New junction evidence | |||||||||||
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gacgaTATCC‑‑GC‑CGGGGCCACCCAGTCGCGGGCCAGCTTGAGGCCGCCATGGCCCAGGCGGGTCATGTCCAGCAGGTTCTGGATGTAGCGATCGAGGCGTTCGGCTTCGTTACGGGTGCCCTCCAGCAGCTCGCGGCGGTCTTCAGCCg < 2:52840/149‑1 (MQ=255) gaTATCC‑‑GC‑CGGGGCCACCCAGTCGCGGGCCAGCTTGAGGCCGCCATGGCCCAggcggatatcgtcggcagtgcgctcaaccgcctgcgggtggtgctggcgccgctgcgtgtgcacacggacgtgccgaccgagctgccattgctgt > 1:141014‑M2/1‑53 (MQ=255) gaTATCC‑‑GC‑CGGGGCCACCCAGTCGCGGGCCAGCTTGAGGCCGCCATGGCCCAggcggatatcgtcggcagtgcgctcaaccgcctgcgggtggtgctggcgccgctgcgtgtgcacacggacgtgccgaccgagctgccattgctgt < 2:141014‑M2/148‑96 (MQ=255) gaTATCC‑‑GC‑CGGGGCCACCCAGTCGCGGGCCAGCTTGAGGCCGCCATGGCCCAGGCGGGTCATGTCCAGCAGGTTCTGGATGTAGCGATCGAGGCGTTCGGCTTCGTTACGGGTGCCCTCCAGCAGCTCGCGGCGGTCTTCAGCCGGGa > 8:140891/1‑149 (MQ=255) atCC‑‑GC‑CGGGGCCACCCAGTCGCGGGCCAGCTTGAGGCCGCCATGGCCCAGGCGGGTCATGTCCAGCAGGTTCTGGATGTAGCGATCGAGGCGTTCGGCTTGGTTACGGGTGCCCTCCAGCAGCTCGCGGCGGTCTTCAGCCGGGatcg > 6:14502/1‑149 (MQ=255) tCC‑‑GC‑CGGGGCCACCCAGTCGCGGGCCAGCTTGAGGCCGCCATGGCCCAGGCGGGTCATGTCCAGCAGGTTCTGGATGTAGCGATCGAGGCGTTCGGCTTCGTTACGGGTGCCCTCCAGCAGCTCGCGGCGGTCTTCAGCCGGGatcg < 2:307908/148‑1 (MQ=255) cc‑‑gc‑cgGGGCCACCCAGTCGCGGGCCAGCTTGAGGCCGCCATGGCCCAggcggatatcgtcggcagtgcgctcaaccgcctgcgggtggtgctggcgccgctgcgtgtgcacacggacgtgccgaccgagctgccattgctgttcgtg < 1:328184‑M2/148‑101 (MQ=255) cc‑‑GC‑Ctgggccatggcggcctcaagctggcccgcgactgggtggccccggcggatatcgtcggcagtgcgctcaaccgcctgcgggtggtgctggcgccgctgcgtgtgcacacg < 6:125720‑M1/115‑111 (MQ=255) cc‑‑GC‑Ctgggccatggcggcctcaagctggcccgcgactgggtggccccggcggatatcgtcggcagtgcgctcaaccgcctgcgggtggtgctggcgccgctgcgtgtgcacacg > 5:125720‑M1/1‑5 (MQ=255) cc‑‑GC‑Ctgggccatggcggcctcaagctggcccgcgactgggtggccccggcggatatcgtcggcagtgcgctcaacccccggcgggtggtgctggcgccgctgcgtgtgcacacggacgtgccgaccgagctgccattgctgttcgtg > 1:119183‑M1/1‑5 (MQ=255) gC‑Ctgggccatggcggcctcaagctggcccgcgactgggtggccccggcggatatcgtcggcagtgcgctcaaccgcctgcgggtggtgctggcgccgctgcgtgtgcacacggacgtgccgaccgagctgccattgctgttcgtgcat < 2:112005‑M1/149‑147 (MQ=255) cgGGGCCACCCAGTCGCGGGCCAGCTTGAGGCCGCCATGGCCCAggcggatatcgtcggcagtgcgctcaaccgcctgcgggtggtgctggcgccgctgcgtgtgcacacggacgtgccgaccgagctgccattgctg > 6:113353‑M2/1‑44 (MQ=255) cgGGGCCACCCAGTCGCGGGCCAGCTTGAGGCCGCCATGGCCCAggcggatatcgtcggcagtgcgctcaaccgcctgcgggtggtgctggcgccgctgcgtgtgcacacggacgtgccgaccgagctgccattgctg < 5:113353‑M2/138‑95 (MQ=255) | GGCGTTTTCCAGCACGTTGACCAGTGCCTGCTCGATCAACGCCGCATGCACGAACAGCAATGGCAGCTCGGTCGGCACGTCCGTGTGCACACGCAGCGGCGCCAGCACCACCCGCAGGCGGTTGAGCGCACTGCCGACGATATCC‑‑GC‑CGGGGCCACCCAGTCGCGGGCCAGCTTGAGGCCGCCATGGCCCAGGCGGGTCATGTCCAGCAGGTTCTGGATGTAGCGATCGAGGCGTTCGGCTTCGTTACGGGTGCCCTCCAGCAGCTCGCGGCGGTCTTCAGCCGGGATCGCATC > NC_002947/4698351‑4698644 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |