTGTGGCACCGCCCGCACCTGGCCATGAcc > 7:9432/1‑139 (MQ=255) cAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGGCAAGCAAGGGCGTGTGGCACCGCCCGCACCTGGCCATGACCGTGGGCGGCGa < 6:317240/149‑1 (MQ=255) ggCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGGCAAGCAAGGGCGTGTGGCACCGCCCGCACCTGGCCATGACCGTGGGCGGCGATa < 7:60222/149‑1 (MQ=255) cTGGGTCCCCGGCGATTCGGCGCTCCTTTGCATTGGCCATGGTTTACTGCCTGTCCACCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGGCAAGCAAGGGCGTGTGGCACCGCCCGCACCTGGCCATGACCGTGGGCGGCGATACGc < 4:21510/149‑1 (MQ=255) tGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCCCCAGCGTCATGCCAAGCACGGCCGTGTGCCCCCCCCCGCCCGTGGCCATGACCGTGGGCGGCGAAACGcg > 8:97528/1‑148 (MQ=255) gTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGGCAAGCAAGGGCGTGTGGCACCGCCCGCACCTGGCCATGACCGTGGGCGGCGATACGcc < 2:81583/147‑1 (MQ=255) cccGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGGCAAGCAAGGGCGTGTGGCACCGCCCGCACCTGGCCATGACCGTGGGCGGCGATACGCCGATCGa < 1:234193/149‑1 (MQ=255) cTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGGCAAGCAAGGGCGTGTGGCACCGCCCGCACCTGGCCATGACCGTGGGCGGCGATACGCCGATCGACCCAAACCCCAt > 4:203073/1‑149 (MQ=255) tCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGGCAAGCAAGGGCGTGTGGCACCGCCCGCACCTGGCCATGACCGTGGGCGGCGATACGCCGATCGACCCAAACCCCATGccc < 1:79815/149‑1 (MQ=255) ccTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGGCAAGCAAGGGCGTGTGGCACCGCCCGCACCTGGCCATGACCGTGGGCGGCGATACGCCGATCGACCCAAACCCCTTGccc < 7:340533/148‑1 (MQ=255) ccTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCCGCTGGCAAGCAAGGGCGTGTGGCACCGCCCGCACCTGGCCATGACCGTGGGCGGCGATACGCCGATCGACCCAAACCCCATGCCCg > 3:100384/1‑149 (MQ=255) gCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGGCAAGCAAGGGCGTGTGGCACCGCCCGCACCTGGCCATGACCGTGGGCGGCGATACGCCGATCGACCCAAACCCCATGCCCGACATc < 3:175428/149‑1 (MQ=255) | TGCACGACTACATGGCCGAGTTCGGCCTGGGCCAGAAGGTGTCGCTGGACATGTTCGAGGAAGCCTCCGGG‑CTGATGCCCTCGGCCGAGTGGAAGCGCGCCACACGACGCCAGGCCTGGTTCCCCGGCGAGACGCTGATCCTTGGCATTGGCCAGGGTTACATGCAGGTCACCCCCCTGCAGTTGGCCCAGGCCACCAGCCTGCTGGCAAGCAAGGGCGTGTGGCACCGCCCGCACCTGGCCATGACCGTGGGCGGCGATACGCCGATCGACCCAAACCCCATGCCCGACATC > NC_002947/4271065‑4271357 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |