New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4957290 = | 75 (1.250) | 4 (0.070) | 4/258 | NT | 5.2% | coding (228/792 nt) | fliH | flagellar assembly protein FliH |
? | NC_002947 | 4957335 = | 72 (1.230) | coding (183/792 nt) | fliH | flagellar assembly protein FliH |
ATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGA > NC_002947/4957189‑4957483 | aTCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAg > 3:33110/1‑149 (MQ=255) tCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAgg < 4:33110/149‑1 (MQ=255) cgacccggaaccggagcccgaaccggagcctgagcctgagcccgaggtcatcgaggaagtcgaggaagtgccgctggaagaagtccagccgttgaccctgGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAg > 1:317753‑M1/101‑148 (MQ=255) aGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCTAGCTCTTCCAggg < 8:26136/148‑1 (MQ=255) ccGCGCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCa < 4:285591/149‑1 (MQ=255) gCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAAc < 2:130113/149‑1 (MQ=255) cggaaccggagcccgaaccggagcctgagcctgagcccgaggtcatcgaggaagtcgaggaagtgccgctggaagaagtccagccgttgaccctgGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAgg > 4:230391‑M1/96‑144 (MQ=255) cggaaccggagcccgaaccggagcctgagcctgagcccgaggtcatcgaggaagtcgaggaagtgccgctggaagaagtccagccgttgaccctgGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAgg < 3:230391‑M1/49‑1 (MQ=255) gAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACgg > 8:9101/1‑147 (MQ=255) gAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACgg < 7:9101/147‑1 (MQ=255) aGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTg < 5:199122/149‑1 (MQ=255) gCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGa > 4:214955/1‑149 (MQ=255) cTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGAc < 2:191748/149‑1 (MQ=255) cTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGAc > 2:77340/1‑149 (MQ=255) tGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACgg > 4:24884/1‑142 (MQ=255) tGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACgg < 3:24884/142‑1 (MQ=255) aGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACttcttc < 6:130933/149‑1 (MQ=255) gTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACttcttc > 8:135201/1‑148 (MQ=255) tttGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGGTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACttcttc > 1:259139/1‑147 (MQ=255) gTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCgg > 5:187609/1‑149 (MQ=255) aGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTTGGAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCactt > 1:28120/1‑149 (MQ=255) aGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCacttc > 2:177860/1‑149 (MQ=255) ggCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCacttcct > 8:83190/1‑149 (MQ=255) gCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCacttcctc < 3:219316/149‑1 (MQ=255) gCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCacttcctc < 2:28120/149‑1 (MQ=255) gCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTAGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCacttcctc < 2:35139/149‑1 (MQ=255) ttCGGCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCacttcctcgactt > 1:369803/1‑149 (MQ=255) gCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCacttcctcgac < 3:131768/143‑1 (MQ=255) gCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCacttcctcgac > 4:131768/1‑143 (MQ=255) ctGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGAt < 2:369803/147‑1 (MQ=255) ctGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGa > 3:152918/1‑149 (MQ=255) ctGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGa > 3:261266/1‑149 (MQ=255) gAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCg > 1:299547/1‑149 (MQ=255) aaCCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCgg < 3:214955/149‑1 (MQ=255) cTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑AAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGggct > 6:145580/1‑149 (MQ=255) gAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGggctcag > 1:26720/1‑149 (MQ=255) gAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGggctca < 7:83190/148‑1 (MQ=255) gAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGggctca < 4:152918/148‑1 (MQ=255) gCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGggctcaggc < 1:177860/149‑1 (MQ=255) gTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGctcaggctcagg < 6:38240/149‑1 (MQ=255) cTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTcaggctcaggct < 2:259139/148‑1 (MQ=255) tgtgGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTcc > 1:145162/1‑149 (MQ=255) tgGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCgg > 7:261426/1‑149 (MQ=255) ggAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTCCACAGTAAAACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCaggctcaggctcag > 1:307920/1‑147 (MQ=255) gAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGtt > 7:185166/1‑149 (MQ=255) aGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCg < 1:152607/149‑1 (MQ=255) aGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCg > 6:326403/1‑149 (MQ=255) aGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGACTCAGGCTCCGGTTCg < 2:145162/149‑1 (MQ=255) aGCCCGCGCGCTCACCGGTGTCGAATCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCg < 2:98698/149‑1 (MQ=255) ccTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTACGGTTCGGGc > 5:96797/1‑149 (MQ=255) ccTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGACCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCGCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCggg > 8:175996/1‑148 (MQ=255) cTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCt > 4:159577/1‑149 (MQ=255) cTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCt > 3:323079/1‑149 (MQ=255) gcgcTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTcc < 4:261266/148‑1 (MQ=255) cgcTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACTGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCg‑g < 6:182656/149‑1 (MQ=255) cgcTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCg‑g > 5:142120/1‑149 (MQ=255) gcTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑Gt < 4:323079/149‑1 (MQ=255) cctggaagagctcgaagccatccgtcaggaggcttacaacgagggcttcCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCg < 3:230391‑M2/95‑1 (MQ=255) cctggaagagctcgaagccatccgtcaggaggcttacaacgagggcttcCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCg > 4:230391‑M2/50‑144 (MQ=255) ctggaagagctcgaagccatccgtcaggaggcttacaacgagggcttcCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCg > 1:317753‑M2/49‑148 (MQ=255) gCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCg > 3:324516/1‑147 (MQ=255) AAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCt < 7:227093‑M1/149‑1 (MQ=255) GCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTg > 5:145580‑M1/1‑149 (MQ=255) ccTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGAGTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTgg > 5:384821/1‑148 (MQ=255) cTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGaa < 6:152221/141‑1 (MQ=255) cTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGaa > 5:152221/1‑141 (MQ=255) cTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTgg > 7:50724/1‑147 (MQ=255) cTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTGGCa < 8:14008/149‑1 (MQ=255) gTTGTAAGCCTCCTGACGGAGGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGc < 8:261426/148‑1 (MQ=255) aaGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCca > 3:160950/1‑148 (MQ=255) aGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCcac < 4:324516/148‑1 (MQ=255) cctcctGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGGCTTCGGCTGGACTTCTTC‑‑GAGCGGCACTTCCTCGTCTTCCTATATGACGTCGGGCTCTGGCTCATGCTCCGTTTCGTGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCcacat < 4:160950/148‑2 (MQ=255) tcctGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTg < 7:283974/133‑1 (MQ=255) tcctGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATc > 1:195253/1‑149 (MQ=255) ctGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCa > 6:330841/1‑149 (MQ=255) tGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGCCCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATcccc > 4:191834/1‑147 (MQ=255) gACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCCCg > 6:326864/1‑149 (MQ=255) ggATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGGTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGccc > 5:313655/1‑149 (MQ=255) gCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCGCGTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCg < 1:77340/148‑1 (MQ=255) gCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAg < 6:313655/149‑1 (MQ=255) acaacgagggcttcCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGa < 2:317753‑M2/134‑1 (MQ=255) ttCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGt > 6:58090/1‑149 (MQ=255) ttCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGt > 4:363120/1‑149 (MQ=255) cGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGTc < 8:227093/148‑1 (MQ=255) gAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGTcgc > 6:369373/1‑149 (MQ=255) gCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGTCGCgg > 6:290228/1‑149 (MQ=255) gCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGTCGCgg < 8:235084/149‑1 (MQ=255) ttcCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACGCATCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCAc > 6:25253‑M2/4‑149 (MQ=255) cCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCa < 5:369373‑M2/145‑1 (MQ=255) cCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACg > 7:251669‑M2/2‑148 (MQ=255) cAGGGTCACCGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCACGACTTCCTCGATCACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGCTTCGGGCTCCG‑CTTCCGGGTACAAGCTTGGCAGCGTCAACACATCCACGACATCGAGGTAGCCGGCACGGa > 8:139258/1‑149 (MQ=255) cAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGCCCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGa > 5:98666/1‑149 (MQ=255) | ATCAGCCGCTCGAGGCTGTCGAGTTTGGTTTTCAGGGCCTCTTCGGCCTCCTGGCGAACCTT‑GAGCTGGGTGCTGTGGAAGCCCTCGCGCTCACCGGTTGCGAAGCCCTCGTTGTAAGCCTCCTGACGGATGGCTTCGAGCTCTTCCAGGGTCAACGGCTGGACTTCTTC‑‑CAGCGGCACTTCCTCGACTTCCTCGATGACCTCGGGCTCAGGCTCAGGCTCCGGTTCGGGCTCCG‑GTTCCGGGTCGAAGCTTGGCAGCGTCCACACATCCACGCCCTCGAGGTCGCGGGCACGGA > NC_002947/4957189‑4957483 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |