New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5874726 = | 68 (1.130) | 4 (0.070) | 4/256 | NT | 5.3% | coding (1445/1515 nt) | ilvA‑II | threonine deaminase |
? | NC_002947 | 5874768 = | 77 (1.330) | coding (1403/1515 nt) | ilvA‑II | threonine deaminase |
TCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGC > NC_002947/5874578‑5874872 | tctcAGGCCTTGAGGCCTGCGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAgcg > 2:79287/1‑149 (MQ=255) gtgccagcgacgaaatggtgctgcgcttcgaattccccgagcggccaggggcactgttcaacttcctcaacaagctgggcgggcgctggaacatctcgatgttccactaccgcaaccatggcgcggctgacgggcgcgtggtggcgggg > 1:297581‑M1/149‑149 (MQ=255) tcAGGCCTTGAGGCCTGCGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGATAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCt > 1:279294/1‑149 (MQ=255) cAGGCCTTGAGGCCTGCGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGAGCTTGGCCAGCGCTg > 3:206123/1‑149 (MQ=255) ccTTGAGGCCTGCGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCgg < 8:95639/149‑1 (MQ=255) ggCCTGCGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAg < 1:110103/149‑1 (MQ=255) gCCTGCGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAgg > 6:57223/1‑149 (MQ=255) ccTGCGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGt < 7:255122/149‑1 (MQ=255) ccTGCGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGt < 7:187405/149‑1 (MQ=255) cTGCTCAGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGt < 1:76917/148‑1 (MQ=255) cTGCGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGt > 2:76917/1‑148 (MQ=255) tGCGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGa > 1:221542/1‑149 (MQ=255) cgcAGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACg > 5:261460/1‑149 (MQ=255) gTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCg < 2:252771/149‑1 (MQ=255) ttcgaattccccgagcggccaggggcactgttcaacttcctcaacaagctgggcgggcgctggaacatctcgatgttccactaccgcaaccatggcgcggctgacgggcgcgtggtggcgggGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGtcc < 1:353949‑M1/27‑1 (MQ=255) tgtgGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGtcctc > 7:150572/1‑149 (MQ=255) tgGGAGGGGGCAAGCGCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCg < 1:79287/149‑1 (MQ=255) ggAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCgg > 6:258404/1‑148 (MQ=255) ggCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGc < 6:367144/149‑1 (MQ=255) cccGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGcccc > 2:72476/1‑149 (MQ=255) cccGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGcccc > 2:43074/1‑149 (MQ=255) ccaggggcactgttcaacttcctcaacaagctgggcgggcgctggaacatctcgatgttccactaccgcaaccatggcgcggctgacgggcgcgtggtggcgggGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGcccc > 2:353949‑M1/105‑149 (MQ=255) ccaggggcactgttcaacttcctcaacaagctgggcgggcgctggaacatctcgatgttccactaccgcaaccatggcgcggctgacgggcgcgtggtggcgggGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGc > 2:215059‑M1/105‑146 (MQ=255) ccaggggcactgttcaacttcctcaacaagctgggcgggcgctggaacatctcgatgttccactaccgcaaccatggcgcggctgacgggcgcgtggtggcgggGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGc < 1:215059‑M1/42‑1 (MQ=255) ccGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCg > 7:343688/1‑149 (MQ=255) gCCATCAGCCCTAGCATAGCCGCTCAGCCCACGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTATCGTCCCAGTACGCGTAACCGATCTTCGCCAGCGCTGCCGGCACCAGTTTACGATCGTCCTACGG‑CACCTTCAGCCCCGCcaccacccc > 2:324624/1‑146 (MQ=255) ctccccccTAGCATAGCCGCGCAGCCCACGACCCGTTTGTAGGCCGCGCCTTCGCTCTCGGCCCAGTCCGGGTACCCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACCCGccc < 4:206123/144‑1 (MQ=255) tCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCg > 6:188570/1‑149 (MQ=255) aGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGTGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCgg < 7:244274/148‑2 (MQ=255) aGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGccc > 6:177335/1‑146 (MQ=255) aGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGccc < 5:177335/146‑1 (MQ=255) cccTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGc > 3:87816/1‑132 (MQ=255) cccTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGc < 4:87816/132‑1 (MQ=255) cccTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAg > 2:114349/1‑149 (MQ=255) cTTCGCCGCTCAGCCCCTGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCgcgc < 8:356112/149‑1 (MQ=255) ttAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCgcgc > 1:251702/1‑148 (MQ=255) cGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATgg < 1:71344/149‑1 (MQ=255) gCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTTCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGtt > 7:320839/1‑149 (MQ=255) gCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGtt > 6:101005/1‑149 (MQ=255) aGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGc < 1:114349/147‑1 (MQ=255) ccAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAg > 4:11919/1‑149 (MQ=255) cAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATg < 4:346932/138‑1 (MQ=255) cAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATg > 3:346932/1‑138 (MQ=255) cAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGt < 5:57223/149‑1 (MQ=255) gAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTgg > 4:128709/1‑148 (MQ=255) tttGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATc > 8:57130/1‑148 (MQ=255) tGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGAACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCga < 8:150572/148‑1 (MQ=255) gTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATc > 2:222522/1‑145 (MQ=255) ggCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGt < 4:315920/149‑1 (MQ=255) gcGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACTGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCAGGCGCGCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTc < 1:324624/148‑1 (MQ=255) ccGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTc > 1:359270/1‑149 (MQ=255) cGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGt > 8:345137/1‑131 (MQ=255) cGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGt < 7:345137/131‑1 (MQ=255) gggTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCTCGATGTTCCa < 8:275753/149‑1 (MQ=255) gggTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCa < 2:279294/149‑1 (MQ=255) gggTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCa < 5:258404/149‑1 (MQ=255) gggTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCa < 5:188570/149‑1 (MQ=255) ttttCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGt > 8:90908/1‑127 (MQ=255) ttttCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGt < 7:90908/127‑1 (MQ=255) tctcGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCgcccgccc < 2:221542/149‑1 (MQ=255) gTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCt > 8:240954/1‑149 (MQ=255) gTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCt > 1:166203/1‑149 (MQ=255) aGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCttgttg < 3:128709/149‑1 (MQ=255) aGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCCGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCttgttg < 1:72476/149‑1 (MQ=255) gTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCgcccgccc < 1:101630/139‑1 (MQ=255) gTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCgcccgccc > 2:101630/1‑139 (MQ=255) gTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGa < 7:57130/149‑1 (MQ=255) aCGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCAGCACGCGCCCGTGAGCCGCTGCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGGCCAGCTTGTTGAg < 3:92571/148‑1 (MQ=255) cGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGGCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGa > 8:317882/1‑149 (MQ=255) gTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGt > 1:347548/1‑149 (MQ=255) aaCCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCa > 4:245157/1‑121 (MQ=255) aaCCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCa < 3:245157/121‑1 (MQ=255) aCCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCTCGATGTTCCa < 6:11304/120‑1 (MQ=255) cGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGaa > 4:216499/1‑148 (MQ=255) gCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGCACAGTGcccc > 8:16530/1‑149 (MQ=255) gCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGccc > 8:343247/1‑148 (MQ=255) aGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTgg > 3:91160/1‑149 (MQ=255) gcgcTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGc < 3:216499/149‑1 (MQ=255) gcgcTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGc < 1:43074/149‑1 (MQ=255) | TCTCAGGCCTTGAGGCCTGCGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCCCTGGC > NC_002947/5874578‑5874872 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |