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aCTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGtt > 1:2059/1‑149 (MQ=255) ttCAAGGAacagccagggcaggccggcgtccttgaagtgcatgacaaagccgtccagcaggctgcgtgggttcatcgtctgtgcgcggaaattgcgtgactccggcagcaccttccagaataccagcgcggccaccagggccaggccgc > 8:217403‑M1/1‑8 (MQ=255) ttCAAGGAacagccagggcaggccggcgtccttgaagtgcatgacaaagccgtccagcaggctgcgtgggttcatcgtctgtgcgcggaaattgcgtgactccggcagcaccttccagaataccagcgcggccaccagggccaggccgc > 5:15808‑M1/1‑8 (MQ=255) ttCAAGGAacagccagggcaggccggcgtccttgaagtgcatgacaaagccgtccagcaggctgcgtgggttcatcgtctgtgcgcggaaattgcgtgactccggcagcaccttccagaataccagcgcggccaccagggccaggccgc > 3:114094‑M1/1‑8 (MQ=255) ttCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTa > 3:134211/1‑149 (MQ=255) tCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTAc > 3:166621/1‑149 (MQ=255) cAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCggtg < 6:181635/142‑1 (MQ=255) cAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCggtg > 5:181635/1‑142 (MQ=255) aaGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTACCt > 3:74060/1‑149 (MQ=255) aaGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTACCt < 1:327997/149‑1 (MQ=255) aGGAacagccagggcaggccggcgtccttgaagtgcatgacaaagccgtccagcaggctgcgtgggttcatcgtctgtgcgcggaaattgcgtgactccggcagcaccttccagaataccagcgcggccaccagggccaggccgccaat > 1:20832‑M1/1‑4 (MQ=255) aGGAacagccagggcaggccggcgtccttgaagtgcatgacaaagccgtccagcaggctgcgtgggttcatcgtctgtgcgcgcaaattgcgtgactccggcagcaccttccagaataccagcgcggccaccagggccaggccgccaat < 1:98513‑M1/149‑146 (MQ=255) gAacagccagggcaggccggcgtccttgaagtgcatgacaaagccgtccagcaggctgcgtgggttcatcgtctgtgcgcggaaattgcgtgactccggcagcaccttccagaataccagcgcggccaccagggccaggccgccaatgg > 8:17682‑M1/1‑2 (MQ=255) | GCTGGCACACGGCGATGCTGACCATTGGCGGCCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTACCTGTC > NC_002947/5789424‑5789718 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |