New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3830125 | 35 (0.580) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 7.1% | coding (1255/1785 nt) | PP_3383 | gluconate 2‑dehydrogenase flavoprotein subunit |
? | NC_002947 | = 3830165 | 46 (0.820) | coding (1215/1785 nt) | PP_3383 | gluconate 2‑dehydrogenase flavoprotein subunit |
CAGGTAATTGCCACGGTAGGACTGGTGTGCGCCGTGGGCGTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCGAAGA > NC_002947/3830021‑3830307 | cAGGTAATTGCCACGGTAGGACTGGTGTGCGCCGTGGGCGTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGccgg > 2:351434‑M2/1‑145 (MQ=255) aGGTAATTGCCACGGTAGGACTGGTGTGCGCCGTGGGCGTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGccggc > 4:174221‑M2/1‑144 (MQ=255) aGGTAATTGCCACGGTAGGACTGGTGTGCGCCGTGGGCGTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGccggc < 7:318707‑M2/149‑6 (MQ=255) gTAATTGCCACGGTAGGACTGGTGTGCGCCGTGGGCGTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGccggcct < 5:212350‑M2/149‑8 (MQ=255) cACGGTAGGACTGGTGTGCGCCGTGGGCGTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCAcc < 2:332599/149‑1 (MQ=255) aCGGTAGGACTGGTGTGCGCCGTGGGCGTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCAcc > 3:151773/1‑148 (MQ=255) ggACTGGTGTGCGCCGTGGGCGTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTg < 6:197551/149‑1 (MQ=255) tgtgCGCCGTGGGCGTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAc‑c < 8:318707/149‑1 (MQ=255) cgcCGTGGGCGTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACAGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAc‑cgcc > 6:327040/1‑148 (MQ=255) ccGTGGGCGTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCcgac < 4:150863/149‑1 (MQ=255) gTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGt > 4:340717/1‑149 (MQ=255) tggtggGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTc > 6:191011/1‑149 (MQ=255) ggtgggtgTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTc > 5:48655/1‑148 (MQ=255) ggtgTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGt > 7:129582/1‑149 (MQ=255) tCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGtt > 8:194242/1‑149 (MQ=255) cGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGtt < 4:151773/148‑1 (MQ=255) gCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTTCCCGGCGGGTTGGTGGTTACGGCAATAGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCCCATTTGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAACTTGTAGGCCTTGa > 1:45794/1‑148 (MQ=255) gCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGaa < 1:265255/149‑1 (MQ=255) ccGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGaaa < 5:191011/149‑1 (MQ=255) ggCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCTGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAGAtcgt > 4:353166/1‑149 (MQ=255) cTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAAtcgtc > 1:31155/1‑148 (MQ=255) tcttcCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGa < 6:48655/147‑1 (MQ=255) ccAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCaa > 3:323379/1‑149 (MQ=255) gCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGc > 6:89516/1‑148 (MQ=255) ccccAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTg < 6:212350/147‑1 (MQ=255) cccAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGccggcctggggcagtgcctggaagaaagccacggccgactactacacccaccaggtgtcgatggacgcccacggcgcacaccagtcctaccgtggcaat < 5:347408‑M2/149‑100 (MQ=255) ccAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCAc < 4:323379/149‑1 (MQ=255) cAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGccggcctggggcagtgcctggaagaaagccacggccgactactacacccaccaggtgtcgatggacgcccacggcgcacaccagtcctaccgtggcaatta < 3:93245‑M2/149‑102 (MQ=255) ggCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGccggcctggggcagtgcctggaagaaagccacggccgactactacacccaccaggtgtcgatggacgcccacggcgcacaccagtcctaccgtggcaattacc < 5:63688‑M2/149‑104 (MQ=255) gcaGTGCCTGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGcc < 4:214163/147‑1 (MQ=255) cccTGCGGGGTTGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGACATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGaa < 5:380416/149‑1 (MQ=255) cccGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATg > 7:45265/1‑147 (MQ=255) ccGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAg < 3:340717/149‑1 (MQ=255) gcggGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAgttg > 5:28391/1‑149 (MQ=255) ggTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGttgttg < 1:148690/149‑1 (MQ=255) ggTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCATCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGttgttg < 8:129582/149‑1 (MQ=255) ttGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGgt > 8:78171/1‑149 (MQ=255) ttGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGAGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAgttgtt > 6:139157/1‑146 (MQ=255) ttGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGAGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAgttgtt < 5:139157/146‑1 (MQ=255) ttGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCAACATTGGAGAACGGGCCGACGAAGCCTTCCGGGCCATGGGCGAAGTGGACGGCGTGGAAATCTTCCATGGCAATCCCATTGCCACCCGCCCCCTTGAAGTGGTTgg > 1:289112/1‑149 (MQ=255) tGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGgtg > 3:366035/1‑149 (MQ=255) ggAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGgtg < 5:206791/148‑1 (MQ=255) gAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGgtg > 4:366899/1‑147 (MQ=255) aGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAg < 7:78171/149‑1 (MQ=255) gTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGgt > 7:71435/1‑149 (MQ=255) aCCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGaa > 4:264316/1‑57 (MQ=255) aCCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGaa < 3:264316/57‑1 (MQ=255) cGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTgg < 8:76178/138‑1 (MQ=255) cGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTgg > 7:76178/1‑138 (MQ=255) ggCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCt > 4:318783/1‑149 (MQ=255) gCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCGtt > 4:61577/1‑149 (MQ=255) aTCCGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATCGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTc < 4:40294/149‑1 (MQ=255) ccggcTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCTAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGTCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTTGTGTAGGTGTCCTTGTCgaaga < 5:327040/149‑1 (MQ=255) ggcTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAgttgt > 1:351985/1‑123 (MQ=255) ggcTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAgttgt < 2:351985/123‑1 (MQ=255) gcTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGt > 6:351355/1‑140 (MQ=255) gcTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGt < 5:351355/140‑1 (MQ=255) | CAGGTAATTGCCACGGTAGGACTGGTGTGCGCCGTGGGCGTCCATCGACACCTGGTGGGTGTAGTAGTCGGCCGTGGCTTTCTTCCAGGCACTGCCCCAGGCCGGAGTGCCCGGCGGGTTGGAGGTACCGGCAATCGGCCGGCTGCCGGCCTGGTTCACCCACATTGGCGAAC‑CGCCGACGAAGCCGTGCGGGCCATGGTCGAAGTTGTCGGCGTTGAAATCGTCGATGGCAATGCCATTGCCACCCGCGCCGATGAAGTTGTTGGTGTAGGTGTCCTTGTCGAAGA > NC_002947/3830021‑3830307 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |