New junction evidence | |||||||||||
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GACCATTGGCGGCCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTACCTGTCGGGTATCTACAGTTCTGCA > NC_002947/5789443‑5789737 | gACCATTGGCGGCCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGt > 1:242385/1‑149 (MQ=255) ccATTGGCGGCCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTtc > 8:17682‑M2/1‑147 (MQ=255) aTTGGCGGCCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTGCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTtcct < 1:98513‑M2/149‑5 (MQ=255) aTTGGCGGCCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTtcct > 1:20832‑M2/1‑145 (MQ=255) gcggcCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTtccttgaa > 5:15808‑M2/1‑141 (MQ=255) gcggcCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTtccttgaa > 8:217403‑M2/1‑141 (MQ=255) gcggcCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTtccttgaa > 3:114094‑M2/1‑141 (MQ=255) ccTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCt < 1:75373/149‑1 (MQ=255) 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ttCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTa > 3:134211/1‑149 (MQ=255) tCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTAc > 3:166621/1‑149 (MQ=255) cAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCggtg > 5:181635/1‑142 (MQ=255) cAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCggtg < 6:181635/142‑1 (MQ=255) aaGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTACCt > 3:74060/1‑149 (MQ=255) aaGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTACCt < 1:327997/149‑1 (MQ=255) cGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTACCTGTCGGGTa < 7:25466/149‑1 (MQ=255) cGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTACCTGTCGGGTa < 2:98513/149‑1 (MQ=255) ccTGCCCTGGCTGTtccttgaagtgcatgacaaagccgtccagcaggctgcgtgggttcatcgtctgtgcgcggaaattgcgtgactccggcagcaccttccagaataccagcgcggccaccagggccaggccgccaatggtcagcatc > 5:322460‑M2/1‑14 (MQ=255) ccTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTAc > 1:109363/1‑136 (MQ=255) ccTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTAc < 2:109363/136‑1 (MQ=255) cTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTACCTGTCGGGTATCTa > 6:154310/1‑149 (MQ=255) gCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTACCTGTCgg < 3:48959/140‑1 (MQ=255) gCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTCCTGCCCGAGCCCAACAACATGAACCACTCGCTGGTAGGCTTGCTGTCCTTCGTATACCTCTCgg > 4:48959/1‑140 (MQ=255) cccTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCATCTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTACCTGTCGGGTATCTAc < 3:55745/147‑1 (MQ=255) ggCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACAACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTACCTGTCGGGTATCTAAAGTTCt > 1:168396/1‑149 (MQ=255) gcagTTCCTTGAAGCCTTGCTGCTGATTGGCGCATTCGTCAAATTGTTCAACTACATCGGATACAGCATGCTGGCCGAGCCCTACAACATGTACCAGGAGCTGGTCTTCTTGCTTTCGGTGTTTTACCTGTCGGGTATCTACAGTTCt < 7:155493/145‑1 (MQ=255) gCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTACCTGTCGGGTATCTACAGTTCTg < 3:77345/149‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTACCTGTCGGGTATCTACAGTTCTGca < 3:52148/147‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTACCTGTCGGGTATCTACAGTTCTGca < 5:328904/147‑1 (MQ=255) | GACCATTGGCGGCCTGGCCCTGGTGGCCGCGCTGGTATTCTGGAAGGTGCTGCCGGAGTCACGCAATTTCCGCGCACAGACGATGAACCCACGCAGCCTGCTGGACGGCTTTGTCATGCACTTCAAGGACGCCGGCCTGCCCTGGCTGTTCCTTGAAGCCTTCCTGCTGATGGGCGCCTTCGTCACATTGTTCAACTACATCGGCTACCGCCTGCTGGCCGAGCCCTACCACATGAACCAGGCGCTGGTCGGCTTGCTGTCGGTGGTTTACCTGTCGGGTATCTACAGTTCTGCA > NC_002947/5789443‑5789737 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |