New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1812100 = | 55 (0.910) | 4 (0.070) | 4/258 | NT | 6.8% | coding (318/897 nt) | PP_1615 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 1812134 = | 57 (0.980) | coding (284/897 nt) | PP_1615 | LysR family transcriptional regulator |
ATGGCCAGGTCCATGCCTTCATGCAGCAGGTCGAGGGTGTGGTTGCTCAGCTCCACATCCACGCGCAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCGGCTTCGCTCAGGGTTACCCGGCGGGTGCTGCGATACAGCAGGCGCGTTTG > NC_002947/1811987‑1812282 | aTGGCCAGGTCCATGCCTTCATGCAGCAGGTCGAGGGTGTGGTTGCTCAGCTCCACATCCACGCGCAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGca > 7:137026/1‑148 (MQ=255) ccAGGTCCATGCCTTCATGCAGCAGGTCGAGGGTGTGGTTGCTCAGCTCCACATCCACGCGCAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAg > 6:162873/1‑149 (MQ=255) aGGTCCATGCCTTCATGCAGCAGGTCGAGGGTGTGGTTGCTCAGCTCCACATCCACGCGCAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGcc > 1:140671/1‑149 (MQ=255) gTCCATGCCTTCATGCAGCAGGTCGAGGGTGTGGTTGCTCAGCTCCACATCCACGCGCAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCt < 6:153921/149‑1 (MQ=255) tCCATGCCTTCATGCAGCAGGTCGAGGGTGTGGTTGCTCAGCTCCACATCCACGCGCAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCtt < 5:344970/149‑1 (MQ=255) cATGCCTTCATGCAGGAGGTCGAGGGGGTGGTTGCTCAGCTCCACATCCACGCGCAACTGCGGGTAGAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTg < 5:287152/148‑1 (MQ=255) cATGCCTTCATGCAGCAGGTCGAGGGTGTGGTTGCTCAGCTCCACATCCACGCGCAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTgg < 6:66672/149‑1 (MQ=255) cATGCCTTCATGCAGCAGGTCGAGGGTGTGGTTGCTCAGCTCCACATCCACGCGCAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTg < 2:140671/148‑1 (MQ=255) cATGCCTTCATGCAGCAGGTCGAGGGTGTGGTTGCTCAGCTCCACATCCACGCGCAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTg < 7:64810/148‑1 (MQ=255) aTGCCTTCATGCAGCAGGTCGAGGGTGTGGTTGCTCAGCTCCACATCCACGCGCAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTggg > 5:84211/1‑149 (MQ=255) ccgggcagaccttcctgcagcattgccaacgcttgcaggatggccgtgaggaagcgctgcgcgccatgggcgacctggccagcgaacccaagggcttgttGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGcaacaagcagatagg < 3:66997‑M1/48‑8 (MQ=255) ccgggcagaccttcctgcagcattgccaacgcttgcaggatggccgtgaggaagcgctgcgcgccatgggcgacctggccagcgaacccaagggcttgttGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAg > 4:66997‑M1/101‑140 (MQ=255) cTTCATGCAGCAGGTCGAGGGTGTGGTTGCTCAGCTCCACATCCACGCGCAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCg > 7:101586/1‑149 (MQ=255) cATGCAGCAGGTCGAGGGTGTGGTTGCTCAGCTCCACATCCACGCGCAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCt < 2:298131/148‑1 (MQ=255) cagcagGTCGAGGGTGTGGTTGCTCAGCTCCACATCCACGCGCAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGcc < 4:122707/148‑1 (MQ=255) cagcagGTCGAGGGTGTGGTTGCTCAGCTCCACATCCACGCGCAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGc > 1:29471/1‑147 (MQ=255) agcagGTCGAGGGTGTGGTTGCTCAGCTCCACATCCACGCGCAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAg > 2:242764/1‑149 (MQ=255) gcagGTCGAGGGTGTGGTTGCTCAGATCCACATACACGCGCAACTGCGCGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGCCCAgg > 5:101337/1‑149 (MQ=255) gTCGAGTGTGTGGTTGCTCAGCTCCACATCCACGCGCAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGc < 5:279518/149‑1 (MQ=255) gAGGGTGTGGTTGCTCAGCTCCACATCCACGCGCAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCa > 7:177550/1‑149 (MQ=255) gAGGGTGTGGTTGCTCAGCTCCACATCCACGCGCAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCa > 7:250102/1‑149 (MQ=255) gAGGGTGTGGTTGCTCAGCTCCACATCCACGCGCAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCa > 4:34701/1‑149 (MQ=255) ggTGTGGTTGCTCAGCTCCACATCCACGCGCAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGTGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATgg < 8:137026/149‑1 (MQ=255) gCTCAGCTCCACATCCACGCGCAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAgc < 5:162873/148‑1 (MQ=255) cTCCACATCCACGCGCAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCt > 7:318638/1‑149 (MQ=255) ccACATCCACGCGCAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCCTGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCa < 4:223862/149‑1 (MQ=255) caTCCACGCGCAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACgg < 1:242764/149‑1 (MQ=255) cACGCGCAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCa < 8:101586/148‑1 (MQ=255) cgcAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTg < 8:318638/149‑1 (MQ=255) cAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGc > 8:271731/1‑148 (MQ=255) tACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGc > 3:152354/1‑148 (MQ=255) cAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTGCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCaa < 6:377052/148‑1 (MQ=255) aGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAAtg > 5:42244/1‑149 (MQ=255) ccATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAAtgc‑tg > 3:151138/1‑148 (MQ=255) gcgTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGC‑AGCATTGCCAACGCTTGCAGGATggcc < 3:34701/149‑3 (MQ=255) cACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGcc > 3:328138/1‑149 (MQ=255) aCCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCt > 6:288515/1‑145 (MQ=255) aCCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCt < 5:288515/145‑1 (MQ=255) ccAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCg > 4:189622/1‑149 (MQ=255) cAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCgg > 4:161937/1‑149 (MQ=255) cAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCgg < 6:84211/149‑1 (MQ=255) cAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCgg > 6:345122/1‑149 (MQ=255) cctatctgcttgttgcgcatgacgtgtgcagtggcctacggcgagcgcAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCgg < 3:66997‑M2/100‑1 (MQ=255) gATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCGGCTTCGCTCa < 1:340231/149‑1 (MQ=255) gATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCGGCTTCGCTCa < 2:29471/149‑1 (MQ=255) cttgttgcgcatgacgtgtgcagtggcctacggcgagcgcAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCgg > 4:66997‑M2/41‑140 (MQ=255) tGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCGGCTTCGCTCAgg < 3:161937/149‑1 (MQ=255) aaGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCGGCTTCGCTCAggg < 4:328138/148‑1 (MQ=255) aGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCGGCTTCGCTCAGGGt > 6:37813/1‑148 (MQ=255) aGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCGGCTTCGCTCAGGGt > 1:39496/1‑148 (MQ=255) GCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCGGCTTCGCTCAGGGTTAcc > 6:126075‑M1/1‑149 (MQ=255) atgacgtgtgcagtggcctacggcgagcgcAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGgcg < 5:380187‑M2/39‑1 (MQ=255) atgacgtgtgcagtggcctacggcgagcgcAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGgcg > 6:380187‑M2/31‑69 (MQ=255) cGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCGGCTTCGCTCAGGGTTACCcggcgg < 8:250102/149‑1 (MQ=255) cGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCGGCTTCGCTCAGGGTTACCcggcgg < 8:12640/149‑1 (MQ=255) gTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAATCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCGGCTTCGCTCAGGGTTACCCGGCtgg < 6:101337/149‑1 (MQ=255) gTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCGGCTTCGCTCAGGGTTACCCGGCggg < 5:345122/149‑1 (MQ=255) gCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCGGCTTCGCTCAGGGTTACCCGGCGGGtgct < 4:151138/149‑1 (MQ=255) gCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGATGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCACGGCTTCGCTCAGGGTTACCCGGCGGGtgct > 2:161695/1‑149 (MQ=255) cACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCGGCTTCGCTCAgg < 6:153904/130‑1 (MQ=255) cACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCGGCTTCGCTCAgg > 5:153904/1‑130 (MQ=255) aCTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCGGCTTCGCTCAGGGTTACCCGGCGGGtgctgc > 2:192034/1‑148 (MQ=255) cTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCGGCTTCGCTCAGGGTTACCCGTCGGGTGCTGCGa < 4:152354/149‑1 (MQ=255) cacaCGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCGGCTTCGCTCAGGGTTACCCGGCGGGTGCTGCGATa < 5:287274/148‑1 (MQ=255) acGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCGGCTTCGCTCAGGGTTACCCGGCGGGTGCTGCGATAcag > 6:251744/1‑148 (MQ=255) tGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCGGCTTCGCTCAGGGTTACCCGGCGGGTGCTGCGATACAGCAGgcgc > 4:111631/1‑149 (MQ=255) aacaaGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCGGCTTCGCTCAGGGTTACCCGGCGGGTGCTGCGATACAGCAGGCGCGTTTg > 7:66157/1‑149 (MQ=255) | ATGGCCAGGTCCATGCCTTCATGCAGCAGGTCGAGGGTGTGGTTGCTCAGCTCCACATCCACGCGCAACTGCGGGTACAGCGCCATGAATCGCGTCACCAGCGGCACGATGAAGCGCTCGCCGTAGGCCACTGCACACGTCATGCGCAACAAGCCCTTGGGTTCGCTGGCCAGGTCGCCCATGGCGCGCAGCGCTTCCTCACGGCCATCCTGCAAGCGTTGGCAATGC‑TGCAGGAAGGTCTGCCCGGCTTCGCTCAGGGTTACCCGGCGGGTGCTGCGATACAGCAGGCGCGTTTG > NC_002947/1811987‑1812282 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |