New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2143021 = | 69 (1.150) | 4 (0.070) | 4/256 | NT | 5.7% | coding (472/675 nt) | PP_1898 | MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein |
? | NC_002947 | 2143071 = | 65 (1.120) | coding (522/675 nt) | PP_1898 | MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein |
CCATCGCCGCCATGGCGCCTCTGCTGGGTCTGCTGGGCACCGTGCTAGGCATGATCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCAGGAGGCGATCAAGCTGGTGGAAGTGATCCAGGGTGACCGTGAAGTGGAAGTGGCCGGAGG > NC_002947/2142923‑2143214 | ccATCGCCGCCATGGCGCCTCTGCTGGGTCTGCTGGGCACCGTGCTAGGCATGATCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCt < 5:172090/149‑1 (MQ=255) tCGCCGCCATGGCGCCTCTGCTGGGTCTGCTGGGCACCGTGCTAGGCATGATCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGc < 6:221574/149‑1 (MQ=255) tCGCCGCCATGGCGCCTCTGCTGGGTCTGCTGGGCACCGTGCTAGGCATGATCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGc < 3:212743/149‑1 (MQ=255) cttgatcgcctcctgctccatgccgatcaccagttcatcgatgcggcgcagcaggaaacggtggaagaacactgccggaataccgaccatcaggccaGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTg > 1:131798‑M1/98‑149 (MQ=255) tcgcctcctgctccatgccgatcaccagttcatcgatgcggcgcagcaggaaacggtggaagaacactgccggaataccgaccatcaggccaGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCt < 3:107630‑M1/51‑1 (MQ=255) tcgcctcctgctccatgccgatcaccagttcatcgatgcggcgcagcaggaaacggtggaagaacactgccggaataccgaccatcaggccaGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCt > 4:107630‑M1/93‑143 (MQ=255) gccATGGCGCCTCTGCTGGGTCTGCTGGGCACCGTGCTAGGCATGATCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCT‑CAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATg < 2:58878/149‑1 (MQ=255) gcgcCTCTGCTGGGTCTGCTGGGCACCGTGCTAGGCATGATCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTCGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCgg > 1:306704/1‑149 (MQ=255) ctctGCTGGGTCTGCTGGGCACCGTGCTAGGCATGATCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTAtt < 4:290220/149‑1 (MQ=255) tgctgggtctgctgggCACCGTGCTAGGCATGATCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCg > 6:298970/1‑149 (MQ=255) ctgggtctgctgggCACCGTGCTAGGCATGATCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGc < 3:186195/149‑1 (MQ=255) tgggtctgctgggCACCGTGCTAGGCATGATCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCgg > 6:44697/1‑147 (MQ=255) gggggctgctgggCACCGTGCTAGGCATGATCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCa < 4:90863/148‑1 (MQ=255) ggtctgctgggCACCGTGCTAGGCATGATCGACATTTTCATCGCCCCTATTTGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCa < 1:311816/149‑1 (MQ=255) ggtctgctgggCACCGTGCTAGGCATGATCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCa < 2:21053/147‑1 (MQ=255) gtctgctgggCACCGTGCTAGGCATGATCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAgtg < 3:225645/149‑1 (MQ=255) tctgctgggCACCGTGCTAGGCATGATCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAgtgt > 4:294526/1‑149 (MQ=255) cttggCACCGTGCTAGGCATGATCGACTTTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCATATGACCGCCAACTCCGACGTGCTGGCCTGTGGTTTCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGTCCTGTTGGTCGGTATTCCGGCAGTGttctt < 5:243449/146‑1 (MQ=255) ggCACCGTGCTAGGCATGATCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGttcttc < 2:370439/147‑1 (MQ=255) ggCACCGTGCTAGGCATGATCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGttcttc < 7:153360/147‑1 (MQ=255) ggCACCGTGCTAGGCATGATCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCa < 5:298970/149‑1 (MQ=255) aCCGTGCTAGGCATGATCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCg > 4:165010/1‑149 (MQ=255) cGTGCTAGGCATGATCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGtt < 6:77558/149‑1 (MQ=255) tGCTAGGCATGATCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTc < 2:306704/149‑1 (MQ=255) ggCATGATCGACATTTTCA‑‑GGGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCctg < 3:55347/147‑1 (MQ=255) gCATGATCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCctgctg > 6:211385/1‑149 (MQ=255) gCATGATCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCctgctg > 8:243416/1‑149 (MQ=255) cATGATCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCtgctgc < 6:74539/149‑1 (MQ=255) cATGATCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCtgctgc > 4:137537/1‑149 (MQ=255) aTGATCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTgcg > 1:313200/1‑149 (MQ=255) tCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTg > 4:85467/1‑101 (MQ=255) tCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTg < 3:85467/101‑1 (MQ=255) tCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGcgccg > 8:87006/1‑148 (MQ=255) tCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGcgccg > 3:251918/1‑148 (MQ=255) aCATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTcc < 5:354603/135‑1 (MQ=255) aCATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTcc > 6:354603/1‑135 (MQ=255) aCATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATc > 6:57754/1‑149 (MQ=255) aCATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATc > 1:45565/1‑149 (MQ=255) aTTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGa < 5:44697/149‑1 (MQ=255) aTTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGa > 7:274504/1‑149 (MQ=255) ttttCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGAt < 4:251918/149‑1 (MQ=255) ttttCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGAt < 7:243416/149‑1 (MQ=255) ttCC‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGGGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATg < 8:341787/148‑1 (MQ=255) cgcCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTgg < 3:294526/149‑1 (MQ=255) cgcCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTgg < 7:87006/149‑1 (MQ=255) gcCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGt > 3:69419/1‑149 (MQ=255) aTGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCgg > 6:5504/1‑149 (MQ=255) aTGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCg < 3:165010/148‑1 (MQ=255) gCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAg < 6:187656/148‑1 (MQ=255) cAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAg > 5:139570/1‑147 (MQ=255) aGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCag < 2:257625/149‑1 (MQ=255) gATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCagg < 5:211385/149‑1 (MQ=255) ccGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCAGGAGGc > 1:219397/1‑148 (MQ=255) cGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCAGGAGGCGa > 4:235912/1‑149 (MQ=255) cagccgcagtggtgaccagggccttggagataccactggccagcacggcggcTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCAGGAGGCGATCAAg > 1:131798‑M2/53‑149 (MQ=255) agccgcagtggtgaccagggccttggagataccactggccagcacggcggcTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCAGGAGGCGa > 4:107630‑M2/52‑143 (MQ=255) agccgcagtggtgaccagggccttggagataccactggccagcacggcggcTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCAGGAGGCGa < 3:107630‑M2/92‑1 (MQ=255) CCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCAGGAGGCGATCAAGCtggtg > 5:163333‑M1/1‑149 (MQ=255) cgTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCAGGAGGCGATCAAGCtggtg > 8:739/1‑148 (MQ=255) gTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCAGGAGGCGATCAAGCTGGTGGa < 7:739/149‑1 (MQ=255) tGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCAGGAGGCGATCAAGCTGGTGGaa < 5:57754/149‑1 (MQ=255) gCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCAGGAGGCGATCAAGCTGGTGGAAGTGAt > 1:138019/1‑149 (MQ=255) gCCAGTGGTATCTCCAAGGCACTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCCCCGTTTCATGCTGCTCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCAGTAGGCGATCAAGATGGTGGAAGTGAt > 6:244095/1‑149 (MQ=255) tGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCAGGAGGCGATCAAGCTGGTGGAAGTGATCCAgg < 2:219397/149‑1 (MQ=255) tcCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCa < 5:313206/110‑1 (MQ=255) tcCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCa > 6:313206/1‑110 (MQ=255) tcCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCAGGAGGCGATCAAGCTGGTGGAAGTGATCCAGGGTGACCg > 8:342467/1‑149 (MQ=255) tcCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCAGGAGGCGATCAAGCTGGTGGAAGTGATCCAGGGTGACCg > 4:74645/1‑149 (MQ=255) cAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCAGGAGGCGATCAAGCTGGTGGAAGTGATCCAGGGTGACCGTg < 3:137537/149‑1 (MQ=255) taccactggccagcacggcggcTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCAGGAGGCGATCAAGCTGGTGGAAGTGATCCAGGGTGACCGTgaa < 2:131798‑M2/127‑1 (MQ=255) aGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCAGGAGGCGATCAAGCTGGTGGAAGTGATCCAGGGTGACCGTgaa < 3:235912/149‑1 (MQ=255) gCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCAGGAGGCGATCAAGCTGGTGGAAGTGATCCAGGGTGACCGTgaagt < 7:342467/149‑1 (MQ=255) ccTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCAGGAGGCGATCAAGCTGGTGGAAGTGATCCAGGGTGACCGTgaagtg > 7:294676/1‑148 (MQ=255) ggTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGa < 5:109440/75‑1 (MQ=255) ggTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGa > 6:109440/1‑75 (MQ=255) accacTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCaggagg > 4:252589/1‑100 (MQ=255) ccacTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCAGGAGGCGATCAAGCTGGTGGAAGTGATCCAGGGTGACCGTGAAGTGGAAGTGGcc > 2:98059/1‑149 (MQ=255) cggcTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCAGGAGGCGATCAAGCTGGTGGAAGTGATCCAGGGTGAGCGTGAAGTGGAAGTGGCCGGAgg < 2:313200‑M2/144‑1 (MQ=255) cggcTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCAGGAGGCGATCAAGCTGGTGGAAGTGATCCAGGGTGACCGTGAAGTGGAAGTGGCCGGAgg < 2:45565‑M2/144‑1 (MQ=255) cggcTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCAGGAGGCGATCAAGCTGGTGGAAGTGATCCAGGGTGACCGTGAAGTGGAAGTGGCCGGAg < 1:98059‑M2/143‑1 (MQ=255) cggcTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCATCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACGGGTGATCGGCATGGAGCAGGAGGCGAGCAAGCTGGTGGAAGTGATCCAGGGTGACCGTGAAGTGGAAGTGGCCGGAg < 3:117181‑M2/143‑1 (MQ=255) | CCATCGCCGCCATGGCGCCTCTGCTGGGTCTGCTGGGCACCGTGCTAGGCATGATCGACATTTTCA‑‑GCGCCTTCATGGGCTCGCAGATGACCGCCAACGCCGCCGTGCTGGCCAGTGGTATCTCCAAGGCCCTGGTCACCACTGCGGCTGGCCTGATGGTCGGTATTCCGGCAGTGTTCTTCCACCGTTTCCTGCTGCGCCGCATCGATGAACTGGTGATCGGCATGGAGCAGGAGGCGATCAAGCTGGTGGAAGTGATCCAGGGTGACCGTGAAGTGGAAGTGGCCGGAGG > NC_002947/2142923‑2143214 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |