New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 5874726 = | 68 (1.130) | 4 (0.070) | 4/256 | NT | 5.3% | coding (1445/1515 nt) | ilvA‑II | threonine deaminase |
? | NC_002947 | 5874768 = | 77 (1.330) | coding (1403/1515 nt) | ilvA‑II | threonine deaminase |
CCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCC‑CCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCAC > NC_002947/5874622‑5874915 | cccGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGcccc > 2:43074/1‑149 (MQ=255) cccGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGcccc > 2:72476/1‑149 (MQ=255) ccaggggcactgttcaacttcctcaacaagctgggcgggcgctggaacatctcgatgttccactaccgcaaccatggcgcggctgacgggcgcgtggtggcgggGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGcccc > 2:353949‑M1/105‑149 (MQ=255) ccGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCg > 7:343688/1‑149 (MQ=255) gCCATCAGCCCTAGCATAGCCGCTCAGCCCACGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTATCGTCCCAGTACGCGTAACCGATCTTCGCCAGCGCTGCCGGCACCAGTTTACGATCGTCCTACGG‑CACCTTCAGCCCCGCcaccacccc > 2:324624/1‑146 (MQ=255) ctccccccTAGCATAGCCGCGCAGCCCACGACCCGTTTGTAGGCCGCGCCTTCGCTCTCGGCCCAGTCCGGGTACCCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACCCGccc < 4:206123/144‑1 (MQ=255) tCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCg > 6:188570/1‑149 (MQ=255) aGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGTGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCgg < 7:244274/148‑2 (MQ=255) aGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGccc < 5:177335/146‑1 (MQ=255) aGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGccc > 6:177335/1‑146 (MQ=255) cccTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGc < 4:87816/132‑1 (MQ=255) cccTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGc > 3:87816/1‑132 (MQ=255) cccTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAg > 2:114349/1‑149 (MQ=255) cTTCGCCGCTCAGCCCCTGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCgcgc < 8:356112/149‑1 (MQ=255) ttAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCgcgc > 1:251702/1‑148 (MQ=255) cGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATgg < 1:71344/149‑1 (MQ=255) gCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTTCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGtt > 7:320839/1‑149 (MQ=255) gCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGtt > 6:101005/1‑149 (MQ=255) aGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGc < 1:114349/147‑1 (MQ=255) 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< 5:188570/149‑1 (MQ=255) gggTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCa < 2:279294/149‑1 (MQ=255) ttttCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGt < 7:90908/127‑1 (MQ=255) ttttCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGt > 8:90908/1‑127 (MQ=255) tctcGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCgcccgccc < 2:221542/149‑1 (MQ=255) gTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCt > 1:166203/1‑149 (MQ=255) 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tcctccGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCC‑CCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCAc < 4:91160/149‑1 (MQ=255) cctccGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCC‑CCTGGCCGCTCggg < 6:51057/130‑1 (MQ=255) cctccGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCC‑CCTGGCCGCTCggg > 5:51057/1‑130 (MQ=255) cctccGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCC‑CCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCAc > 5:157391/1‑148 (MQ=255) cctccGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCC‑CCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCAc > 7:1692/1‑148 (MQ=255) tccGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCC‑CCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCAt > 2:23146/1‑149 (MQ=255) ccGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCC‑CCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCAtt > 4:324522/1‑149 (MQ=255) cGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCCACCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCAtt < 1:61502/149‑1 (MQ=255) cGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCC‑CCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCAt < 4:194705/147‑1 (MQ=255) gg‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCC‑CCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTtc < 6:270171/149‑1 (MQ=255) gg‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCC‑CCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTtc < 8:320839/149‑1 (MQ=255) cCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCC‑CCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCAc > 1:297581‑M2/2‑149 (MQ=255) | CCCGCGAAAGGGCCATCAGCCCTAGCTTAGCCGCTCAGCCCAGGAACAGTTTGTAGGCCGGGTTTTCGGTCTCGTCCCAGTACGGGTAACCGATCTTGGCCAGCGCTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGG‑CACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTGCC‑CCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCAC > NC_002947/5874622‑5874915 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |